中医是一门研究人体能量的医学，而西医是研究人体本身的医学，虽然两者之间互相影响，但两者的理论不同。因此，试图从一方理解另一方，就好比鸡同鸭讲，两者的出发点不同，肯定是讲不到一块去的。
学习中医，首先要有一个假设，就是在人体这个肉体的基础模型上，还有一层能量的模型。这个模型，我们假设就是“灵魂”。人体的控制中枢是大脑，而灵魂的控制中枢是心。注意哦，这个心不是心脏，而是心情的“心”。
身体与灵魂，通过一层“膜”来连接，这层膜就是三焦膜。三焦膜上布满了经脉，也包括三焦脉本身。经脉遍布全身，并且影响经脉经过的身体。经脉中的穴位，相当于能量在经脉中运行的基站或者坐标。而在灵魂的能量系统中，由于不存在着真实的肉体，因此中医的体系提出了中医的五脏六腑，对应着肉体系统中的五脏六腑及其他的部分。
在肉体上，其实也有一整套维持肉体运作的能量，通过消化系统及血液循环系统从外界获取能量并排泄代谢废物，并通过肺及血液循环系统与外界交换气体。这个是灵魂系统存在的基础。如果肉体完蛋了，灵魂也会魂飞魄散。西医对于维持肉体的运作有非常细致的研究，并且有很多技术支撑体系进行支撑。因此，对于非疾病的伤害，例如人体的外伤有着比中医强很多的地方。另外，对于危急病人的抢救，可以通过呼吸机、输血等手段进行紧急干预。
如果把人体比喻成一台计算机的话，肉体相当于硬件（主要是外设），而能量体当于核心硬件及的上面的操作系统及外设子系统上的ROM，灵魂相当于主应用软件。硬件外设的能量，主要是直接从电源接出提供到到外设的能量；而软件的能量，则是在主板提供到内存/CPU等上面更精细的能量。
操作系统有多个子模块，对应于各条经络。每个子模块控制对应的硬件系统。如脾经，对应硬件的吸收转化系统，胃经对应消化通道系统等。而一气周流，则是这个核心系统能量在核心系统中流动的电压。以土为地平线，则土为0V，木为+2.5V，火为+5V，金为-2.5V，水位-5V。
医学存在的一个前提，是由于这台计算机比较高级，硬件具备自修复能力，所以硬件坏了，不需要更换零件，而是将损坏的原因找到并消失，一般情况下硬件会自我修复。
西医的体系，已经能精确的分析到各种外设的各种症状，并且做了各种支撑工具来进行修理，相当于硬件维修工。例如，消化子系统的损坏，西医观察到可能是胃酸过高，造成对消化子系统的腐蚀，可以采用各种药物来降低胃酸，缓解腐蚀，等待消化系统自己恢复。
而中医的体系，则更注重软件的修复，通过操作系统软件来控制子系统的ROM，来控制相应的硬件。同样也是先把ROM修正，等待硬件自我修复。相当于中医可以通过外挂程序，甚至修改代码来修复软件，从而修复硬件。因此中医相当于软件维修工。
硬件维修工，一般需要各种工具，大到各种X光，小到电压表，以及各种电焊、切割工具。软件维修工，主要是要有操作系统模块图等知识性的工具，以及各种外挂程序的源代码。
而系统的损坏，如果是外伤，这个通过相应的硬件维修效果最好。细菌感染，相当于硬件中发霉了，这个可以通过除霉剂（抗生素）来解决，具有不需辩证，具有直接的效果。血压高，一般可以通过扩展血管来解决。血糖高，可以通过降低血糖来解决。甚至是小孩咳嗽，痰不容易咳出，还可以加快肺部鞭毛的摆动来协助排痰。
但是对于病毒，这个就比较困难了。病毒相当于一段代码，直接进入操作系统或者ROM中（假设是可擦写的EPROM）。对于某些细胞的控制代码发疯，变成不受控制的生长，这个就比较难办。但是软件对于除病毒就可以有专门的专杀工具了。《伤寒论》，列出了114个专杀工具，只要病机正确（病毒特征码匹配），具有非常强的作用。例如可以20分钟就治好感冒。
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