(一) Prayaya V3
V3的工作原理是，在系统中创建一个虚拟的操作系统环境，并将V3安装目录下的路径映射成为该环境的系统路径(如将 E:\PrayayaV3\Software\WINDOWS映射成为虚拟环境下的C:\Winodws )。这样，在该环境下用户安装、使用软件所产生的数据，都将被保存到V3的安装目录下对应的路径中，而对本机系统没有影响。
(二) 云端软件平台
云端的工作原理是将事先分离出来的软件数据通过虚拟化的环境投影(映射)到系统中运行，这样既保持了软件的原貌，又能够达到将软件与系统安全隔离的目的。
软件数据，是将原软件通过虚拟化处理之后的所得到的文件和注册表项集合。
软件数据储存在云端的缓存(CloudCache)中，它仅在用户激活该软件后投影到系统中，此时系统将会把投影过来的软件数据当做系统中真实存在的数据进行处理，但实际上这些数据并不占用投影位置的物理空间。
从工作原理上来看，云端和V3都运用了虚拟化技术，但侧重点有所不同。
可以这样说，V3所创建的虚拟环境是一个大的容器，在V3上安装的软件都包含在这一个容器中运行;而云端则是为每一个软件都创建了一个小的容器，其自身则起到了一个桥梁的作用，将无数个小容器联接到系统中，就构成了云端的使用环境。相对而言，云端所采用的方式更为灵活多变一些，其功能形式也会更加丰富一些。
二、 对系统的影响
(一) Prayaya V3
“当我们在本机(非系统盘)上安装V3并且把常用软件装进V3，那些软件所有的安装和使用记录文件全部自动保存在V3虚拟系统里面，让我们的windows系统彻底解放出来，不用担心系统的臃肿老化，免去了总是要进行系统备份、优化、清理的烦恼。”
——V3官方介绍
(二) 云端软件平台
云端提供的虚拟化环境，极大的避免了软件安装使用和软件安装过多带来的操作系统出错、系统运行缓慢等，有效去除了软件卸载不干净而残留的注册表、dll文件等系统垃圾。降低了重装系统的频率，保护系统的干净、稳定。各种软件想装就装，不再怕系统被拖慢、污染。
隐藏与激活是系统与软件之间的阀门。隐藏的软件会被撤出虚拟环境，该软件各虚拟位置(如C:\Program Files下的安装目录、注册表等)将从系统中消失，保持虚拟环境和系统的高效率工作，和系统环境的清洁。软件激活时，将被装载入虚拟环境，保持与系统良好的关联。
——云端官方介绍
在前面的原理中，我们已经提到过，V3的虚拟环境就像一个大容器，在V3中安装的软件都运行在这个容器中。因此，从理论上而言，V3的虚拟环境和本机系统环境是相对隔绝的，在V3系统中运行任何软件都不会对本机系统造成影响，就算产生了垃圾信息，也只会存在于虚拟环境中，不会对本机系统造成污染。
但从另一个角度来看，V3虽然做到了对本机系统“无污染”，但V3的虚拟环境本身却难以幸免。使用时间一长，虚拟环境仍然会出现被垃圾信息影响的症状，如运行效率低下、容易出现系统错误等问题。
云端的方式则较为巧妙，它针对每一个软件都创建了一个容器，再将这些容器与系统联接起来，这样每个软件在运行时所产生的垃圾信息，只会存在于该软件的容器中。如果某个软件出现了较多的垃圾信息，用户还有三种方式进行处理：
1. 隐藏。即断开软件所在容器与系统的连接，垃圾信息立刻从系统中消失。
2. 重置。将软件所在容器恢复至初始状态，垃圾信息将被清除。
3. 删除。删除该软件的同时，垃圾信息也一并被删除。
三、 对系统的兼容性
(一) Prayaya V3
支持 Windows 2000/XP/2003/Vista (官网介绍)
(二) 云端软件平台
支持Windows 2000/XP/2003/Vista/2008/Win7 (官网介绍)
从兼容系统上看，V3和云端都支持主流的Windows XP系统，也都支持较老的Windows 2000系统。但V3只支持到Vista系统，而云端可以支持最新的Windows 7操作系统。
有些遗憾的是，V3和云端目前都不支持64位的Windows系统。
四、 对软件的兼容性
(一) Prayaya V3
根据V3官方的介绍，目前V3所支持的软件有上千款。
对于不支持的软件，V3官方没有明确的说明。
(二) 云端软件平台
云端官方没有给出所支持软件的数量，但其软件库中提供的软件已接近3500款。(必须说明的是，因为版权原因，云端的软件库中并没有提供诸如Office、Photoshop之类的商业软件，但实际上是完全支持的。)
对于未完美支持的软件(必须开机加载驱动或启动服务的软件)，云端官方有较详细的说明，其中包括：
1、 虚拟机软件(如VMware、VirtualBox、VirtualPC等);
2、 系统优化设置类软件(如Windows优化大师、超级兔子魔法设置、TCP-Z等);
3、 安全防护软件(如瑞星杀毒软件、天网防火墙等);
4、 带虚拟光驱、虚拟打印机功能的软件(如DAEMON Tools、PDFCreator等)。
从所支持的软件数量上来看，V3和云端并不在一个数量级上。
从常用软件的支持情况来看，V3和云端都支持绝大多数常用的软件，包括即时通讯软件、网络浏览器、媒体播放软件等。
对于用户较为关心的办公软件，V3的兼容性则远不及云端。以AutoCAD为例，V3仅支持较老的AutoCAD 2004版的安装使用，而云端可以支持到最新的AutoCAD 2010版。在最新版的V3中甚至去除了对用户自行安装中文输入法的支持，而云端则毫无这个限制。
在V3中能够运行的安全类软件较少，甚至在安装某些杀毒软件导致系统蓝屏。云端的表现相对要好一些，目前能够完美支持的(具有实时监控功能的)有金山毒霸、江民杀毒、360安全卫士、金山清理专家和瑞星卡卡上网助手。但总的来说，大部分安全类软件在V3和云端中运行时都只有基本的病毒扫描功能。
五、 对软件的获取
(一) Prayaya V3
V3中的软件只能由用户自己从各个软件下载站下载后进行安装。
(二) 云端软件平台
云端的软件获取方式则较多，包括：
1. 通过云端官方提供的软件库下载由云端官方封装的软件，此方式无须安装，下载后即可使用。
2. 通过论坛、社区、网络硬盘等形式，获取其他用户分享出来的已经封装好的软件，此方式也同样无须安装。
3. 从下载站下载软件后，使用云端的虚拟化工具自行封装。
从软件的获取形式上来比较，V3较为符合传统用户的习惯，从下载到安装，基本与平时在Windows中的操作相同。
但综合软件来源及软件的丰富程度来看，云端无疑高出一筹。其官方提供的软件库中的软件，已经可以满足用户的大部分需求;而虚拟化工具的推出，不仅能让用户自行封装软件，而且通过分享其他用户封装的软件，完全可以弥补官方软件库中缺少有版权风险的软件的不足。
六、 对软件的管理
(一) Prayaya V3
V3没有自己的软件管理方式，完全沿用Windows的管理。需要用户自己手动安装软件，需要打开控制面板去卸载软件。
(二) 云端软件平台
云端拥有一套完整的软件管理方式，包括软件的一键搜索、下载、使用、重置、删除等，最新的版本还拥有了自行封装软件及编辑软件的功能。
软件管理的方式来看，V3仍然是较为符合传统用户的习惯，对于有一定计算机使用经验的用户来说，习惯的延续可以减少其学习成本。
但从用户体验及对初级用户的帮助上来看，云端的管理方式无疑是值得赞许的。一个对计算机知识了解不深的用户，只要通过简单的引导，就能独自完成从下载到使用的全过程。同时对于高级专业玩家来说，云端提供的虚拟化工具(自行封装软件入云端)也可以让他们将自己需要的但是官方没有提供的软件进行比较高级的定制。
还有一点，v3是收费的，而云端是全免费的
