阿拉善右旗为典型的荒漠气候特征,对野生植物的生长和发育及其分布规律有着显著影响。种属成分贫乏,稀疏而不郁闭，开敞度大以及低下的覆盖率和生物产量，为典型的灌木、半灌木为主体的荒漠群落，且在水平和垂直地带性方面均有着明显的分异性。南部龙首山区,由于降雨量较多,植物种类比较丰富,较集中地分布着全旗总植物种类的1/2以上,且多为亚高山、高山灌丛、林下以及林缘,生境的种、属成分,中部地区风积沙丘和盐碱地貌广泛分布,植物种类贫乏,以旱生、超旱生及耐盐碱的植物种类为主;西北部巴丹吉林沙漠中的湖泊、山前泉水露头处的边缘和居民点的塘坝、水库及地下水位较高的地区,尚分布着非地带性的植物种类,主要有马蔺、田间杂草，沉水和浮水水生植物及中生草本植物等。
境内野生植物分属62科、216属、482种。其中蕨类植物4科、4属、4种；裸子植物3科、4属、8种；被子植物55科、208属、470种（双子叶植物纲47科、163属、356种、单子叶植物纲8科、45属、114种）。
林木植物 梭梭、青年云杉、侧柏、圆柏、沙地柏、山杨、胡杨、白榆、旱榆等。
饲用植物 主要饲用植物80种，广泛分布于境内各类草场。梭梭、盐爪爪、细枝盐爪爪、西伯利亚滨藜、驼绒藜、华北驼绒藜、沙蓬、绵蓬、藜、雾冰藜、碱蓬、黑柴、珍珠柴、松叶猪毛菜、短叶假木贼、碱地肤、小白蒿、茵陈蒿、驴驴蒿、三列艾菊、蒙古鸦葱、分枝鸦葱、砂兰刺头、阿乐泰狗娃花、沙地旋复花、蒙古短舌菊、蒲公英、苦马豆、藏锦鸡儿、柠条锦鸡儿、狭叶锦鸡儿、小叶锦鸡儿、刺叶柄棘豆、甘草、细枝岩黄芪、扁蓿豆、霸王、石生霸王、球果白刺、白刺、蒺藜、多裂骆驼蓬、蒙古扁桃、绵刺、鹅绒委陵菜、二裂委陵菜、红砂、细穗柽柳、红柳、沙拐枣、木蕦、扁蓄、银灰旋花、刺旋花、沙茴香、锁阳、羊角草、燥原荠、黄芦木、拂子芳、无芒隐子草、沙生针茅、冠芒草、三芒草、狗尾草、芨芨草、小画眉草、虎尾草、芦苇、赖草、沙竹、白草、马蔺、黄金尾、细叶尾、蒙古葱、碱葱、戈壁天门冬。
药用植物 药用植物包括中医、蒙医药用植物共121种:节节草、银粉背蕨、冷蕨、侧柏叶、圆柏叶、沙地柏叶、麻黄、山杨、榆树叶、毛果荨麻、大黄、皱叶酸模、沙拐枣、扁蓄、西伯利亚、眼模叶、珠芽、西伯利亚滨藜、沙蓬、蒙古虫实、藜、碱地肤、丝蓬、猪毛菜、反枝苋、马齿苋、银柴胡、女娄菜、早麦瓶草、王不留行、耧斗菜、铁线莲、水葫芦苗、唐松草、黄芦木、角茴香、宽翅沙芥、独行菜、葶苈、瓦松、小丛红景天、土三七、甘青茶蔗、蒙古绣线菊、荀子、山刺玫、小叶金露梅、委陵菜、山杏、蒙古扁桃、苦豆子、蒙古沙冬青、披针叶黄花、扁蓿豆、苦马豆、鬼箭锦鸡儿、黄耆、多叶棘豆、甘草、米口袋、甘青老鹳草、宿根亚麻、大白刺、骆驼蓬、蒺藜、远志、地锦、红柳、河柏、杉叶藻、锁阳、迷果芹、绒果芹、沙茴香、点地梅、补血草、龙胆、中国扁薷、罗布麻、鹅绒腾、紫筒草、鹤虱、蒙古获、香青兰、白花枝子花、益母草、枸杞、曼陀罗、砾玄参、阿拉善马先蒿、黄花列当、苁蓉、车前、蓬子菜、忍冬、西北缬草、紫沙参、高山紫苑、火绒草、冷蒿、莲座、风毛菊、狗娃花、旋复花、苍耳、牛芳、鸦葱、苦巨菜、蒲公英、水冬麦、芦苇根、醉马草、狗尾草、白草、灯心草、蒙古韭、山丹、黄精、天门冬、马蔺。
梭梭Haloxylon ammodendron(C. A. Mey.) Bunge也称琐琐，藜料，灌木或小乔木，高1—6米，国家二级、自治区一级渐危种保护植物。我旗天然梭梭林主要分布在巴丹吉林沙漠东、南缘塔木素、努日盖等地，全旗梭梭林总面积360万亩，其中：天然林338万亩，人工林22万亩，人工梭梭林主要分布在板滩井、雅布赖和巴丹吉林镇地区。梭梭为强旱生盐生植物，分枝多，根粗壮，耐旱耐寒，耐沙埋土压，不怕风吹沙打，生于荒漠的湖盆低地外缘的固定、半固定沙丘上，在沙漠地带常形成大面积纯林，是优良的固沙植物。梭梭也是我旗近年来防风固沙主要造林树种之一。
柠条 ( Caragana korshinskii Kom.) ,也叫毛条、白柠条 ,牛筋条。为豆科锦鸡儿属的落叶大灌木 ,高 3～ 5 米。我旗柠条主要分布在曼德拉、阿拉腾敖包、塔木素等地，全旗柠条总面积180万亩。柠条根系发达 ,防风蚀、保土性能强 ;具根瘤菌 ,能改良土壤 ;分枝稠密 ,沙埋后能产生不定根 ,固沙作用强。柠条是优良的“三料”植物 ,枝条富含油脂 ,易燃耐烧 ;枝、叶既是很好的绿肥 ,又是优良的饲料。
绵刺(Potaninia mongolica) 别名:蒙古包大宁，蔷薇科，落叶矮小灌木，高20－40厘米，稀有种，是一种古老残遗的单种属植物，也是一种珍贵的种质资源，国家一级保护植物，为阿拉善荒漠区特有植物。我旗绵刺主要分布在曼德拉、阿拉腾敖包、塔木素等地，全旗绵刺总面积为590万亩。绵刺极耐严寒、干旱和盐碱，在干旱年代生长极微弱，甚至可呈“假死”状态；如遇降水则可加快生长，且可正常开花结实。
白刺（Nitraria tangutorum Bobr.）别名：酸胖、白茨，蒺藜科，匍匐性小灌木，常匍匐地面生长，株高30～50厘米。白刺是一种典型的荒漠植物。在全旗范围内均有分布，我旗白刺总面积为190万亩。白刺的适应性极强，耐旱、喜盐碱、抗寒、抗风、耐高温、耐瘠薄，为荒漠地区及荒漠平原典型植物，是我国寒温、温和气候区的盐渍土指示植物，也是沙漠和盐碱地区重要的耐盐固沙植物。白刺根部还寄生有名贵中药材锁阳。
蒙古扁桃（Amygdalus mongolica）别名：山桃，蔷薇科，灌木，高1-2m。稀有种，已列为国家二级保护植物。全旗范围内均有分布，重点分布在雅布赖、曼德拉、塔木素等地，我旗蒙古扁桃总面积为3.3万亩。蒙古扁桃为喜光树种，根系发达，具有耐旱、耐寒和耐瘠薄的特性。蒙古扁桃是重要的木本油料树种，种仁含油率约40％，油可供食用。种仁性味苦，有润肠通便，止咳化痰的功效。也是核果类果树的砧木和干旱地区的水土保持植物。
沙冬青（Ammopiptanthus mongolicus (Maxim.) Cheng f.）别名： 蒙古黄花木，豆科，常绿灌木，高1-2米。沙冬青是古老的第三纪残遗种，为阿拉善荒漠区所特有的建群植物。渐危种，国家二级保护植物。我旗沙冬青主要分布在塔木素地区，分布面积为0.5万亩。沙冬青为常绿超旱生植物，这与当代气候条件显然是不协调的，反映其残遗种的特征。沙冬青对于研究豆科植物的系统发育、古植物区系、古地理及第三纪气候特征，特别是研究亚洲中部荒漠植被的起源和形成具有较重要的科学价值。沙冬青的茎、叶还具有祛风除湿，活血散瘀等作用。
霸王Zygophyllum xanthoxylum (Bge.) Maxim. 蒺藜科，多年生落叶沙生灌木，高0.7-1.5米，抗风沙、耐干旱、适应性极强，经常出现于荒漠、草原化荒漠、荒漠化草原及戈壁覆沙地上。在全旗范围内均有分布，我旗霸王总面积为55万亩。霸王为中等饲用植物，在幼嫩时骆驼和羊喜食其枝叶，可做燃料并可阻挡风沙。根入药，能行气散满，主治腹胀。
沙拐枣（Calligonum mongolicunl）别名：头发草，蓼科，多年生灌木，高 1～ 2 米, 沙拐枣是旱生喜光的灌木树种 ,具有抗干旱、抗高温、抗风蚀、抗沙埋、抗盐碱的能力 ,生活力强 ,易于繁殖 ,生长迅速等特性，国家二级保护植物。我旗沙拐枣主要分布在雅布赖、曼德拉、塔木素等地，分布面积为5.2万亩。沙拐枣的根或带果全草具有清热解毒、利尿、分利湿浊、滋润皮肤等功效。
花棒（Hedysarum scoparium）又名细枝岩黄芪、花子柴、花帽和牛尾梢等，为蝶形花科岩黄芪属落叶大灌木。花棒为沙生、耐旱、喜光树种，它适于流沙环境,喜沙埋,抗风蚀,耐严寒酷热,枝叶茂盛,萌蘖力强,防风固沙作用大. 我旗花棒主要分布在雅布赖、阿拉腾朝格等地，分布面积为3.5万亩。花棒枝干含油脂，为优良薪柴；可用于编织；树干可作农具柄；茎皮纤维强韧，可搓麻绳；嫩枝叶可用于饲料；种子可榨油。
柽柳（T. ramosissima Ledeb.）别 名：金条、黄金条、三春柳、观音柳、西湖柳、红柳。柽柳为落叶灌木或小乔木，极耐盐碱、沙荒地，根系发达，萌生力强，极耐修剪刈割。国家二级保护植物。全旗范围内均有分布，主要分布在孟根、塔木素等地，我旗柽柳总面积为0.1万亩。柽柳的老枝柔软坚韧，可以编筐。嫩枝和叶可以做药，具疏风散寒，解表止咳，升散透疹，祛风除湿，消痞解酒之效，也可用作牲畜饲料。
肉苁蓉Cistanche salsa(C．A．Mey．)G．Beck，别名：大芸、沙中仙、淡大云等。列当科，寄生于梭梭根部的多年生草本植物。国家二级保护植物。我旗肉苁蓉主要分布在塔木素、阿拉腾朝格等地，分布面积约300多万亩。肉苁蓉甘而性温，咸而质润，具有补阳不燥，温通肾阳补肾虚；补阴不腻，润肠通腹治便秘的特点。
锁阳 Cynomorium songaricum Rupr，又名不老药，药物别名地毛球、锈铁棒、锁严子，锁阳科，野生于沙漠戈壁，属肉质寄生草本，寄生于白刺（泡泡刺）的根上。全旗范围内均有分布，分布面积约150多万亩。锁阳具有补肾阳，益精血，润肠通便之效。
甘草Glycyrrhiza uralensis Fisch. ，别名：甜草根、美草、密甘、密草、国老、粉草、甜草、甜根子、棒草，豆科，多年生草本植物。国家二级保护植物。主要分布于旗内巴丹吉林沙漠南沿，生于沙质土壤上。甘草能补脾益气，清热解毒，祛痰止咳，缓急止痛，调和诸药。
麻黄分为草麻黄 Ephedra sinica Stapf，中麻黄 Ephedra intermedia Schrenk ex C. A. Mey. 或木贼麻黄 Ephedra equisetina Bge. 别名：龙沙、狗骨、卑相、卑盐，麻黄科，草本状小灌木，国家二级保护植物。主要分布于旗内曼德拉、雅布赖、巴彦高勒、阿拉腾朝格等地，生于山前冲积扇冲沟两侧、石质山或石缝间等。有发汗散寒，宣肺平喘，利水消肿作用。
发菜Nostoc flagelliforme别名：地毛、旃毛菜、地毛菜、仙菜、净池菜、头发菜，念珠藻科，国家一级重点保护野生植物。发菜适应性强，抗高温干旱，耐寒，在盐碱瘠薄的地方也能生长，全旗境内除沙漠之外各地均有分布。发菜是名贵山珍之一，也是一种高档的营养品。
沙蓬（Agriophyllum squarrosum (L.) Moq.）别名：沙米、登相子。藜科，一年生先锋植物。生于流动或半流动沙地或沙丘。为良等饲用植物。具有特殊的先期固沙性能，故在荒漠地带是一种先锋固沙植物。分布于旗巴丹吉林沙漠周边。
沙鞭（Psammochloa）别名：沙竹米子，禾本科，多年生根茎型草本。为典型的沙生旱生植物。对流动沙丘有很强的适应性。为沙地先锋植物群聚的优势种。为良等饲用禾草。分布于旗巴丹吉林沙漠半固定沙地。
芦苇（Phragmites australis）别名：苇子，禾本科，广幅湿地植物。常以大片形成所为的芦苇荡，在沼泽化草甸放牧场，也往往形成单纯的繁茂地。分布于旗各自然湖泊或低湿地。
胡杨Populus euphratica OlivPo，又称胡桐、异叶杨，杨柳科落叶乔木。树高15～30米，胡杨是荒漠地区特有的珍贵森林资源。我旗境内在塔木素、雅布赖、 阿拉腾朝格等地有零星分布，分布面积约300亩。
沙枣Elaeagnus angustifolia L．别名桂香柳、香柳、银柳，胡颓子科，灌木或乔木，高3～15米。 沙枣生活力很强，有抗旱，抗风沙，耐盐碱，耐贫瘠等特点。全旗境内各农业点或居民点均有分布，分布面积为1.8万亩。沙枣果实可食，酸、微甘、凉，还可健脾止泻；树皮入药能清热凉血，收敛止痛。
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