子午流注针法，其理论源出于《内经》、《难经》，形成于宋金时代，并发展于元明时期。“子午流注纳甲法”又称“纳天干法”，天干以“甲”开头，故名“纳甲法”，它是以天干地支配合脏腑、经络、阴阳及五输穴组成的一种逐日按时开穴的针刺方法。
《内经》认为人体的气血运行是有规律地有盛有衰的，气血流注按时辰流经五脏六腑。针灸时间治疗就是依据人体的流注节律，在固定时相内针刺补泻和提高经络治疗的敏感性，利用时间治疗的相对特异性，来扶正袪邪，提高疗效。
《素问．针解》说，针刺“补泻之时与气开阖相合也” 。与气开阖相合，就是与日月运行相合，这就是子午流注取穴的原理。
子午：分别是阴极阳极的标志，子代表一日之内的子时 (23～1 时)，一年的冬季 (11 月)，午是一日之内的午时 (11～13 时)及一年的夏季 (5 月)，
子午又分别代表正北方及正南方。在气机升降方面，子时则气升，午时则气降，因此子午流注是阴阳、时辰及方位的两极标志。
流注：是指人体的经气不停地呈现子午阴阳的消长转化，及子午气机的升降浮沉盛衰规律。
古人用天干地支纪时。
天干10个: 甲、乙、丙、丁、戊、己、庚、辛、壬、癸。自甲始，至癸终。甲属阳，乙属阴，丙属阳，癸属阴。
地支12个: 子、丑、寅、卯、辰、已、午、未、申、酉、戌、亥。自子始，至亥终。子属阳，丑属阴，寅属阳，戌属阳，亥属阴。
古人将把天干和地支阴与阴、阳与阳两两相配, 从甲与子相配始，配成“甲子”，乙与丑配成为“乙丑”„癸与酉配成“癸酉”，至此十干轮完，再从甲始，甲与戌配成“甲戌”，乙与亥配成“乙亥”，如此循环, 在取到“癸亥”时, 若再取则又为“甲子”。这样, 从“甲子”到“癸亥”, 天干轮了5次, 地支轮了6次, 共有60对, 称为“六十甲子”。六十甲子用来作为纪年、纪月、纪日的代号, 循环使用, 从不间断, 叫作“干支纪法”它是我国古代历法中的一项重大发明和创造。
纳甲法：以天干配合地支再结合阴阳五行及经气值辰进行取穴的方法。
经气值辰
《内经》依据人体经脉中气血流行盛衰现象以说明“天道” ，即外界环境变化规律对人体的影响，认为人体气血运行是有规律地有盛有衰的，就象潮水的涨落一样。以一天十二个时辰为例，寅时是手太阴肺经气血流注最旺盛的时间，依次卯时传于手阳明大肠经→足阳明胃经→足太阴脾经→手少阴心经→手太阳小肠经→足太阳膀胱经→足少阴肾经→手厥阴心包经→手少阳三焦经→足少阳胆经→足厥阴肝经的十二经运行顺序和流注衔接关系。
五输穴
五腧穴是十二经脉井、荥、输、经、合五个穴位的总称，分布在四肢肘、膝关节以下，从四肢末端向肘、膝方向排列。五腧穴犹如河流的上源，故立足于五腧穴的阴阳调整，则可奠定全身阴阳调整的基础。
《素问．至真要大论》说的“阴阳何谓也．．．两阳合明也．．．厥阴何也．．．两阴交尽也” 。“两阳合明” 为阳明燥金，故阳经井穴属金；“两阴交尽” 为厥阴风木，故阴经井穴属木。这一木一金为一阴一阳一生一成，而为万物之终始。阳升之木根于阴经，阴降之金根于阳经，其中有阳升阴降及阴阳互根的规律。
李春源五腧穴相生关系表
纳甲法（亦称“纳干法” 或“天干子午流注”）
纳甲法是依据“年周期” ，并根据每日气血输注十二经，随每日值日经甲、乙、丙、丁、戊、己、庚、辛、壬、癸十个天干逢时开穴的原则，进行配穴治病的方法。
“甲” 是天干之首，纳甲法即以天干为主的按时开穴法。
纳甲法取穴方法
纳甲法有三种取穴方法：
1.按值日经天干取穴法
2.天干按时取穴法
3.逐日按时取穴法
1.按值日经天干取穴法
按值日经的天干，每日分配一经在这一天内取该经自起点至终点的任何腧穴，都可以治疗该经的病症。例如，肝经病，乙日一天不论什么时辰，都可开取肝经从期门至大敦的所有腧穴治疗。其它天干值日经亦依此类推。
2.天干按时取穴法
按时的天干，在这个天干时辰内，开取该经的五俞穴中的任何一个腧穴，都可以治疗该经的病症。例如，胆经病，不论日的天干如何，祇甲时，都可开取胆经的足窍阴、侠溪、足临泣、阳辅、阳陵泉五俞穴中的任何一个腧穴治疗。其它时辰的天干亦依此类推。
现在使用以上两种方法的较少。
3.逐日按时取穴法
按天干值日经，逢时开取值日经的井穴，下一个时辰按阳日阳时阳经穴、阴日阴时阴经穴和“经生经” 、“穴生穴” 的原则开穴，逢输过原，最后阳日气纳三焦，阴日血归包络。
①取穴原则。阳日（日天干属阳），阳时（日天干属阳）取阳经穴；阴日（日天干属阴），阴时（日天干属阴）取阴经穴。
②合日互用。甲与己、乙与庚、丙与辛、丁与壬、戊与癸互为合日，在合日间可以互相应用相应时辰的开穴。
纳子法（亦称“纳支法”或称“十二经母子补泻法”）
纳子法是依据“日周期” ，用本经的井、荥、俞、经、合五俞穴，配合木、火、土、金、水五行，再根据每日气血流注十二经的地支时辰：子、丑、寅、卯、辰、巳、午、未、申、酉、戌、亥开穴（应时为经气旺，过时为经气虚）。依据虚则补其母，实则泻其子的原则，并配合五行相生相克穴位，取穴治病的方法。
开穴方法
1. 按时循经补母泻子开穴法
2、循经一时辰开五输穴法
在应时经脉中，每个时辰开该经五输穴治疗，由于一个时辰有两小时，故每 24 分钟开一个，主治应时经脉的病证，辨明虚实，进行补泻。
纳子法一时辰开合本经输穴表
现代医家对子午流注的争议
聂道芳等认为子午流注在理论和临床使用都存在缺憾，在理论方面：第一，子午流注的经络流注方式呈向心性亦可呈离心性，标本根结只呈向心性。第二，子午流注重视时间而忽略辨证论治。第三，子午流注有“阳日阳时开阳经穴，阴日阴时开阴经穴”的理论，但在实际开穴时却存在了“阳日阴时开阴经穴，阴日阳时开阳经穴”的问题。第四，经脉的长短都不同，气血在不同的经脉流注的时间相同存在问题；合日互用气血如何循行；癸日的开穴跳过了十个时辰开穴存在问题。在临床使用方面：第一，子午流注拘泥于五输穴的使用，其他大量穴位闲置。第二，辨证论治与按时取穴治疗存在矛盾。第三，患者就诊时辰不一定是按时取穴的最佳时辰。第四，子午流注的开穴推算复杂，而且时间存在误差。
王继认为子午流注存在老人小孩气血流注因人而异的不统一性，按时取穴穴性不统一，同一时间存在纳甲法、纳子法、养子时刻注穴法等开取不同的穴位的缺憾。
子午流注应用
“因时制宜” 治疗法则
子午流注取穴法属于“因时制宜” 的治疗法则。注重“择时” 与“选穴” 两个方面，
“择时” 是依据人体气血流注的盛衰时间为主
“选穴” 则是优选十二经疗效最佳的“五俞穴
二者结合，就是子午流注取穴治病的中心内容。
治疗慢性病，要根据病情选择流注经穴与病情相适应的时辰，进行治疗，称为“择时选穴” 或叫“定时治疗” 。
例如肺病咳喘，采用“纳子法” ，实证在寅时泻尺泽，虚证在卯时补太渊；采用“纳甲法” ，可约定辛日乙未时针太渊或癸日辛酉时针尺泽，以提高疗效。
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