大约4600年前，炎帝王朝衰落，蚩尤部与黄帝部先后分离出来，于是就形成了上古版三国演义，即炎帝部、蚩尤部、黄帝部争霸。最终，黄帝先后击败炎帝与蚩尤，成为当时部落联盟盟主。此后2600年内，华夏一直由黄帝家族主宰，颛顼、帝喾、帝舜、大禹、商契（商代始祖）、周后稷（周代始祖）都是黄帝后代。其中，司马迁笔下的五帝与大禹家世如下：
黄帝—玄嚣—乔极—帝喾—尧
黄帝—昌意—颛顼—穷蝉—敬康—句望—桥牛—瞽叟—舜
黄帝—昌意—颛顼— 鲧 —禹
根据《五帝本纪》记载，颛顼是黄帝之孙，帝喾是黄帝曾孙，帝尧是帝喾之子，帝舜是黄帝八世孙，大禹是颛顼之孙、黄帝的四世孙，商契与周后稷是帝喾之子。所谓世孙，即是后代之意，比如黄帝之子玄嚣是第一代世孙，帝尧是第四代世孙。
问题在于：舜是黄帝八世孙，禹是黄帝四世孙，大禹辈分远高于帝舜，但帝舜却是大禹之前的帝王，这就显得非常不符合逻辑，那么这是为什么？司马迁又是如何看待的？
根据《史记》记载，舜50岁时摄政，58岁时继位，守丧三年后61岁时正式继位，在位39年，100岁去世，将王位禅让给了大禹。大禹守丧三年后，将王位让给帝舜儿子商均，但诸侯却主动朝拜大禹，于是大禹顺应天意正式继位。
其中，帝尧期间，舜摄政时，先后杀了鲧，以及任命大禹治水。因此，假设大禹治水时是20岁，他治水时低于这个年龄的可能性不大，那么大禹继位时至少62岁，在位十年，死时至少72岁。而如果大禹治水时，年龄与舜大致相同，或者比舜高的话，那么最终大禹寿命将不符合人类年龄极限。言而总之，按照人类正常寿命计算，帝舜比大禹年龄估计要大20岁左右。
帝舜与大禹这两支，前三代都是“黄帝、昌意、颛顼”，只有第四代时出现分化，颛顼之子穷蝉的五世孙是帝舜，颛顼之子鲧的儿子是大禹。因此，如果要符合逻辑的话，鲧寿命必然要很大很大，帝舜之前的四代人寿命必然要很小很小，否则时间上将出现重大漏洞。
但实际上，帝舜亲自下令处死治水不力的“鲧”，导致大禹治水时“三过家门而不敢入”。也就是说，鲧的年龄即便比舜大，估计也大的有限。
黄帝三世孙“鲧”的年龄，与黄帝八世孙“舜”的年龄差不多，而他们这二支的前两代完全相同，那么基本可以断定，司马迁笔下的帝舜与大禹家世有问题，即要么大禹世家不可信，要么他们源于黄帝之说不可信。
当然，这里不是说司马迁故意编造历史，而是史料来源可能就有问题，比如《礼记》等中曾经提到：“有虞氏禘黄帝而郊喾，祖颛顼而宗尧。夏后氏亦禘黄帝而郊鲧，祖颛顼而宗禹。殷人禘喾而郊冥，祖契而宗汤。周人禘喾而郊稷，祖文王而宗武王。”舜和禹将黄帝视为祖宗，商和周将帝喾视为祖宗，而帝喾又是黄帝后代，因此司马迁编制的黄帝谱系是有根据的。
需要注意的是，上文谈到的“郊冥”、“郊喾”等，其实就是在野外祭祀祖先。很多农村人都知道，清明节时，对于一些久远的先人，一般在室外烧纸祭祀；而在室内隆重祭祀的，一般是较近的祖先，或者说是始祖人物。
但司马迁在编制黄帝谱系时，又的确有着自己的加工，《史书》记载得很清楚。
早在编写《史记》时，司马迁的朋友张夫子质疑说：“诗言契、后稷皆无父而生。今案诸传记咸言有父，父皆黄帝子也，得无与诗谬秋？”因为《诗经》中说商契、周后稷都不知父亲是谁，但司马迁都把他们说成黄帝后代，所以张夫子质疑司马迁的加工。
司马迁辩解称：“天命难言，非圣人莫能见。舜、禹、契、后稷皆黄帝子孙也。黄帝策天命而治天下，德泽深后世，故其子孙皆复立为天子，是天之报有德也。人不知，以为泛从布衣匹夫起耳。夫布衣匹夫安能无故而起王天下乎？其有天命然。”
透过司马迁的辩解可见，他既有“天下有德者居之”的思想，又有强烈的血统思想，认为黄帝功德无量，后世上天为了报德，会让黄帝后代成为天子，而真正的布衣不可能无缘无故地成为天子，颛顼、帝喾、帝舜、大禹等成为天子，必然是拥有大功德的黄帝后代。
由此可见，帝舜、大禹是不是黄帝后代，其实并无实据，而是司马迁等古代学者的推断。而如果帝舜与大禹不是黄帝后代，帝舜只是比大禹早的一位帝王罢了，那么帝舜与大禹自然也就没有因黄帝谱系而带来的逻辑问题。
不过，黄帝与颛顼、帝喾、帝舜、大禹等人，可能不是没有关系，只是或许没有血缘关系，但却可能是政治祖先，即黄帝是“君父”。
帝喾与元妃生下周后稷，与次妃生下商契，即商周王朝都是帝喾后代建立的。但这种可能性很小，真相应该是：商朝时，周人臣服于殷商，自然要奉商人始祖为祖，因此当时周人的说法应该是“帝喾与元妃生下商契，与次妃生下周后稷”；周朝时，为了减少殷商影响力，为周人夺取江山寻找合法性，于是改为“帝喾与元妃生下周后稷，与次妃生下商契”。其中，帝喾实际上与周人可能没有血缘关系，但却肯定是周人的“政治祖先”。
《清华简·五纪》记载：“黄帝有子曰蚩尤，蚩尤既长成人，乃作为五兵。”这里面将黄帝与蚩尤说成父子关系，颠覆了无数人的认知，但仔细思考不难发现，这里面说的应该是“君父”关系，成王败寇，如果蚩尤获胜的话，可能会写成“蚩尤是黄帝之父”。
因此，由于战国以来推崇黄帝，导致黄帝影响力非常大，或许由此慢慢成为了其他帝王的“政治祖先”，就比如后世王朝无比怎么更迭，都会视自己为上天之子，而“天”就是所有帝王的“政治君父”。
也就是说，黄帝应该不是颛顼、帝喾、帝舜、大禹等所有人的血缘祖先，而是他们的政治祖先。只是司马迁在描述这段上古史时，采用线性叙述的方式，强行将上古几个著名帝王串联起来，并给予他们与黄帝血缘关系，由此导致帝舜与大禹出现了违背逻辑的关系。而实际真相应该是，黄帝是黄帝，帝舜是帝舜，大禹是大禹，彼此没有什么血缘关系。
参考资料：《史记》等
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