一提起科学，人们往往把它当成是真理。一旦形成了这样一种思维，科学解释不了的现象都成了伪科学。于是乎，中医成了伪科学，气功成了伪科学，风水成了伪科学，特异功能成了伪科学。这其实是科学界的一个阴谋，用科学来反中医，由于科学被当成了真理，中医反击无力，因此，中医几乎被整个世界抛弃。
其实，从科学的“科”的意思就可以知道，所谓的科学，不过是一门分科的学问，它与真理差之甚远。原因是显而易见的，把一个物体的组成构件还原出来简单地分分类，这一是忽视了构件之间的关系，二是忽视了构件与环境之间的关系，用这种观点来看世界，世界就是一个死寂沉沉的框架。
科学之所以能够称之为科学，就是因为万物呈系统的秩序，科学的目的就是为了探索这个支配系统秩序的必然性规则，用来指导人的生存。西方科学发展有五百年了，可它发现了这个系统秩序的规则了吗？没有！用它的最高成就“不确定原理”来认识这些系统秩序，它们都是不可思议的奇迹。连必然性的规律这个科学的灵魂都不要了，这样的理论真的能够称为科学体系吗？
实践是检验真理的唯一标准，中医经过了人类历史上时间最长，人数最多的实践检验，是当之无愧的科学，至少也应该称之为潜科学，即人们尚未认识到的科学。不过，随着科学的不断发展，人类早晚会让这个潜科学变成显科学，那时就再也没有人说中医不科学了！
现在的问题是，中医到底能不能称之为科学？如果说科学定义为分科之学的话，那么中医确实不是科学。如果说科学是揭示自然最普遍规律的学问，那么中医就是地地道道的科学。难道不是吗？中医是建立在对大自然最普遍规律的认识之上的，这个规律中医说得很清楚，它就是统一物质（气）有序（阴）和无序（阳）变换的规律。这实际上是一个系统的发展规律，因为物质从无序向有序转化就是物质系统的产生，从有序向无序转化就是物质系统的灭亡，阴阳学产揭示的就是物质系统产生、发展、壮大、衰退、灭亡的规律性。由于自然界的一切物质都是呈系统的，因此，阴阳学说就是对大自然最普遍规律的一种描述。
或许有人说了，为什么几千年的中医能够解释最普遍的自然规律，而现代人却不能呢？答案很简单，古人以自然为中心，人是自然的一部分，强调人要顺应自然，因此，以发现自然最普遍的规律为已任。更重要的是，万物归一气，万物同一理，这个规律就体现在我们每一个人与周围世界的关系当中，认识了自己存在与发展的原理，也就认识了自然最普遍的规律。而西方人呢？则是以人为自然中心，它就必须要否定决定万物的必然性规律的存在，看看科学的发展就知道了，它一直试图否定必然性规律的存在，从科学万能论把科学凌驾在自然规律之上，到量子力学延伸出的不确定原理，直接否定必然性规律的存在。有了这样时髦的思想，怎么可能发现自然规律呢？
当然，西方科学走到今天这一步，与它的前提假设有着密切的对应关系，这就是原子说假设，它假定了空间的空无一物和对称，以及少数几种死寂不变的基本粒子的存在。按照这个假设，我们只要还原出最基本的那几个基本粒子，自然规律就找到了，西方科学一直就走在这条还原论的大道的。
中国先人之所以能够发现终极的自然规律，同样与它的前提假设有密切的对应关系，这就是气一元论假设，它假定了万物都是由同一种生命之流（气）汇聚而成的，气散就是物质系统的产生，气散就是物质系统的灭亡，因此，站在气一元论的基础上，必然会走向系统论，中医学就是建立在这个系统科学体系之上的。
显然，中医和西医分别是建立在两个完全不同的科学体系之上的。中医是立足于气一元论假设，用统一的一种物质（气）有序（阴）和无序（阳）变换的规律来解释自然界的一切。西方科学立足于原子说假设，用少数几种基本粒子的不同组合来解释自然界的一切。我们在认识中医，就必须回归到气一元论这个立足点上来认识，如果站在原子说假设之上来认识，中医显然是无从理解的。
精通东西方科学的大师李约瑟说得好：”现代科学的成就，不能成为古代科学的最后历史审判庭，因为科学的发展还远远没有到头。“把一个发展中的理论体系当成是终极真理来评价中医，无疑是不客观的。我们要解决中医和科学之间的矛盾，就必须寻找这个终极的真理，它才是真正能够评价中西医的东西。事实上，这个终极真理就在中医学中，只要我们认识到它，中医与科学的矛盾就解决了。
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