第二节：阴阳学说所揭示的大自然规律
气一元论告诉我们，自然界的一切现象都是由统一物质的有序和无序变换形成的，所谓的大自然规律就是物质有序和无序变换的规律，这其实是一个标准的系统学规律，因为物质从无序向有序转化就是物质系统的产生，从有序向无序转化就是物质系统的灭亡。有序和无序之间的转化规律其实就是物质系统产生、发展、壮大、衰退、灭亡的规律性。如果我们掌握了这个规律，就可以用这个规律来理解自然界的一切物质系统的存在与发展。
在东方科学中，自然规律是用阴阳学说来描述的。在这里，阴即气之有序状态，阳即气之无序状态，当然也可以这样来理解，阴即有秩序的物质系统，阳即在混沌中存在的物质世界。阴阳学说就说明了统一物质有序和无序变换的规律，由于自然界的一切都是成系统的，因此，阴阳学说就是对大自然最普遍规律的一种揭示。
对西方科学来说，自然秩序是无法理解的，因为按照热力学第二定律，世界似乎是一条从有序向无序转化的单行道。不过，自然的事实却不是这样，物质不仅能够从有序向无序转化，而且也可以从无序向有序转化。问题出在哪里呢？原来，这是由西方科学的前提假设造成的。由于它假定了物质基础的死寂不变，组织现象就成了自然界的奇迹。与西方科学不同，东方科学则假定了物质在空间中不仅是连续的，而且是在紧张地相互压迫中存在的，因此，只要是物质性的存在，它一定是在被压迫中存在，反抗周围物质的压迫是一切存在物的本性，也正是这种本性的存在，组织现象在自然界无所不在。
显然，如果把物质视为一种在紧张地相互压迫与反抗中存在的东西，生命问题就轻松地解决了，万物都是由同一种生命之流汇聚而成的。现在人总是喜欢有生死来描述事物，其实，这里的生死是针对物质系统而言的，物质从无序向有序转化就是物质系统的产生，从有序向无序转化就是物质系统的灭亡，有序和无序转化的规律在这里也可以描述为生命的规则，即物质系统生与死的转化规则。
现代人理解阴阳学说，总是从纯哲学的角度来进行理解，甚至拿它与西方的对立统一规律相类比。事实上，这两者有着根本性的区别，首先，对立统一规律是空洞的哲学概念，而阴阳学说则有着坚实的物质基础，它是建立在气一元论之上的，它描述了物质系统存在与发展的规律。其次，对立统一规律中的对立双方一般被认为是平等的，这使我们在理解对立的事物之间统一的时候出现了障碍。而在阴阳学说中，阴阳则是不平等的，阳为主，阴为次，阳主阴从就是对方物统一的核心。
《内经》说得好：阴在内，阳之守也；阳在外，阴之使也。阴在内，当然指的是有组织的物质系统，在物质系统与它所依赖生存的外在环境之间有一个物质交换和能量交换的层次，科学上称之为能量场，它是以物质系统为中心的；阳在外，当然是指物质系统所依赖生存的空间，没有这个不对称运动的空间，物质系统只有单调地走向无序，这也反证了连续在空间中的混沌物质是在不对称运动中存在的，物质系统是在反抗这种不对称运动中获得了持续运动的能量，保持了自身的秩序。
其实，从物质的有序状态（阴）和无序状态（阳）也可以知道，阴阳是不平等的。因为有序状态是有限的，局部的物质系统，而无序状态是和无限的宇宙空间混然一体的，也可以说是物质系统所依赖生存的外在世界。在这一对矛盾中，外在世界的力量是宏大的，不可抗拒的，顺应外在世界的变化，系统就能够不断产生并发展，违背外在世界的变化，系统就只有不断地走向衰退和灭亡，系统的变化和外在世界的变化是一一对应的。
受西方科学的影响，很多人总以为自然规律体现在少数几种基本粒子的个性之上，只要挖掘出它们，自然规律就找到了。可事实上，万物分解到最后都是同一种叫不出名字的东西，自然规律在这里不是具体的东西，而是一个无形无象的原理，用阴阳学说的描述来说，它就是“整体决定局部”的大自然规律。
一旦理解了阴阳学说所描述的大自然规律，上帝的形象就出现在我们面前，它其实就是无限广大的自然，它是所有物质系统的母系统，我们观察到的一切都是它的子系统，孙系统，一层一层，秩序井然。用老子的一句话来说就是“人法地，地法天，天法道，道法自然”。
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