史弥远进相位后，对韩侂胄执行时罢斥宗室大臣赵汝愚，指理学为伪学、罢逐理学家的做法加以纠正。他去伪学禁，赠朱熹、复赵汝愚、吕祖谦等人官职，召林大中、楼钥等故老十五人入朝，受到朝野的好评，拜为少保。皇子赵竑对史弥远独揽朝政十分反感，在私下谈论时说了史弥远辅政多有不便的话。不料这话传到了史弥远的耳里，他便顿生恶念，处心积虑要除去这个无穷后患。嘉定十七年(公元1224年)八月，在宁宗病情危急时，他声称皇上有密旨，将宗室之子贵诚立为皇子，改名昀。宁宗驾崩当晚，他与皇后密集，召越昀入宫，废赵与莒为济王，让赵昀接了皇帝位，是为宋理宗。赵昀做了摆事实后，史弥远推荐真德秀、魏了翁、杨简、李心传等二十人，并予重用，朝政为之一新，海内望治。宝庆三年，史弥远被封为鲁国公，绍定六年，食邑千户，封会稽郡王。

史弥远相宁宗十七年，立理宗后又独相九年。他独揽朝纲，大权在握，终其政绩而论，虽非贤相，但却能爱惜人才，善于用人。绍定四年(公元1231年)宋军击毙李全，论功行赏时，从将欲望甚高，朝臣也认为应赐以高官厚禄。史弥廷道：“御将之道，譬如养鹰。饥则依人，饱则飏去，曹彬下江南，太祖未肯以使相与之。况今边戌末撤，警报时至，若诸将一一遂其所求，志得意满，猝有缓急，孰肯效死亡”这样，有功将士只得到有限的赏赐。

史弥远虽独居相位，也惧怕树大招风，况朝臣中对他独揽朝政，迫害济王，迢立理宗多有微言。虽理宗因感他拥立之功多加庇，终究难得安宁。因而，屡次上疏乞归。晚年时，他想在家乡找一块好墓地作为归宿。不料竟引出一场风波，几乎使他遭受灭顶之灾。相传，史弥远为找墓地招集许多风水先生，最终看中了阿育王寺这块“八吉祥六殊胜地”。史弥远觉得很合心意，便下令在那年八月中秋节后拆寺建坟。正当阿育王寺和尚听到这个消息，急得如同热锅蚂蚁，阿育王寺方丈更是六神无主时，有个叫师范的小各尚说他有办法保护寺院。师范小各尚得到方丈允准，到了南宋都城临安，在一个月黑风大的夜晚，在城门、宫墙、大街都贴着这样一张诗单：'育王一块地，常冒天子气；丞相要做坟，不知主何意？'临安百姓对史弥远早已怨恨，见了诗单后便纷纷传说：'史弥远要霸占天子气，要谋皇篡位了'，消息传进皇宫，理宗素知史弥远为人，过去他一手遮天帮他坐上了皇位，如今也难保史弥远不会篡皇位。便把史弥远宣进皇宫，查问此事。史弥远也怕皇上翻脸，不光富贵保不住，怕还有灭九族之祸哩。于是，赶紧撒谎道：“臣的坟墓早已做在东钱湖大慈山了，诗单死中生有，望万岁明察。'这样一来，阿育王寺被保留下来，史弥远的坟墓也真的做到东钱湖大慈山了。