看看miRNA是如何蹭自噬热点的。
众所周知,虽然miRNA在RNA世界中曾是个王者,但现如今却也被后来居上的lncRNA和circRNA衬托的暗淡无光。可即便如此,miRNA仍然宝刀未老,是科研新人探索RNA世界的绿色快捷通道。
而这不仅仅是因为miRNA的逻辑论证符合单变量和二元变量论证的基本原则,也是因为miRNA的研究论证有其独特的优势:1)以过表达(mimics)/沉默(inhibitor)做表达差异时只需要qPCR验证miRNA水平即可,而无需买抗体做Western;2)可直接合成miRNA短片段,无需病毒载体即可高效转染;3)且有一套固定的分子机制研究模式,细胞水平的“一正一反”操作流程也非常简单。
因而本期《文献一点通》课程则会套用泛读四部曲(题目要素、假设逻辑、数据泛读和套路总结),来详解3篇以miRNA为主题的二元变量论证文章套路(3<><>
又因这三篇文章中,有两篇都涉及了科研热点表型自噬,兼之前期课程也已介绍过自噬相关的明星分子,因而本期课程则会详细介绍一条与自噬相关的明星通路PI3K/AKT/mTOR。其中,PI3K作为胞内的磷脂酰肌醇激酶,可活化下游的AKT蛋白,进而激活mTOR来发挥负调控自噬的作用。
案例一
案例二
案例三
总之,以上这三篇以miRNA为主变量的二元变量论证结构,主要涉及了miRNA+通路以及miRNA+分子的两种类型,其主要论证过程仍是分三步走:1)miRNA调表型,2)miRNA调通路/分子,3)miRNA调表型依赖于通路/分子。
而在众多直接机制作用研究模型中,miRNA靶向作用于下游编码基因无疑是最简单的一种。在通过查询在线的数据库(如Targetscan)来预测miRNA的靶基因后,以qPCR实验来找寻并验证miRNA和靶基因mRNA的表达负相关证据,再结合荧光素酶报告基因实验(Luciferase assay),就可获得miRNA与靶基因的3’UTR是有结合作用的直接作用证据。
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