三个主题
一、如何让更多的人选择FISH
二、如何让FISH价值最大化
三、FISH面对的挑战
质控:
检测前:
固定很重要;切片厚度3-4um,淋巴瘤2-3um,合格制片大于等于50个肿瘤细胞/片;
检测中:
试剂、仪器、环境(温度低于15摄氏度,对结果影响很大)
结果判读:
明确判读标准/阈值
病例1: HER2:选定一个区域后,按顺序判读,排除不能判读的细胞;
病例2和3:肺腺癌,ALK/ROS1:精准识别肿瘤细胞;红绿信号分开间距不大的情况,结合其他结果,例如IHC等平台结果
病例4:梭形细胞肿瘤ALK:15-20%阳性;炎性肌纤维母细胞性肿瘤的阳性模式
病例5:动脉瘤性骨囊肿:多核巨细胞不是肿瘤细胞
病例6:直肠腺癌-绒毛状管状腺瘤:HER2在不同区域阳性不同
病例7:肺癌ALK:同一张切片ALK阳性不同,小细胞癌区域与腺癌区域阳性模式不同。
病例8:小圆细胞恶性肿瘤EWSR1:FISH阴性,NGS阳性,EWSR1-FEV,CUT-OFF值难定,结合形态判读。
病例9:毛细胞星形细胞瘤,BRAF 分离探针:效果不好,KIAA1549和BRAF只有1.94Mb间距,假阴性。
病例10:梭形细胞肿瘤:SS18-SSX1融合导致FISH假阴性。难以解释的假阴性。
病例11:恶性肿瘤:TFE3易位,YAP1-TFE3融合。
FISH挑战:1、间距小,假阴性;2、CUT-OFF值不确定;3、难以解释的假阴性;4、无法明确partner 基因;5、NGS
问答环节:
1、炎性肌炎母?
答:同一个基因在不同肿瘤中的阳性模式可能不同。有特殊就在报告里备注。
2、胶质瘤间变少突往往伴有拷贝数增多,例如2红5绿,报告备注1P和19q缺失,但拷贝数有增多,这个有临床意义,预后可能更差。
3、炎性肌母肉瘤的伙伴基因会不会导致IHC表达不同?
答:有,ALK核旁阳性或点状阳性,这个伙伴基因就是一个特殊的基因。
4、RNA seq包括哪些基因?
答:在检测融合基因有优势。
5、肠癌HER2没有明确指南,应该参考什么?
答:参考乳腺或胃癌的指南需要备注
6、DAPI下如何辨认肿瘤细胞?
答:每次看FISH前都要看HE,与申请FISH的诊断一起看下HE
7、淋巴瘤三打击阈值?
答:接近CUT-OFF值时参考经典判读。
8、ALK单红能算阳吗?
答:看试剂判读标准;看背景,背景是双色就
9、多核巨细胞
答:多核巨细胞不能报多倍体
10、肠癌50%肿瘤细胞>2
答:异质性要详细、客观的描述,
11、不能确定的需要其他平台验证吗?
答:要,这种病例少,积累经验,更利于准确发表告。
12、乳腺10%簇阳?
答:报告中要报区域阳性比例,结合指南,需要备注的就备注是否有异质性。
13、各个探针阈值?
答:不同基因在不同肿瘤里阈值可能不同,例如ALK在肺癌和软组织肿瘤中的就不一样,建议设一个灰色区间,例如10-30%,30%以上阳,10%一下阴,之间就具体情况具体判读。
14、穿刺组织中异常信号的肿瘤比例不足10%,怎么发报告?
答:一般不发阳性,可建议手术样本再送检。
15、融合探针记单融合还是双融合?
答:看试剂说明书,是什么肿瘤,什么阳性模式,CUT-OFF值是多少。例如单融合算阳,但阈值就高。
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