公立医疗机构的硬件投入靠政府，软件和日常管理靠医院自身、降低医疗成本和提高运行效率靠体制机制创新。改革分四部分，政府管理体制、医药体制、医疗体制、医保体制。
第一部 改革管理体制
一、改革政府管理机制
由一位分管领导统管医改中涉及的医疗、医药、医保等有关政府职能部门，充分授权，并在机构设置、人员编制、人员调配、工作经费给予全力保障。所有医改文件全部由组长一人签发。专门成立了“医改工作协调小组”“医药卫生体制改革专项工作小组”。
二、改革政府投入机制
（一） 政府承担医院基本建设、大型设备购置责任。
1、新建或重建，一次投入可用30年至50年。
2、设备投入，三明测算，每家乡镇卫生院每年平均保证50万至100万元投入、二级医院每年平均保证300万至500万投入、三级医院每年平均保证800万至1000万元的投入。（目前我国医疗设备的采购价还有40% ~ 60%的价格虚高水分可以挤压）
（二）原来财政补助医院运行经费不减。
（三）医改前医院的长期债务纳入政府公共债务平台，在政府一时无力偿还的情况下，采取由医院挂账，其借款利息纳入财政预算，全额支付。
（四）学科建设。对经卫生主管部门论证批准的学科建设项目，由财政拨专项经费予以支持。
（五）离退休人员经费全部纳入社会养老保险范围。
（六）对医院承担的社会职能如“三无人员”救治、对外医疗援助及其卫生、应急救援等支出，由财政另行核拨。
公立医疗机构的基础建设和大型医用设备必须由各级政府负责统一规划、审批、建设，全面落实基本建设、设备购置、重点学科建设、人才培养、离退休人员经费等方面的财政投入政策，实现“硬件投入靠政府、运行管理靠医院”的目标。
三、强化卫生部门职能，提高卫生部门威信
（一） 加强公立医院院长管理。
1、 明确公立医院院长双重管理制度。
（1） 任命院长流程：当地党委提出县级公立医院院长任免建议，当地党委任命县级公立医院院长须经卫生局任职业务资格审查后，方可对外正式宣布任职决定。
（2） 院长具备业务资格条件规定：
一是具有十年以上工龄，担任县级医院中层以上职务或乡镇卫生院院长三年以上。
二是具有卫生类大学专科以上学历和副高以上卫生专业技术职称。
三是在三级甲等以上综合医院接受不少于1个月的管理学习培训。
四是确因工作需要，引进的高层次专业技术人员可适当放宽任职职业资格条件。
（3） 乡镇卫生院院长和社区卫生服务中心主任由县（市、区）卫生局（实行医联体的，由代管县级医院）负责聘用，聘任后报宣传部门备案。乡镇卫生院实行编制总量核定，定编定岗不定人。人员招聘、使用、考核和调配，由县（市、区）卫生局自主统一安排后，报人事部门备案。政府购买服务的基本公共卫生专项经费，由县（市、区）卫生、财政部门负责依据考核办法考核后拨付。
（二） 整合优化医疗卫生资源。
国家规定千人均床位数4张配置标准。对床位使用率低于80%的公立医院不再进行扩建。对人口少的医院实行资源整合和共享。
（三） 建立医疗机构考核机制
引入第三方对医疗机构进行考核评价。
四、组建医疗保障基金管理中心（简称市医管中心）
（一） 三保整合
理顺城镇职工医保、城镇居民医保和新型农村合作医疗保险三项医保基金的管理体制、机制。
（二） 组建市医管中心
由市财政局代管。各县（市）相应成立分支机构，实行垂直管理，有一个经办机构直接与医院发生医保结算关系。
（三） 市医管中心的职责
1. 贯彻执行国家、省、市基本医疗保险的法律、法规和政策，拟定并组织实施医疗保障改革方案；
2. 负责全市基本医疗保障基金的筹集、预决算、支付和管理，编制会计和统计报表；
3. 负责拟定市医疗机构药品限价目录，组织实施公立医疗机构限价目录药品的采购与结算，并对公立医疗机构限价目录药品的使用、管理、配送等进行监管；
4. 负责办理基本医疗保险的参保登记、待遇审核等业务；
5. 承办公务员医疗补助、机关事业单位女工生育补助及离退休干部医疗费用核销等业务；
6. 负责全市辖区内定点零售药店和定点医疗机构的准入与退出，承担定点零售药店和定点医疗机构的日常管理、协议制定、监督考核、审核结算等相关医疗保险管理工作；
7. 负责全市医疗保险网络系统数据库和定点医疗机构、定点零售药店联网运行数据维护、系统升级和综合管理；
8. 负责基本医疗保险与补充医疗保险的衔接协调及补充医疗保险的招、投标和日常监管；
9. 负责统筹、协调各县（市）管理部的各县工作。
五、 实行工资总额控制制度
医院当年工资总额＝当年医务收入×院长当年考核百分值×调节系数
备注：当年医务收入指医院当年能充分体现医务人员劳动量的诊察费、护理费、手术费、治疗费、床位费等收入，既不包括检查化验收入（检查、化验收入作为医院运行费用），也不包括药品、耗材收入
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