来源: 思影科技
作者: 杨田雨,杨晓飞
最近,经我们team经过数轮研讨之后,决定开辟一个专栏,以寓教于乐的方式和浅显通俗的语言为关注者带来一些原理或方法上的理解,望读者们喜欢吧,如果出现些许谬误,请参照我们的爱因斯坦大神经常说的“不要在意那些细节。。。。。”。
在最近的一期思影fMRI培训中,我听到这样一段对话:
甲:我已经构建了脑网络,已经做了统计,也用BrainNet做了可视化。
乙:那你为啥还要参加基础班啊?(小小地惊讶。。)
甲:额,我不太懂fMRI成像原理,没做过fMRI数据的预处理。
乙:啊,好奇怪啊,不懂fMRI还把功能脑网络构建出来了。。
听到这里,初学者可能有一些疑惑了,这家伙甚至没做过fMRI数据的预处理,竟然已经开始做脑网络了。我也有些好奇了,于是乎,我也掺和进来:“那你是用什么数据构建的脑网络呢?”
甲:别人给了我一些脑区的信号序列。
额,好吧。到这里,大家可能已经明白了,构建一个功能脑网络,甚至不需要我们懂fMRI!那么这个过程是怎么实现的呢?
首先,甲学员从他人那里获取了每个脑区的信号序列。其次,计算任意两个信号序列间的相关(皮尔逊相关)。这样,把脑区视为节点,相关值视为边,功能网络就构建好啦!
参考一下图片(请无视画风 ^_^; ),红色脑区的信号序列(均值)和蓝色脑区的信号序列(均值)做一下相关,就是红区和蓝区间的FC值,也就是红蓝脑区间的连边值。
这样,包含两个节点(红色脑区和蓝色脑区)和一个连边的最小“脑网络”已经构建好了。当我们把任意两个脑区信号序列的相关计算出来后,一个完整的脑网络就计算好了!
(这张图片是不是“正式”了很多!^_^; )
这个时候,乙学员插话道:“那么,我们一开始怎样提取这些脑区的信号呢?” 正欲讨论,远处传来呼叫声:“孔乙己,你的MATLAB怎么又报错了!”大家的目光便都投向门口的孔乙己,培训班充满了快活的空气。
OK,第一次专栏就到这里,是不是感觉意犹未尽呢?那丰富多彩的广告时间已为你准备好:
相关培训班通知:
第二届磁共振脑影像结构班
第一届磁共振ASL(动脉自旋标记)数据处理班
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