冲绳本名叫琉球，明清时代它一直是中国的属国。冲绳是日本抢夺后的称呼，而琉球是中国明朝时期中国人为该群岛取的名字。自古以来与中国、日本、朝鲜及东南亚国家保持紧密的文化交流和海外贸易，所以和日本本部的风俗文化、食物、材料、建筑风格与日本有着很大的差异。
15世纪初，巴志王统一琉球，受明朝赐姓尚，开始筑首里城。1372年，明太祖朱元璋给琉球的中山王察度下达诏谕后，琉球的北山、中山、南山三王遂开始向明政府朝贡。从此琉球为中国的藩属。1390年起，琉球诸离岛部落酋长入贡中山。
1392年，明太祖有见于琉球对于来华使节海上航行的困难，特赐闽人善于造船航海的技术者三十六姓人家移居琉球。这一点是后来促进琉球对海外贸易的关键。闽人三十六姓中包括“知书者，授大夫长史，以为朝贡之司；习航海者，授通事，总为指南之备”。可知他们不仅是善于操舟者，且担任通译和其他与朝贡有关的事务。他们在琉球定居以后，便成为代表明王朝长期协助琉球，增进中原王朝和琉球关系的一群优秀人员。他们子孙繁衍，为琉球人尽过许多劳积。
琉球的历代国王都以进贡的形式与中日两国开展贸易。琉球国在15世纪末时最为强盛。国王尚真王笃信佛教、禁止民间私藏武器、致力于发展贸易和振兴文化。仿奈良县的元觉寺建立首里元觉寺，作为王家墓地。作为冲绳象征的守礼门，是下一代的尚清王时代建造的。
1609年萨摩军队进攻并控制了琉球王国，为了继续得到贸易利益，表面上仍然把琉球作为一个独立国家，让其和中国继续进行贸易。
1868年明治维新之后，日本开始觑视琉球、朝鲜以至台湾等邻国和周边地区。1872年日本废藩置县将琉球王国废止，变为日本的琉球藩。
1879年日本非法吞并琉球，设冲绳县。二战后，根据《波茨坦公告》第8条的补充规定：“开罗宣言之条件必将实施，而日本之主权必将限于本州、北海道、九州、四国及吾人所决定其他小岛之内。”其他小岛并未明确包含琉球群岛，琉球群岛暂时由美国代管。在1951年的《旧金山和约》（注：该条约从未被中国政府承认）中，规定日本虽拥有琉球的主权，但行政权归属美国。1972年（昭和47年）5月15日，美国将冲绳行政权单方面交还予日本，但美军仍然驻守其在冲绳建立的军事基地至今。
冲绳是日本在第二次世界大战时唯一被美军登陆的直属领土，在二战后期，1945年美军登陆冲绳，打败日本守军，而冲绳亦曾成立一个只有一星期的八重山共和国。战后日本投降，日本被美国军事占领，冲绳由于战略位置优，故此在1945年至1972年期间由美军直接管辖冲绳。1972年美军单方面交还冲绳予日本，但美军仍然驻守其在冲绳建立的军事基地，占用的土地达冲绳岛面积的20%。
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