崇圣寺三塔属全国重点文物保护单位。崇圣寺初建于南诏丰佑年间（公元824～859年），大塔先建，南北小塔后建，寺中立塔，故塔以寺名。
崇圣寺是大理历史上规模最为宏大的古刹，南诏丰佑年间曾有殿宇千间，大理国时期是皇家的寺院。据《南诏野史》记载：崇圣寺“基方七里，周三百余亩，为屋八百九十间，佛一万一千四百尊，用铜四万五百五十斛”；有“三阁、七楼、九殿、百厦”之规模。崇圣寺庙宇咸同年间已毁，只有三塔完好地保留下来。
大理崇圣寺三塔由一大二小三阁组成。大塔又名千寻塔，当地群众称它为“文笔塔”，通高69.13米，底方9.9米，凡16级，为大理地区典型的密檐式空心四方形砖塔。南北小塔均为十级，高42.19米，为八角形密檐式空心砖塔。三座塔鼎足而立，千寻塔居中，二小塔南北拱卫，三塔浑然一体，气势雄伟，具有古朴的民族风格。
三塔的建筑风格，一般都说类似西安小雁塔，是典型的唐塔风格，表现了唐宋时期云南与内陆的密切联系，但是三塔又具有不同于内陆塔的两个特点：一、三塔层数均为偶数，而内陆塔多为奇数。二、中原塔由基座向上直线收缩，下大上小，呈矩梯形；而三塔上下较小，中部较大，外部轮廓呈曲线。
修建三塔，除了佛家所宣扬的可以成佛外，还有一个重要的原因，是大理古为“泽国多水患”。古籍《金石萃编》中记载：“世传龙性敬塔而畏鹏，大理旧为龙泽，故为此镇之。”
大理三塔文物——大鹏金翅鸟
相传古时修建三塔，采用垫一层土修一层塔的方法，塔修好以后，才将土逐层挖去，让塔显现出来，故有“堆土建塔”与“挖土现塔”之说。建塔时所搭的桥，高如山丘，长达10余里。修塔时运力不足，还用山羊来驮砖，如今大理的银桥村，古时称为“塔桥村”。古藉记载修三塔，“役工匠七百七十万，耗四万余金，历时八年建成”。
公元1056年，星逻（今泰国）国王耶多曾两次到崇圣寺迎佛牙，大理国王段思廉以玉佛相赠。由于大力倡导，大理国佛教盛行。大理国二十二代国王中，有九位出家到崇圣寺当和尚，包括第十五代王段正淳（《天龙八部》中用了他的名字）、第十六代王段和誉。
明代传抄的大理国时期的佛教经典《大灌顶仪式卷》，就记载了国王举行灌顶仪式的复杂场面，这么多国王出家，在世界佛教史上是独有的奇特现象。吸引了内陆香客和东南亚、南亚崇圣寺香客到崇圣寺“朝圣”，崇圣寺成了东南亚、南亚推崇的“皇家国寺”。
明朝地理学家徐霞客在《滇游日记》中载：“是寺在（苍山）第十峰下，唐开元中建，名崇圣寺。前三塔鼎立……塔四旁皆高松参天，其西由山门而入，有钟楼与三塔对势，极雄伟。楼中有钟。极大，径可丈余而厚及尺，为蒙氏（南诏）时铸，其声闻可八十里。其后为正殿，殿后罗列诸碑……其后为雨铜观音，乃立像，铸铜而成者，高三丈余……自后历级上，为净土庵等。”
1922年的大理三塔
历经千年沧桑和风雨剥蚀，崇圣寺毁于清咸丰年间，唯有三塔幸存。
1925年大理地震，塔顶地震，塔顶震落，残破益重。
建国后，政府对三塔保护十分重视，1978年对其进行了大规模维修。这次维修中在千寻塔基座中发现了南诏、大理时期的佛教文物600余件，其中有大量的佛像和写本佛经，其中有一尊金质阿嵯耶观音像，重1135克，高24厘米，极为珍贵。这是迄今为止发现的南诏国和大理国时期文物中最为丰富的一批，价值极高，为中外所瞩目。这些发现，揭开了古代大理“佛国”一道神秘面纱。
2005年4月崇圣寺大规模恢复重建竣工，结束了崇圣寺三塔近百年来“有塔无寺”的历史。新建的崇圣寺的规划布局以保护三塔为核心，借鉴了国内外著名寺庙布局的特点，按主次三轴线，八台九进十一层次进行规划建设。整个仿古建筑群落占地600亩，建筑面积20080平方米。主轴线上依次建有大鹏金翅鸟广场、山门、护法殿、弥勒殿、十一面观音殿、大雄宝殿、阿嵯耶观音阁、山海大观石牌坊、望海楼。中轴线两旁和次轴线上建有法物流通处、方丈堂、客堂、斋堂、罗汉堂、千佛廓、祖师殿、佛教研究院等。
