云南高原湖泊众多，是中国五大湖区之一，湖区总面积为1066平方公里，集水面积9000平方公里，总蓄水量约300亿立方米。全省面积在1平方公里以上的湖泊共有37个。滇东主要的湖泊有滇池、抚仙湖、阳宗海、杞麓湖及星云湖等；滇西主要有洱海、程海、泸沽湖、剑湖、茈碧湖、纳帕海、碧塔海等;滇南主要有异龙湖、长桥海.大屯海、普者黑等。其中,最著名的是被称为“九大高原湖泊”的滇池、洱海、抚仙湖、泸沽湖、阳宗海、程海、碧塔海、普者黑、异龙湖。
滇池
以湖泊面积而论，滇池最大，在全国名列第六，湖面的海拔高度为1886米，南北长39公里，东西最宽为13公里。湖岸线长163.2公里，面积为306.3平方公里，容水量为15.7亿立方米，素称"五百里滇池"。主要河流有盘龙江、金汁河、宝象河、海源河、马料河、落龙河、捞鱼河等，出水口为螳螂江。滇池水由海口注入普渡河.汇入金沙江.属长江水系，流域面积2855公里，为我国的第六大淡水湖，是一颗璀璨的高原明珠。
洱海
洱海，湖面积为251平方公里(水位为1974米)，总容量为25.3亿立方米，汇水面积为2565平方公里，湖长42.5公里，平均湖宽6.3公里，最大湖深22米，平均湖深10.2米，湖周长117公里。 洱海水位1966米时(85高程)南北长42.0千米，东西宽最大8.8千米，最小3.05千米，最大水深21.5米，平均水深10.8米，湖面面积252.91平方千米，蓄水量27.94亿立方米，湖中岛屿面积0.748平方千米，湖岸线129.14千米， 是云南高原仅次于滇池的第二大淡水湖泊。
抚仙湖
抚仙湖湖面海拔高度为1722.5米，湖面积216.6平方公里，湖水平均深度为95.2米，最深处有158.9米，仅次于长白山天池，是中国第二深水湖。湖容积为206.2亿立方米，相当于12个滇池的水量，6倍的洱海水量，太湖的4.5倍，占云南九大高原湖泊总蓄水量的72.8%，占全国淡水湖泊蓄水量的9.16%。抚仙湖水质为I类，是国家一类饮用水源地，也是我国水质最好的天然湖泊之一。
泸沽湖
泸沽湖面积50多平方千米，海拔2690米，平均水深45米，最深处达93米，透明度高达11米，最大能见度为12米，湖水清澈蔚蓝，是中国最深的淡水湖之一。湖中有5个全岛、三个半岛和一个海堤连岛，形态各异，翠绿如玉。
阳宗海
阳宗海海拔1770米，南北长约12公里，东西宽约3公里．湖面积30平方公里，平均水深22米，最深30米。阳宗海为高原断陷湖泊，湖岸平直，湖底凹凸不平，有岩洞暗礁，水色碧绿，透明度高，为淡水湖，湖内盛产著名的金线鱼。
程海
湖面海拔高程1502米，湖泊面积75.97平方公里，南北长24.98千米，东西最大宽5.205千米，流域面积318.3平方公里，平均水深24.98米，最大水深为35.87米，蓄水量16.8亿立方米，为滇西第二大淡水湖，是世界上天然生长螺旋藻的三大湖泊之一。
星云湖
湖面海拔高出抚仙湖1米，该湖南北长10.5公里，东西平均宽3.8公里，最窄处2.3公里，湖岸线长36.3公里，总面积为34.71平方公里；平均水深7米。最大深度10米，透明度约1.5米，湖容量 1.84亿立方米。
杞麓湖
杞麓湖属断层陷落湖，湖泊长轴呈东西向，湖水位1796.62米，湖面积36.73平方公里，湖岸线长度45公里，湖泊长度13.5公里，宽度平均2.72，最宽5.2公里，容积1.45亿立方米，汇水面积340.8平方公里。
异龙湖
异龙湖海拔1407.11米，周长150华里，水面面积39平方公里，平均水深2米，最深处约7米蓄水约1亿立方米。异龙湖属重富营养型湖泊。
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