机械工程
华科的机械在国内外享有盛名，4名院士，4名长江学者，5个国家级研究平台。这一个个数字都足以说明华科机械支强大。论其实力，必在全国三甲之列。
电气工程
拥有4位院士的华科电气学院名扬华夏，拥有电机与电器、电力系统及其自动化两个国家重点学科。学术水平之高，综合实力之强，在全国当与清华、浙大、西交等不相上下。
能源与动力工程
能动学院乃华中工学院建校四大系之一，煤燃烧国家重点实验室即坐落于此，在清洁煤能源等领域居于国内领先地位。第二届全国大学生节能减排大赛即由华中科大能动学院主办，可见华科在能动方面实力之强。
生物医学工程
华科的生物医学工程乃国家重点学科，先后有5位生科院教授荣膺长江学者称号。在生物医学光子学方面居于全国领先地位。
光学工程
拥有2位院士的华科光学工程在国内位列前茅，建有激光技术国家重点实验室。
医学
华中科大同济医学院的前身即1907年由德国人创办的德文医学堂，1952年院系调整时由同济大学调至武汉。解放前，“北有协和，南有同济”，同济医学院蜚声海内外，培养了裘法祖等一大批著名的专家学者。并入华科后，该医学院依然实力强劲，在全国名列前茅。
城市规划
华中科大城市规划虽然不像同济大学那般有名，但实力绝对不俗，2007年城市规划专业被武书连教授承担的“中国大学评价”课组评价为中国大学工学本科114个城市规划中的三个A++级专业之一。虽然武书连的评价未必完全客观，但华科城规的实力却是毋庸置疑的。
公共管理
在2006年国家教育部学位与研究生教育发展中心组织的公共管理一级学科评估中，华中科技大学与清华大学并列第四名，被《中国大学评价》列为A++级，其实力由此可见一般。
控制科学与工程
工学强大的华科在控制工程方面实力雄厚，在自动化方面居于全国领先地位，与浙大、交大、北航等难分伯仲。
新闻学
华科以工科见长，但是受东湖水的滋养，也不乏人文的气息。华科的新闻学就在全国名列前茅，获得了湖北省品牌专业称号和国家级特色专业称号，被武书连评为A++专业。
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