「COPPELION核爆默示录」是以2036年的日本东京作为故事的舞台，由于发生了核电厂爆炸而导致了整个东京遭受了严重的核辐射污染及全面封锁。在这毁坏了的东京，出现了三名看似很普通的高中女生。这三名女生只穿著普通的水手服便只身身处于这核辐射全面污染的死城，确实令人为她们担忧。不过，这三名女生原来是以基因改造技术所生产的孩子，因此体内有了辐射抗体，所以不需要穿著任何保护衣。而且，这三名少女也不只是普通的高中生，她们是隶属于陆上自卫队第三师特种部队，代号「柯佩莉亚娃娃」，奉命深入东京救援生还者。这三名柯佩莉亚娃娃首先要面对恐怖的变种生物，还有爆炸点附近监狱的暴乱，拥有超科技的神秘第三者等。随著故事的推进，漫画在「救援」、「末日景观」这样的预期叙事下慢慢开展，一点点地出现新的疑问，滙合后组成更大的悬疑，逐渐地扩展其深远的设定，往阴谋论的方向发展。
重要线索：大地震、核电厂抗震不足、冷却系统失灵
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