处方是药店销售来源的一部分，药店执业药师或其他专业服务人员的职责绝不仅仅是按方配药，还必须要对处方的合理性进行审核，以保证顾客用药安全有效。
门店药师在处方审核过程中，通常可发现如下几方面的不合理情况。
联合用药的目的应该是提高正向的治疗效果，扩大治疗范围或减少不良反应的发生，但如果联用不当，反而会使疗效减弱，毒性增强或出现严重的不良反应；而已有数据表明，同时使用的药品品种越多，不良反应的发生率也就越高。
联用药物种类过多或联用不合理，具体可分为以下几种。
重复用药
处方中的药品含有相同活性成分，正向治疗作用不一定叠加，但不良反应发生机率或程度可能会成倍增加。
这一类中，最常见的就是感冒药的重复使用。在一张处方里，有两种以上的感冒复方制剂（或一种是感冒复方制剂，另一种是退热药），虽然商品名不同，但功效和成分相同，如都含有对乙酰氨基酚，或一个含对乙酰氨基酚，另一个含布洛芬，都为解热镇痛药，会加重肝损伤。应只使用其中一种。如要联用感冒药与退热药，可将感冒药换为中成药。
同功能或同作用机制药物的重叠使用
处方中的药物作用用途一致，相当于用药剂量加大，不良反应的发生率也会提高；或因作用机制相同，相互之间竞争作用位点，导致疗效下降或耐药性增加。
如患者为慢性乙肝，已进行抗病毒治疗3年，处方开具拉米夫定和替比夫定。因抗乙肝病毒药物易引起耐药，且拉米夫定和替比夫定有交叉耐药性，所以应把其中的一种更换为无交叉耐药反应的阿德福韦酯或改为抗病毒力强、耐药基因屏障高的恩替卡韦，与阿德福韦酯联用。
处方中开具不合理的药物联用，导致疗效减弱或不良反应增加
如慢性肾小球肾炎，处方开具袢利尿剂呋塞米与头孢克洛，因呋塞米等袢利尿剂与头孢菌素类、氨基糖苷类等抗生素合用会导致肾毒性和耳毒性增加，尤其是本来就有肾损害时更易发生，所以应将头孢克洛改为氨苄西林。此外，袢利尿剂与抗组胺药合用，也会增加耳毒性；如患者高血压，处方开具氯沙坦钾与螺内酯片，因螺内酯为醛固酮受体拮抗剂，有保钾作用，氯沙坦等血管紧张素II受体拮抗剂以及血管紧张素转换酶抑制剂也有保钾作用，联用可引起高血钾，所以应改为小剂量氢氯噻嗪，不仅减少不良反应，还能明显提高降压效应。
这里最突出的现象就是抗菌药的滥用了，可有抗菌药品种过多、使用时间过短或过长、处方用法用量与应使用的用法用量不符、不恰当的联用等等现象。举例如下：
诊断为支气管哮喘，处方开具阿莫西林
支气管哮喘属于慢性气道非特异性炎症性疾病，并不是由细菌感染所引起，药物治疗以激素和支气管解痉药为主，只有在同时伴有发热、咳吐脓痰，并经化验确定合并感染时才需要加用合适的抗菌药。滥用抗菌药不仅会增加耐药性，还会因为抑制了机体正常菌群，而不利于哮喘的恢复。
诊断为肌肉软组织损伤，处方开具阿莫西林
可引起骨骼、肌肉与软组织损伤的原因有多种，如果没有开放性伤口，没有合并细菌感染的指征，治疗药物就应以消炎镇痛、活血化瘀为主，而不需要使用抗菌药。
诊断为滴虫性阴道炎，处方开具甲硝唑片阴道塞用
此处应该使用甲硝唑栓剂或阴道泡腾片，而不是把口服片剂当作栓剂使用。普通片剂与阴道栓剂在辅料、制备工艺、药物释放方式等方面都有明显差异，如果要栓剂获得较好疗效，应在体温时就能溶化而释放药物，并在腔道内达到有效浓度，而将片剂当作栓剂使用，崩解条件不足，药物释放需较长时间，不能迅速在腔道内达到有效浓度，且因片剂硬度较大，可能会损伤阴道黏膜，增加刺激性。
诊断为真菌感染，处方开具伊曲康唑，每日服用1次，同时因胃溃疡需要服用抑制胃酸分泌的药物雷尼替丁，每日服用2次
因抑制胃酸分泌药能降低胃酸，使伊曲康唑的吸收减少，所以处方上应注明，两者不能同时服用，伊曲康唑应在服用雷尼替丁之前服用，且服药间隔时间应大于2小时。
处方中开具2种以上药物时，我们会留意联用是否得当，而处方中只有一种药物时，也需要留意处方中的用法用量。
诊断为原发性高血压，处方开具苯磺酸左旋氨氯地平片，口服，2.5mg，一日2次
左旋氨氯地平片为长效制剂，半衰期可达45小时，一日一次足以维持有效血药浓度，因此，应改为1日1次，以血压控制情况来调整剂量，如必要，可联用其他作用机制的降压药。
药物与患者身体状况不符
比较常见的为患者本身的肝肾功能已经受损，处方药物会加重肝肾受损程度。例如，患者已出现肝功能损害，大环内酯类、部分头孢菌素（如头孢呋辛）等需减量使用或不宜使用。
处方未交待清楚药物与顾客正在使用的其他药物有配伍禁忌
或者，当不能同时服用时，处方中未交待正确的服用间隔时间。例如，诊断为风湿性关节炎，处方开具吲哚美辛，但患者因高血压，一直在服用卡托普利。吲哚美辛为内源性前列腺素合成酶抑制剂，可影响扩张血管前列腺素的合成和释放过程，从而减弱甚至完全消除卡托普利等血管紧张素转换酶抑制剂的降压作用，所以应更换为用于风湿骨痛的中成药。如果必须同时使用，应密切观察患者血压，如血压不能控制，可增加卡托普利的剂量。此外，吲哚美辛与呋塞米、吲达帕胺等利尿剂合用，可降低其利尿降压作用；与胰岛素及口服降糖药、口服抗凝药、地高辛、硝苯地平、维拉帕米等药物同时使用，会增强它们的药理作用或毒性。
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