查苗补苗马铃薯出齐后，要及时进行查苗，有缺苗的及时补苗，以保证全苗。补苗的方法是：播种时钭多余的薯块密植于田间地头，用来补苗。补苗时，缺穴中如有病烂薯，要先将病薯和其周围土挖掉再补苗。土壤干旱时，应挖穴浇水且结合施用少量肥料后栽苗，以减少缓苗时间，尽快恢复生长。如果没有备用苗，可从田间出苗的垄行间，选取多苗的穴，自其母薯块基部掰下多余的苗，进行移植补苗。
中耕培土中耕松土，使结薯层土壤疏松通气，利于根系生长、匍匐茎伸长和块茎膨大。出苗前如土面板结，应进行松土，以利出苗。齐苗后及时进行第一次中耕，深度8~10厘米，并结合除草，第一次中耕后10~15天，进行第二次中耕，宜稍浅。现蕾时，进行第三次中耕，比第二次中耕更浅。并结合培土，培土厚度不超过10厘米，以增厚结薯层，避免薯块外露，降低品质。
追肥马铃薯从播种到出苗时间较长，出苗后，要及早用清粪水加少量氮素化肥追施芽苗肥，以促进幼苗迅速生长。现蕾期结合培土追施一次结薯肥，以钾肥为主，配合氮肥，施肥量视植株长势长相而定。开花以后，一般不再施肥，若后期表现脱肥早衰现象，可用磷钾或结合微量元素进行叶面喷施。
防治病虫害马铃薯的病害较多，常见的病害有病毒病、晚疫病、青枯病、环腐病、疮痂病、癌肿病等。晚疫病多在雨水较多时节和植株花期前后发生。因此，要注意及早用波尔多液或瑞毒霉进行防治。青枯病目前药剂防治较难，防治方法主要通过合理轮作、选用抗病品种以及用小整薯作种等措施进行防治。
马铃薯的害虫主要有瓢虫、土蚕、蚜虫、蛴螬、蝼蛄等，可用药剂或人工捕杀等措施防治。
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