男性生殖器官由内生殖器和外生殖器两部分组成。内生殖器包括睾丸、附睾、输精管、射精管、尿道及其附属性腺（精囊、前列腺、尿道球腺、尿道旁腺）等，外生殖器（俗称性器官）包括阴茎和阴囊。
睾丸是男子的生殖腺，呈椭圆状，位于体表阴囊里，左右各一个。睾丸的主要功能是产生精子，分泌雄性激素（主要是睾酮）以维持男性性征和性能力。
附睾附着于睾丸的后外侧，它的上方称为附睾头部，与睾丸相通，末端为附睾尾部，由它延续的管道是输精管。输精管左右各有一条，长度约为４０厘米，它起于附睾尾端，经过腹会阴处的腹股沟内的精索进入腹腔内，与精囊和射精管汇合。
睾丸是精子的诞生地，附睾则是精子发育、成熟的摇蓝。睾丸产生的精子要在附睾内发育成熟，同时将精子贮存在附睾尾部。输精管是精子的第二个贮存处，又是精子排出的重要通道。
精囊、前列腺位于膀胱底部，尿道球腺和尿道旁腺分散于整个尿道，它们总称为附属性腺，具有分泌功能，所分泌的液体成分是精液的组成之一。当男子在接受性刺激时，附属性腺会有分泌液流出，其作用是易于精子活动，润滑阴茎龟头部，这是正常的生理现象，不是精液流出；很多人误将这种现象认为是“见色流精”。
阴茎位于体表会阴处，它不仅具有排尿的作用，而且还有完成性行为和射精的作用，即是精液排出的重要通道，为此，它是重要的外生殖器。
精子是在睾丸里产生的。睾丸的结构与功能太复杂了，至今人们仍对它的微妙功能迷惑不解。医学科学家形象地说：“迄今人类对睾丸的认识，尚不如对月球认识得那样清楚。”
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