“消毒无效”、“消毒看不出效果”，是当前多数饲养场主反应消毒剂应用的现状。
问题的根源：没有选对消毒剂，消毒方法错误，未彻底消毒等。消毒方法或消毒剂选择不当的后果：
1、消毒无效，造成成本和人力的浪费。
2、刺激性强会诱发禽呼吸道病。
3、长期不当应用会导致人畜慢性中毒。
4、导致免疫系统功能下降，特异性免疫功能受损。
5、污染环境，害人害己。
正确的消毒方法和注意事项
1、温度的升高可增加消毒剂的效力。
因为消毒剂是以分子碰撞运动来撞击细菌或病毒(布朗运动)，当运动越高时撞击越激烈，所以温度升高对消毒剂的效力皆有帮助。当消毒场所温度由20摄氏度升高至30摄氏度时效力可增加2倍。所以一般消毒操作时，应选在一天中温度适宜的时间。冬天消毒操作前应先考虑升温，这不仅考虑到温度对消毒效果的增加，而且考虑到在低温时细菌处于孢子形态、病毒处于包涵体形态下消毒剂是无能为力的。
2、环境对消毒效果的影响
有些消毒剂易蒸发，有些消毒剂易受紫外线影响，从而使效力降低。如氯制剂或碘制剂。所以在消毒操作时大部分消毒剂都应尽可能避免紫外线照射，环境相对湿度在50%-70%较好。
环境PH值也会影响消毒效果，大部分消毒剂都是在酸性环境或中性环境下有效。如氯制剂、过氧乙酸、碘制剂等。
3、造成未能彻底消毒的因素
A、环境中有机物的存在极大的影响了消毒效果，实验表明1g鸡粪中隐藏的病毒和细菌能感染100万只鸡发病，绝大多数消毒剂和常规消毒方法是不能杀灭隐藏在有机物中的病毒和细菌的。
B、养殖场环境的不平整也是造成消毒不彻底的硬件因素。如场所墙壁、屋顶多缝隙等。
C、消毒液经长期或频繁使用，都有可能滋生微生物的生长，特别是中效或低效消毒剂。
D、除有特殊说明之外，不同的消毒剂不能混合使用。
E、消毒液应现用现配。
4、根据养殖场流行病学选择适用的消毒剂
每一种消毒剂都不是万能的，根据消毒剂的化学特性，化学消毒剂可分为七大类，它们的作用机理和特点如下：
A、氧化类消毒剂：杀菌机理是释放出新生态原子氧，氧化菌体中的活性基因，杀菌特点是作用快而强，能杀死所有微生物，包括细菌芽孢、病毒。以表面消毒为主，如二氧化氯、双氧水、臭氧等，该类消毒剂为灭菌剂。
B、醛类消毒剂：杀菌机理是使蛋白变性或烷基化。杀菌特点是对细菌、芽孢、真菌、病毒均有效，但温度影响较大，如甲醛、戊二醛等，该类消毒剂可做灭菌剂使用。
C、酚类消毒剂：杀菌机理是使蛋白变性、沉淀或使酶系统失活，杀菌特点是对真菌和部分病毒有效。
D、醇类消毒剂：杀菌机理是使蛋白变性，干扰代谢。杀菌特点是对细菌有效，对芽孢、真菌、病毒无效，如乙醇、异丙醇等。该类消毒剂为中效消毒剂，只能用于一般性消毒。
E、碱、盐类消毒剂：杀菌机理是使蛋白变性、沉淀或溶解。杀菌特点是能杀死细菌繁殖体，但不能杀死细菌芽孢、病毒和一些难杀死的微生物。杀菌作用弱，有强腐蚀性，如硝酸、火碱、食盐等。只能作为一般性预防消毒剂。
F、卤素类消毒剂：杀菌机理是氧化菌体中的活性基因，与氨基结合使蛋白变性。特点是能杀死大部分微生物，以表面消毒为主，性质不稳定，杀菌效果受环境条件影响大，如次氯酸钠、“84”消毒液、优氯净等。该类消毒剂为中效消毒剂，可以作为一般消毒剂使用。
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