伤寒论中把三阴三阳依据河图数配九宫后天八卦，可参考李保柱先生《九宫脏腑配八神用药法要图》：
此图中以河图四正之数1234统四维之数6789得16,27,38,49,5(10)，又以四维之数统四正之数,得62,73,84,91而分别配以三阴三阳，又根据九宫数配后天八卦，最终得到了伤寒论中六种病的传变数理化模型.如下图：
上图中贪巨禄文练武破辅弼就是九星就是一二三四五六七八九。以贪狼起中宫依照九宫路径进入六宫-七宫-八宫-九宫-一宫-二宫-三宫-四宫-中宫。由此得：阳明（1/6,2/6）,厥阴（3/7）,太阴（2/7）,少阴（5/9）,少阳（4/9）,太阳（3/8,4/8），少阴(5/1).
六气传变依据五行的相生流转图如下：
五运顺时针相生，六经传变逆时针。所谓少阳相火就是太阳之火，所谓少阴君火是来自天上的五运之火，故而少阳之火不入五行流转。我们知道五运六气运转也是依照九宫八风是有固定规律的，所以通过九宫洛书，伤寒论把六经传变配合五运六气运转从而建立了伤寒论病变模型，是对天地运气在人身体上的推演。从前篇文章，我们知道三阴三阳就是六子卦模型，内经的六气演变就是建立在此模型上的，我们来推演印证一下伤寒六病传变与内经五运六气的结合规律。六子卦中震为首卦，古人云：长子继父体，因母立兆机。因此这里我们用震巽两卦来推演一下：
上图是震卦的纳甲，只纳阳支并且从初爻庚子往上，根据六气排列规律，初气配太阳然后一直到庚子阳明。而阴支不显示。而巽卦纳阴支从丑支辛丑往上。我们可以把十二地支全部列开然后采用数字来表示六气的传变。数字方式采用山西李宝柱先生的表示方式。我们只需要定义一个起点就行了。这里依照仲景伤寒论条例排列，选用太阳为首记为8/4,因为8/4太阳为艮卦为开门。开门是五运六气的进入点（请参看博文《依八门，定五运》），所以张仲景首列太阳病，所有的外感病都必然从开门而入，因此太阳病治疗为第一。然后排列六病转变顺序排列如下：
另外，对应的巽卦排列如下：
通过这种纵横排列方式，可以看到这种矩阵形式十分工整的排列出三阴三阳的传变方式并且符合内经六气流转线路。大家还可以推演其他卦。至此，可以看出伤寒论是从河图洛书，八卦类像结合内经五运六气而建立的一个完整的理论体系，是一种十分古老而又符合天地之道的医术。
以这种六经六气传变模式规律解读伤寒论将会条分缕析，历历在目。例如仲景在《伤寒论》第4条云“伤寒一日，太阳受之，脉若静者，为不传，若欲吐，若躁烦，脉急数者，为传也”。紧接着第5条仲景云“太阳病二三日，其二阳证不见者，为不传”。太阳病8/4其内传路线是一日为甲日太阳8/4，二日为乙日厥阴7/3，三日为丙日阳明6/2，四日丁日少阴5/1，五日戊日少阳4/9......，“二阳者”阳明6/2是也，病伤寒已两三天即从甲日到了丙日，对于男子（震卦）而言伤寒8/4首传半表半里厥阴7/3，继传阳明6/2，对于女子而言伤寒4/8，首传少阴5/9，再传阳明6/1，两者二三日邪均传里入二阳即阳明6/2或6/1，若丝毫不见阳明征候出现，就可判断为不传，此二条有证无方是仲景大论。当然这里的传变是常理，由于个人体质差异，有传和不传的现象出现，但是我们只要做到知变守常即可。
三阴三阳理论模型同于《黄帝内经》，但是张仲景采用汤液经法用汤药来治病，所以在伤寒论中即讲经络的传变也以八卦之象对应脏腑。三阴三阳是中国医学的根本框架，在这个理论模型下结合不同治疗手段会产生不同的医学流派，比如后世对伤寒论五运六气的用法进一步演算形成了《伤寒钤法》一种特殊的数理化治疗方式，是一种非常优秀的伤寒论的运用模式，一些医家其实大可因为自己不理解
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