黄柏，又名黄檗、檗皮，为芸香科植物黄柏或黄皮树的树皮，始载于《神农本草经》，为清热解毒的常用中药。其性寒，味苦，具有清热燥湿、泄火除蒸、解毒疗疮的功效，常用于治疗湿热泻痢、黄疸、赤白带下、淋浊、梦遗、骨蒸劳热、盗汗、目赤肿痛、口舌生疮、疮疡肿毒、湿疹瘙痒等症。目前，市场上有以旋花科植物番薯的块根加工而冒充黄柏，要注意。
黄连，毛茛科植物黄连或同属植物的根茎，是临床最常用的清热类药物之一。性寒，味苦。归心、脾、胃、肝、胆、大肠经。功效清热燥湿、泻火解毒。对治疗湿热痞满、呕吐吞酸、泻痢、黄疸、高热神昏、心火亢盛、血热吐衄、目赤、牙痛、消渴等病症有良好疗效。外治疮痈疔肿，湿疹、湿疮、耳道流脓等皆有很好疗效。《本草正义》有“凡药能去湿者必増热，能除热者必不能去湿。惟黄连能以苦燥湿，以寒除热，一举两得，莫神于此”。现代研究黄连有解热、抗炎、降血糖、利胆、保肝、抗溃疡、抗腹泻、抗肿瘤等作用。《珍珠囊》曰：“黄连其用有六：泻心脏火，一也；去中焦湿热，二也；诸疮必用，三也；去风湿，四也；治赤眼暴发，五也；止中部见血，六也。”
现代药理研究表明，黄柏与黄连同样含有较多的小檗碱，对金黄色葡萄球菌、肺炎球菌、白喉杆菌、草绿色链球菌、痢疾杆菌等均有抗菌作用，其煎剂对若干常见的致病性真菌有不同程度的抑制作用，还有抑制中枢神经系统、保护血小板、降低血压等作用。
黄芩，又名山茶根、空心草、黄金茶，为唇形科植物黄芩的根。黄芩具有清热燥湿、泻火解毒等功效。以上所说过的，黄连更偏于入心经，泻心火，并治不寐、心烦及上腹部不适感等涉及神志方面的病状；黄芩更偏于入肺经，长于清泄肺热，如疗痰热咳嗽等疾，以治气分之热为专功。并且还是止血良药。
总之，黄连与黄芩的异同点在于：黄连偏于入心，长于清火解毒，性燥，为心胃之剂，主治心中烦，兼治心下痞，下利，能调胃厚肠，治湿阻生热，止消渴，解巴豆毒，擅除水火相乱之病及蔓延淹久之证。黄芩则长于清肺热，其性虽寒而不燥、能治热阴生湿，主治烦热而出血者，治气热攻血之出血证及小腹绞痛或小儿腹痛，能安胎及治烫伤火疡等。
黄连与黄芩，性相近而又各有专长，故二药配伍则更能发挥协同作用，而清化湿热之效益显。例如《金匮要略》中“泻心汤”一方，即由大黄、黄芩、黄连三药组成。
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