由于疫苗是一种特殊的药品，在运输、储存等方面都有严格的冷链要求，最近发生的问题疫苗事件也是在运输过程中间有可能出现疫苗变化，导致失效，而发生一系列的悲剧。高温会使疫苗特别是活疫苗效价迅速降低，或者使蛋白质变性，疫苗也随之失效。我们通常所说的疫苗有效期，也是指在规定冷藏状态下的有效时间。如果为节约成本使疫苗暴露于常温下，是很难保证其有效性的。
疫苗冷链，是指为保证疫苗从疫苗生产企业到接种单位运转过程中的质量而装备的储存、运输冷藏设施、设备。由于疫苗对温度敏感，从疫苗制造的部门到疫苗使用的现场之间的每一个环节，都可能因温度过高而失效。为了保证计划免疫所应用的疫苗从生产、贮存、运输、分发到使用的整个过程有妥善的冷藏设备，使疫苗始终置于规定的保冷状态之下，保证疫苗的合理效价不受损害。冷链的配套设备包括贮存疫苗的低温冷库、冰徘速冻器、普通冷库、运送疫苗专用冷藏车、疫苗运输车、冰箱、冷藏箱、冷藏背包以及计算机和零配件等。
《药品经营质量管理规范》对疫苗冷藏有详细规定：第三十条：（仓库温湿度条件）企业应有与经营规模相适应，并符合药品储存要求的常温库、阴凉库和冷库。其中常温库温度为10~30℃，阴凉库温度不超过20℃，冷库温度为2~10℃；各库房相对湿度应保持在35~75％之间。第三十二条：（运输疫苗、生物制品设备）经营疫苗或生物制品的企业，应有与经营规模和经营品种相适应的冷藏（冻）储存、运输设施及设备。第八十三条（运输中保温和冷藏）对有温度要求药品的运输，应采取相应的保温或冷藏措施。第八十四条（疫苗运输）运输疫苗的冷藏车辆及冷藏（冻）箱应能自动调控和显示温度状况。第八十六条：（药品运输时间）药品运输应在规定的时间内完成，不得将运输车辆作为药品的储存场所。
疫苗的运输、保存及使用过程均有严格的要求，如果存在着偏差将导致免疫缺失，使疫苗不能充分发挥其应有的作用。疫苗在运输、保存过程中存在的常见错误和注意事项主要有：
一、高温运输：由于受条件限制，县以下动物防疫机构很少配备冷藏车，疫苗在运输过程中多采用保温瓶或保温箱，很难避免高温运输，甚至温度忽高忽低引起复冻融，而降低了疫苗的效价。
二、保存不当。生物疫苗一般都怕热，特别是冻苗，需保存在低温环境，冷冻真空干燥的疫苗，冷冻需保存在-15℃的环境中，灭活苗需低温保存在2-15℃环境中，不能过高也不能过低。保存不当主要有不按规定温度保存，冷冻保存与低温保存不分，疫苗任意放置，高温存放，温度忽高忽低。
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