以下的使用介绍是针对Word 2010和Endnote X4，不同版本的软件可能设置的地方不一样。
一、设置特定的Endnote引用文献输出格式不同的期刊或者会议，对于论文末引用文献的输出格式大不一样，虽然Endnote中大量的Style供你选择，但有时总是或多或少跟目标期刊的Style有些区别。能找到一样的Style最好，不能找到的话就编辑与目标期刊Style相似的Style进行编辑。其步骤如下：
1、 Edit→Output Styles→Open Styles Manage，选择相似的Style，然后点击右下方的Edit按钮。本文以期刊JNN（Journal of Nanoscience and Nanotechnology）为例，因为Endnote中没有JNN的Style。本文选择Physical Review B期刊的Style进行编辑。下文都是以编写PRB Style成JNN Style的过程说明，附带扩展说明。
2、 出现编辑窗口后，设置该输出格式的基本信息（About this Style→Category：Physics，et al；Comment and limitations：This Style was edited by Zhenyu Lu according to PRB Style.）这些基本信息可以根据你的实际情况填写，不填写也无所谓，但填写方便自己以后查阅编辑。
3、 设置输出格式的页码输出形式（Page Numbers: Show only the first page number(e.g. 123)）。这个根据你目标期刊的Style选择，JNN的页码显示Style是只显示第一页页码，所以选择第二个。
4、 设置期刊名的输出格式（Journal Names：Abbreviation 2）这里有四个输出格式，分为两大类：全名输出（Use full journal name）和缩写格式（Abbreviation），后面会单独列一个项目详细对期刊名做一说明。
5、 设置论文正文中引用文献处的citation格式为“方括号”格式还是“上标”格式（Citations→Templates→选中右边方框中Bibliography Number→更改格式；方括号格式为[Bibliography Number]，上标格式为Bibliography Number，右边选框上方有些格式按钮，选中Bibliography Number，然后点击A1的按钮就是上标格式了。
6、 修改引用文献输出格式的最核心内容，注意修改过程务必应该是全英文输入状态（Bibliography→Templates）这里可以修改很多引用文献的格式，包括引用书本、引用会议期刊、引用期刊、引用毕业论文等等。这里以修改期刊（Journal Article）的Reference Types为例说明。
http://www.eswome.com/list-13-1.html JNN的Reference Types是Authors, Journal Volume|, Pages| (Year)|
而PRB的Reference Types是Author, Journal Volume|, Pages| (Year)|.
对比两个格式，发现JNN只是在末尾没有句号“.”，所以只需要在原格式中删除掉句号“.”就行了。具体的格式就根据你的目标期刊标准来修改。这里对于Reference Types各项的意思说明下：Author（作者）, Journal（期刊名） Volume（期刊卷数）|, Pages（期刊页码）| (Year)（论文发表年份）|.这里说明下，在Endnote中Reference Types的显示中有|和·，其中·表示一个空格，|表示什么不清楚，不过也没有什么影响，改动的时候不要增加也不要减少原本Reference Types中的|就行了。
下面对几个细节进行说明：（1） 参考文献作者显示格式，有个格式之显示前3位作者，其余的用et al代替，但有的文献则要求显示所有作者。JNN就是要求显示所有作者。修改过程为Bibliography→Author Lists，然后选择Abbreviated Author List下的List all authors names，另外Author Separators下是设置作者名字之间的分隔格式的，上面一行表示只有1~2个作者时的输出格式，下面一行表示作者大于2位时的输出格式。需要注意的是输出格式中空格也是有影响的，比如“before”下的and前后如果没有空格，则输出格式就是R. SmithandJ. Vane，所以and前后要加上空格，才会显示R. Smith and J. Vane。如果格式要求显示前3位作者，则选择Abbreviated Author List下的If 4 or more authors, list the first 3 author(s) and abbreviate with: , et al. Italic? 这里可以自己设置显示的作者个数以及剩余作者的显示格式，另外还有第三种作者显示方式，如图所示，这个就根据你的实际情况来选择了。
（2） 设置作者名字显示方式，是全名形式还是缩写格式（Bibliography→Author Name，然后在右边方框中根据要求选择）。至于每一个选项的都是怎么显示的，自己尝试一下就知道了，这里不再讲述。
（3） 设置输出格式首行缩进格式（Bibliography→Layout，然后根据你的要求设置，这里→符号表示Tab符，如果你不小心将→符号删掉了，不要紧，随便找一个其他的输出格式，拷贝进来就好了。当然你也可以根据自己的情况设置空出多少个空格，JNN格式是空出一个空格，所以就把→给删掉，在Bibliography Number后加了个空格。另外，一般在引文前的序号后通常会有个”.”，这也得加在Bibliography Number后面）
（4） 对于其他Bibliography中的其他几项，采用默认就行了，如果引文是书或者会议论文，那么编辑作者（Editor）根据自己要求做类似修改即可。
（5） 基本设置完成之后，保存。注意，一定要save as，不能用save。
二、Endnote文献引用显示期刊名的输出格式【全名，缩写（带点与不带点），首字母缩写】一般文末的引用文献的期刊名，要么用全名显示，要么用缩写形式，首字母缩写在正式发表的论文中一般都不使用。所以这里只讨论前两种情况。
通常在安装了Endnote后，在编辑Style时，如果在Journal name里选择Abbreviation 1，引文期刊名变成缩写形式，但是缺少小圆点，而选其他的Abbrevitation 2，3，全部为杂志名全程，显示不正确。而这个根本的问题就出在term list。
打开Tools→Open term lists→Journals term list，可以发现每个杂志除了Full Journal和Abbreviation 1（不带点的缩写）下有东西，其他几个选项都是空白的，这就是问题所在。
Full Journal Abbreviation 1 Abbreviation 2 Abbreviation 3
Physical Review B Phys Rev B （空白） （空白）
http://www.eswome.com/list-13-1.html 如果在Abbreviatino 2 下添加Phys. Rev. B，这样当选择Journal name里的Abbreviation 2，期刊名就显示带点的缩写了。
如果个别几个杂志名有问题，可以直接选择右侧Edit term，更改。如果很多都有问题，可以选择import进来新的term list 文件的办法解决。
