洪武元年（1368年），朱元璋于南京称帝，国号大明，年号洪武。
朱元璋从小就把儿子朱标当接班人培养。朱元璋自立为吴王时立十岁的朱标为世子，至朱标病逝，27年的接班人生涯，朱元璋就从没想过换人。不仅自己悉心教导，还请宋濂等名儒为师授其经学。到立朱标为太子时，命功勋道德老成者兼领东宫，不再与东宫外另设府僚，其中就包括李善长、徐达、常遇春等等功臣元勋，意在朱元璋外出征战期间，由太子监国、方便各将军丞相辅佐。
洪武后期，蓝玉和朱标关系甚好，本来是朱元璋留下辅佐朱标的，可惜朱标早逝。
由于蓝玉骄横跋扈，因此至少犯了三大罪：第一，骄横跋扈，不仅炮轰喜峰关，而且和还元妃有染；第二，目无法纪，蓝玉的义子多达几百人，蓝玉的家人不仅侵占民田，滥杀无辜，而且蓝玉还屡放厥词，认为朱元璋给他的封赏太低了；第三，意图谋反，锦衣卫指挥蒋瓛找到了蓝玉谋反的证据。
蓝玉不仅身材高大，满面红光，而且富于勇气和谋略，有大将的才华。中山王徐达、开平王常遇春死后，蓝玉屡次统帅大军作战，多次立功。太祖待他十分优厚。蓝玉渐渐地骄傲自满，畜养了很多庄奴，这些人都仗着蓝玉的威势暴虐凶横。蓝玉曾经抢占了东昌的民田，御史查究追问此事，蓝玉大怒，赶走了御史。
蓝玉北征元军回来时，半夜敲击喜峰关关门，关吏没有及时开门接纳，蓝玉纵容士兵打破关门长驱直入。太祖听说这件事很不高兴。先前，太祖想封蓝玉为梁国公，因他犯错改封凉地，还把他的过错刻在铁券上。蓝玉仍然不知悔改，在侍奉皇上的宴会上出语傲慢。
蓝玉在军中擅自罢免和提拔军官，独断专行，皇帝多次责备他。他西征回朝，太祖让他做太子太傅。蓝玉对位居宋、颍两公之下感到不高兴，说:'难道我不能胜任太师一职吗?'等到他入朝上奏。太祖往往不听他的，他更加不高兴。
蓝玉居功自傲的性格，显然不是年轻的皇孙朱允文能镇得住的，因此朱标死后不久，朱元璋就把蓝玉也屠戮了。
1393年， 锦衣卫指挥使参奏蓝玉谋反，朱元璋随即令人将其拿下，并由吏部审讯。当吏部尚书詹徽令蓝玉招出同党时，蓝玉大呼：“詹徽就是我的同党！”话音未落，武士们便把詹徽拿下，审判官们目瞪口呆，不再审了。三天后，朱元璋将蓝玉杀死，尔后，就是大规模的清洗和株连。胡、蓝两案，前后共杀四万人。
蓝玉一案，族诛一公、十三侯、二伯，牵连被杀一万五千多人，'元功宿将，相继尽矣。'谋逆之罪一般都是碎剐凌迟处死，念及蓝玉与自己是儿女亲家，朱元璋心一软，宽大处理：碎剐改成剥皮。这样，刽子手把蓝大将军全须全尾整张人皮剥下来，算是留了全尸，并把人皮送往他女儿蜀王妃处'留念'。明末农民军攻破蜀王府，在王府祭堂发现了这件'文物'。
朱标不死，蓝玉也不用死，蓝玉不死，蓝玉统领朝廷优势军力，哪有李景隆、朱棣的事情。朱棣靖难起兵'清君侧'的理由就牵强的。朱元璋为他的儿子朱标留了当时明朝超一流的武人集团班底做为儿子继承大统彻底清除北元而预备，而据史料记载蓝玉本人更对朱标忠心耿耿，然而天不遂人意朱元璋计划被打乱，太子死皇孙幼，朱标太子的武人集团班底全部被屠戮干净，最后落了个周亚夫的下场。
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