组建农民合作组织一般可以按下列程序运作：
1．成立筹备委员会，制定筹备工作方案。筹委会主要由发起人和有关工作人员组成，必要时应成立专门办事机构，具体负责筹备和制定工作方案。工作方案包括为什么筹建该合作组织，由谁牵头发起，会员入会条件及合作组织筹备程序等。
2．由发起人拟定社名，确立业务范围。发起人一般由5—7人组成，由发起人会商拟定合作组织名称，确定本组织业务区域、业务项目、经营方式，并说明发起成立的缘由，预计会员人数及筹集的资金总额等。
3．准备发起申请书。将上述发起人讨论研究确定的内容填入合作组织发起申请表，并同时准备好申请报告。申请报告内容主要包括：本社宗旨，业务范围，经营效益，内设机构和下属组织等。
向有关部门申报批准，主要是便于合作组织的主管部门与发起人加强联系，加强业务指导和管理。主管部门接到合作组织发起人报送的组建申请书后，应认真进行审查，包括发起人是否有组织能力，该合作组织业务数量是否达到组建规模，预期效益如何等等。基本符合条件后，即可下达同意组建批复。
申请人接到主管部门准予组建的批复公文后，应即时召开筹委会，吸纳会员，参照有关示范章程拟定本组织章程及业务计划草案。
依托有关部门和社会力量创建的合作组织，应注意吸纳足够数量的农民成员参加理事会和监事会。
在上述各项筹备工作任务完成后，即可呈请当地合作组织主管部门派员出席指导，并于合作组织成立7日前，通知会员参加大会，如会员较多，则可按规定要求选派会员代表出席成立大会。成立大会一般包括如下议程：
1．主持人宣布本合作组织加入成员名单、人数、代表人数，如到会人数符合成立合作组织成立有关规定后，即宣布成立大会开始。
2．筹委会负责人作合作组织筹备工作报告。
3．主管机关负责人宣布本合作组织成立的批复。
4．宣读章程草案，并请讨论后表决通过。
5．提出理事会、监事会候选人名单，并进行选举。
6．理事会、监事会分别召开第一次会议，推选常务理事、理事长和监事长。
7．主持人宣布常务理事、理事长、监事长等人选名单。
8．理事长、监事长讲话。
9．党政领导和有关社会各界代表讲话。
10．宣布成立大会结束(会议记录规格附后)。
1．召开工作会议，成立办事机构。由理事长主持常务理事工作会议，研究成立合作组织办事机构和有关业务指导部门。业务大的合作组织，可由理事长聘任总经理。
2．聘任办事机构业务部门负责人，业务量小的合作社，由理事长直接聘任，设置总经理的由总经理聘任部门负责人。由各部门负责人招聘精干业务工作人员。
3．召开业务会议，由理事长或总经理主持、有关业务部门参加讨论研究工作计划，布置和开展合作社业务工作
开章（3天时间）
开农民合作社公章、财务章、法人章、三章在公安局备案。
登记
1．到农业局部门农经办进行登记，需要代工商注册证件、合作社简介、地址、电话、法人姓名。
2．有农经办主管部门出据的代码证复印件，到当地质监局办合作社代码证。
办证
3．以下为质监局流程
办理组织机构代码证（需1周时间）
本步骤手续和所需资料由相关部门提供并完成，前往质监局办理组织机构代码证，核发代码证正副本和代码卡后质监局流程结束。
1. 《企业法人营业执照》原件、复印件各一份 ；
2. 农经办主管部门出据的代码证复印件；
3. 法定代表人《居民身份证》原件、复印件各一份；
4. 代公章。
以下为税务局流程：
办理税务登记证
一、提供资料：
1.《企业法人营业执照》原件、复印件各一份 ；
2.《组织机构统一代码证》原件、复印件各一份 ；
3. 合作社章程、复印件各一份；
4. 法定代表人、财务负责人和办税人员的《居民身份证》原件、复印件各一份；
5. 经营地的房产权或使用权或租赁证明原件、复印件各一份。
农行开户流程；
1.《企业法人营业执照》原件、复印件各一份 ；
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