元朝政府发表他为汝宁府(汝南)的达鲁花赤。(元朝在每一个路或府，与每一个县，均设达鲁花赤，由蒙古人或色目人或其他的“非汉人”充任，位于汉人总管与县尹之上。)此后，他东征西讨，到了至正十八年之时，已经官拜“陕西行省右丞兼陕西行(御史)台侍御史兼河南行枢密院同知”，受诏“守御关陕晋冀，镇抚汉沔荆襄，便宜行间外事”。这一年年底，他被升为陕西省平章政事。次年五月，他“收复”汴梁(开封)，使得刘福通不得不退守安丰(寿县)，元朝升他为“河南行省平章政事，兼知河南行枢密事，陕西行台御史中丞，仍便宜行事”。他兼了豫陕两省的文武行政，同时握有监察全权。至正二十一年，他拿下了全部山东，只有益都和莒州尚在香军手中。元朝更进一步，升他为[中央的]中书平章政事(位置仪次于丞相)，兼“知河南山东行枢密院事，陕西行台御史中丞”，地盘由两省而扩充为三省(比现在的这三个省大)。
这一年八月间，朱元璋为了怕他转师南下，派了一个小官，汪河，前往山东，和他“通好”。通好的内容如何，明朝的官方历史家不敢明说。(实际上可能是向元朝称臣。)次年六月，察罕帖木儿被田丰、王士诚刺死。他的事业，由养子王保保(扩廓帖本儿)继承。王保保在五个月后打下益都，杀了田丰、王士诚，也打下了莒州。王保保派人到应天(南京)，与朱元璋重温旧好，朱元璋再派汪河前往，却被王保保扣留，拘在河南陕州。一拘，便是三年，到了至正二十五年才放回来。 王保保的为人，不如察罕帖木儿：野心大，地盘思想重。和王保保势均力敌的，有一位孛罗帖木儿与一位李思齐，孛罗帖木儿与王保保抢山西，抢中央的政权；李思齐呢，和王保保闹意气。结果，内战连年，给朱元璋造下北伐中原的机会。
孛罗帖木儿，是道地的蒙古人。他的高祖父的祖父，孛罗带，是成吉思汗的卫兵。孛罗带的儿子太答儿，是蒙哥可汗(元宪亲)的一个都元帅。太答儿的儿子纽璘，打下成都，也受委为都元帅。纽璘的儿子也速答儿，打下重庆，历事元世祖、成宗、武宗，官至云南行省左丞相平章政事。也速答儿的儿子南加台，作了四川行省平章政事。南加台的儿子答失八都鲁，是元顺帝的大将，曾经打下香军所占的襄阳与太康，官至河南行省左丞相，兼知枢密院事，加“开府仪同三司，太尉”，四川行省左丞相，死于至正十七年十二月。答失八都鲁的儿子，便是孛罗帖木儿。
元顺帝在至正十八年正月，派孛罗帖木儿为河南行省平章政事，统率答失八都鲁的部队。在其后两年半的期间，他打下了卫辉(汲县)、濮州、曹州，击败关先生于云中，击败杨诚于蔚州及飞狐，击败王士诚于台州(五台)，驻军大同。这时候，王保保驻军在冀宁(太原)。元朝政府叫王保保与孛罗帖木儿两人各守防地，以石岭关为界。孛罗帖术儿一心要把冀宁划入自己的范围内，在至正二十年九月出兵逾过石岭关，对王保保作战，然而打不下冀宁。打到至正二十三年正月，他夺得了王保保的真定(河北正定)。
这时，元朝内部酝酿着宫闱政变。皇太子爱猷识理达腊，为“第二皇后”高丽人奇氏所生。奇氏信佛崇孔，见到元顺帝荒淫昏聩，颇想假借王保保的力量，逼迫元顺帝让位。她有一个亲信，宦官朴不花；也有一个羽党，右丞相搠思监。反对她的人也很多，以御史大夫老的沙为首。她却有办法叫老的沙失宠于元顺帝，加以放逐。老的沙逃奔到孛罗帖木儿的军营。皇太子派人去要，孛罗帖木儿不给。
至正二十四年三月，右丞相搠思监用元顺帝的诏书，削去孛罗帖木儿的兵权。孛罗帖木儿抗命，而且杀了钦差。四月，孛罗帖木儿带兵进京，见到元顺帝，恢复了兵权与官职(太保，中书平章政事，兼知枢密院事)，满意而去：回大同。五月，右丞相搠思监又怂恿了元顺帝，命令王保保进攻孛罗帖木儿的大同。孛罗帖木儿再度带兵来京，皇太子统率若干军队出城抵御，大败，逃到太原，投奔王保保。元顺帝把搠思监与朴不花押解给孛罗帖木儿，杀掉。孛罗帖木儿进入大都，受拜为中书左丞相，整个政府入于他的掌握。他开除了一些宦官，禁止番僧胡作非为，努力节省中央开支，停止了若干不必要的修缮营造，也把第二皇后禁闭了一百多天。他派遣一位伊苏，带兵南下，打王保保，不料这伊苏却与王保保讲和，连在一起。
至正二十五年七月，王保保的兵逼近大都，元顺帝埋伏了几个勇士在宫内延春阁，把孛罗帖木儿打死。八月，第一皇后宏吉剌氏去世。九月，王保保带了太子回大都，被拜为太傅，左丞相。事前事后，第二皇后奇氏与太子均叫王保保逼迫元顺帝让位，退居为太上皇，王保保不肯。王保保在大都住了两个多月，不耐烦，请求元顺帝派他打朱元璋。元顺帝封他为“河南王”，授权给他“总制关陕晋冀山东诸路并迤南一应军马，凡机务钱粮黜陟予夺，悉听便宜行事。”年底，第二皇后奇氏被升为第一皇后。
王保保去了怀庆(河南沁阳)；次年二月，渡河南进。他征调在陕西的李思齐、张思道、孔兴、脱列卜这四个将领的兵。这四人均不奉命。王保保于是不再南进，而转师西向，派关保进人漳关，打这四人。一共打了一百多仗，不分胜负，到了至正二十七年七月，他加派貊高去打。貊高的兵，多半是孛罗帖木儿的旧部，开到中途，便在卫辉(汲县)叛变，捧貊高为“总兵”，向元顺帝上表，告王保保的状。这时候，元顺帝已经于第一皇后奇氏的影响之下，命令皇太子主持一个新立的“大抚军院”，“悉总天下军马”，把王保保的防区限制在潼关以东。
貊高叛变以后，元顺帝索性罢免王保保本兼各职，令他以“河南王”的资格，退居河南(洛阳)。王保保很气，便擅自把军队撤回黄河以北。关保在陕西，也对王保保叛变，不再打李思齐等人。元顺帝命令貊高与李思齐合力，讨伐王保保；又把王保保的根据地划给关保驻防。李思齐倒未敢走出潼关，找王保保打；貊高、关保二人，与王保保交锋，均被王保保击败，杀死。王保保回到太原，不肯出来抵御朱元璋的北伐军。
这一年，至正二十七年，十月甲子日，朱元璋命令徐达、常遇春一人统率二十五万大军，北伐。先打山东，后打河南，然后打河北，指向大都。王保保原有一个弟弟，脱因帖木儿，带领若干精兵留在山东，为了对貊高作战，这脱因帖木儿被调走，山东只剩下江苏兴化人王宣和他的儿子王信。这王宣与王信父子是经不起徐达、常遇春一打的。
徐达、常遇春由山东转到河南，在汴梁(开封)的梁王阿鲁温不战而降。这位阿鲁温，是察罕帖木儿的父亲，年已老迈。元顺帝到了最后关头，才下诏取消“大抚军院”，恢复王保保的官职与爵位，求王保保救援大都。王保保不曾来得及整师而出，大都已经入于徐达、常遇春之手。
元朝的宫闱、朝廷、将帅，如此内哄不已，就朱元璋看来，真是天造的机会。恰好在这时候，他早已打平了陈友谅与张士诚两个劲敌，剩下的仅有卑卑不足道的方国珍、陈友定、何真、也儿吉尼之流。所以，他一面分兵南讨，一面在“吴元年”(至正二十七年)十月甲子日，任命徐达为征北大将军，常遇春为征北副将军，率领二十五万主力北伐。
两天以后，丙寅日，他发布一篇宋濂所起草的檄文：“自宋祚倾移，元主中国，此岂人力，实自天授。(这是说，蒙古人没有什么了不起，当年宋朝该亡罢了。)自是以后，元之臣子不遵祖训，废坏纲常，有如大德(元成亲)废长立幼，泰定(泰定帝)以臣弑君，天历(元明宗)以弟鸩兄；至于弟收兄妻，子烝父妾，上下相习，恬不为怪。夫人君者，斯民之主。朝廷者，天下之本。礼义者，御世之防。其所为如彼，岂可为训于天下？(这是说，元朝君臣违背中国的伦理传统，失去统治资格。)及其后嗣，荒淫失道(指元顺帝)，加以宰相擅权(指脱脱)，宪台报怨(指御史大夫朵儿直班，宣政院使哈麻，御史袁赛因不花)，有司毒虐，于是人心离叛，天下兵起。使我中国之民，死者肝脑涂地，生者骨肉不保，虽因人事所致，实天厌其德而弃之也。”
“当此之时，天运循环，亿兆之中当降生圣人，立纲陈纪，救济斯民(这是“弥勒佛转世”的预言的改版)。今一纪于兹，未闻有济世安民者(韩林儿、徐寿辉、陈友谅、张士诚，皆不足以成事)，徒使尔等[齐鲁河洛燕苏秦晋之人]战战兢兢，处于朝秦暮楚之地，诚可矜悯。”“方今河洛关陕，虽有数雄，阻兵据险，互相吞噬，皆非人民之主也(指王保保、李思齐等人)。”
‘予本淮右布衣(平民)，因天下乱，为众所推，率师渡江，居金陵形势之地，得长江天堑之险。今十有三年，西抵巴蜀，东连沧海，南控闽越，湖湘汉沔，两淮徐邳，皆入版图，奄及南方，尽为我有，民稍安，食稍足，兵稍精。(“稍”字用得好，于谦虚中显出力量。)日视我中原之民，久无所主，深用疚心。”
“予恭承天命(大胆假设)，罔敢自安，方欲遣兵北伐，拯生民于涂炭，复汉官之威仪(比起刘福通之“复宋”，进了一步)。虑人民未知，反为我雠，挈家北走，陷溺尤深，故先谕告：兵至，民人勿避!子号令严肃，无秋毫之犯，尔民其体之！(只要你们人民作消极的欢迎，不希望体们作积极的参加。推翻元朝的事，有我朱元璋派兵去打，就够了。)”
事实上，朱元璋交给徐达统率的二十五万精兵、先声夺人无可抗拒，元朝本身又已分崩离析，上无斗志，连蒙古人也很少有效忠元朝到底的了，何况“色目”？肯在山东抵抗徐达的元朝将领，仅有三个汉人——王宣、王信和俞胜，以及一个蒙古人——普颜不花。王宣与王信是父子，替元朝守沂州(临沂)及胶东一带，本已投降，降后想叛，王宣被杀，王信逃走。俞胜守乐安(惠民)，也是降了又叛，战败逃走，其后被捉。普颜不花守益都，不堪徐达一击，城破，被杀。
肯在河南抵抗徐达的元朝将领，仅有王保保的弟弟脱因帖木儿一人。这人就名字而论，和他哥哥(“扩廓帖木儿”)一样，像蒙古人，其实也是汉人(至少是在父系血统上，母亲是否属于纯西夏血统，待考。他们的母亲，是察罕帖木儿的妹妹。)脱固帖木儿领了五万兵在洛阳东边的塔儿湾打了一仗，打败，逃往陕州；在陕州也守不住，逃去山西他哥哥那里。
徐达遵照朱元璋的指示，于肃清山东之后，不向北续进，转师西向，肃清河南；也不向西续进，随即集合在山东河南的大军，会师运河与卫河的交叉点，临清，以雷霆万钧之力，冲破河北，由长芦(沧县)，青州(青县)，直沽(天津城北)，直捣通州(通县)。在直沽逋州之间的河西务，遇到元朝的俺普达朵儿只进巴，打了一仗；在通州城郊，遇到元朝的“知枢密院事”卜颜帖木儿，也打了一仗。
这两仗打完了，元顺帝听到消息，率领老婆(第一皇后奇氏)、儿子(太子爱猷识理达腊等人)、孙子(买的里八剌等人)与妃子、太监、宫女，在至正二十八年(洪武元年)七月丙寅日(二十七日)的夜里，偷偷地开了大都的建德门，向着居庸关的方向逃去，逃往“上都”(在明朝叫做开平，在令天是内蒙古的多伦)。 隔了三天，八月初二日庚午，徐达由齐化门进入大都，只杀了不肯降的元官六名，对老百姓秋毫无犯。元朝的历史，到此结束。明朝，已经在这一年正月元旦，朱元璋在应天(南京)称帝之时开始。
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