导读：EB病毒(EBV)相关胃癌(GC)表现出有趣的免疫治疗反应。然而，EBV压印肿瘤免疫和治疗反应的细胞基础仍不明确。
近日，中山大学徐瑞华及澳门大学张海燕共同通讯在《Signal Transduction and Targeted Therapy》（IF=39）在线发表题为“Dynamic single-cell mapping unveils Epstein-Barr virus-imprinted T-cell exhaustion and on-treatment response”的研究论文，该研究通过纵向scRNA-seq和配对scTCR/BCR-seq精细表征了免疫化疗治疗人EBV (+) GC的动态肿瘤免疫环境。
研究背景
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胃癌（GC）仍然是癌症相关死亡的主要原因，在全球范围内，特别是在东亚，胃癌患病率很高。在过去十年中，免疫检查点抑制剂（ICIs）的引入为各种类型的癌症的治疗方法带来了重大转变。然而，PD-1/PD-L1通路阻断作为单一疗法的临床有效性仅在约10%的胃癌（GC）患者中观察到，在化疗中添加抗PD-1 / PD-L1抗体在先前未经治疗的晚期胃癌（GC）患者中显示出与单独化疗相比的更好疗效。因此，这种组合被提议作为GC患者的新标准一线治疗。尽管有这种有希望的临床进展，但只有一小部分GC患者可能从免疫化疗中获得持久的益处。因此，仍然迫切需要确定预测临床反应的生物标志物。在这方面，目前正在评估爱泼斯坦巴尔病毒（EBV）阳性，似乎很有希望。
EBV（+）GC是由癌症基因组图谱（TCGA）研究网络确定的一个不同子集。越来越多的数据，包括我们团队的前瞻性临床试验，表明EBV（+）GC中的ORR至PD-1抑制剂比EBV （−） GC高~25%。尽管在理解EBV（+）GC的临床特征方面取得了重大进展，但有关病毒-宿主免疫相互作用及其独特特征的重要问题仍然存在。理解EBV（+）GC中对免疫治疗的超敏反应，对理解所涉及的特定免疫反应至关重要。
晚期EBV（+）GC和EBV（−）GC的独特单细胞免疫景观
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在执行主成分分析（PCA）或使用均匀流形近似和投影（UMAP）可视化数据之前，我们首先合并并归一化了所有样品，以构建患者之间的参考细胞图谱。这样做是为了考虑转录谱中的任何批次效应。经过数据预处理和质量控制，我们将免疫细胞分为六个主要簇：T细胞，NK细胞，B细胞，浆细胞，骨髓细胞和肥大细胞（图1d）。细胞的聚类由已建立的标记基因的共同表达特征决定（图1e）。每个单独的样本为所有细胞亚群贡献了代表性细胞。批量效应的影响很小。
EBV（+）GC和EBV（−）GC 之间的直接比较显示，前者具有更发炎的免疫表型，其中 T 细胞和 B 细胞浸润更多。EBV（−）GC显示免疫抑制肿瘤微环境（TME），浆细胞，骨髓细胞和肥大细胞富集（图1f）。两组B细胞和浆细胞均显著增加，而髓系细胞在联合治疗后均呈下降趋势，表明主要免疫细胞类型发生动态变化。T细胞是与治疗反应相关的主要免疫细胞簇。通过检查所有T细胞（n = 48,070）中配对的TCRα和TCRβ库，我们发现EBV（+）GC中61.48-73.12%的T细胞含有至少一个生产性TCRα或β链;EBV（−）GC中35.30–70.43%的T细胞具有多个克隆型。此外，EBV（+）GC中13.50-33.41%的T细胞过度扩增（100
研究结果
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最近单细胞RNA测序(scRNAseq)在肿瘤微环境研究中的应用为浸润肿瘤的免疫细胞的生物学提供了有价值的见解此外，破译浸润T/B细胞的精确TCR/BCR克隆型增强了人们对适应性免疫反应的理解，并为确定潜在的治疗靶点提供了有价值的见解。在这项研究中，作者使用scRNA-seq和单细胞TCR/BCR测序技术，表征了EBV(+)和EBV (-) GC患者在免疫化疗前后的动态肿瘤免疫环境。通过研究免疫化疗耐药和敏感性的潜在机制，可以发现对治疗有反应的特定免疫细胞亚型。该研究描述了EBV压印治疗T细胞免疫在GC中的独特含义，这可以用于优化精确免疫治疗的合理设计。
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