在线绘制热图

2017-05-05 sxr 生信人

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功能介绍 共同学习生物信息学知识，共同探究生物奥秘。

在科研工作中经常会遇到热图的绘制。但是热图的绘制工具不是很简单，没有简单的图形页面，对于那些不太懂命令行的人来说绘制热图非常复杂，而且超级没有效率。

那么有没有一个款在线工具，提供简单的窗口，然后绘制热图，而且绘制的还是相当可以的呢。小编这次就推荐一款软件Matrix2png。

Matrix2png是进行微阵列数据和许多其他数据类型的可视化。一个简单但功能强大的程序它可以从文本文件的数据生成PNG格式的图像。它快速,易于使用和合理灵活。它可以用于生成可发布图片,或作为图像发生器为web应用程序。使用于各种数组型数据。

特点

目前只支持PNG格式输出

支持linux操作系统

输入格式简单

可以下载到本地运行

下面主要介绍这个工具在线如何使用

首先看一下支持的文件格式

输入文件时需要将文件保存为txt文件，然后上传

完成上传之后要对图像的显示进行简单的设计

这里有每个元素的大小选择，是否显示零的那些元素，是否利用○来代替矩形等。

完成以上设置之后，接下来要对颜色进行设置。

颜色包括背景颜色，缺失值颜色。对比度等。

还有一些其他的用法，又掉高达上，暂时没有理解，大家想仔细了解，就自己去研究吧。

设置完毕颜色之后可以对图像的布局和绘制进行设计。如是否显示坐标，lable等。还可以对数据进行选择等。

绘制的效果如下：

更多的功能等着你自己去研究。

工具网址：网址：http://www.chibi.ubc.ca/matrix2png/bin/matrix2png.cgi

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