如果我知道了一堆基因的启动子，是不是就能知道调控这些启动子的转录因子呢？对，就是把转录因子找出来。
于是给你们介绍这款简单的软件，叫BETA……嗯，不是开坦克那个……
这个软件，主要用于分析启动子上的转录因子。啥？听多了是吧，我有一个你应该认真学会这个工具的理由，不过今天我不会告诉你，我只能说，今天的不认真看，以后就后悔了……嗯，是这样的……
这个软件可以下载，当然，也可以在网页上应用。就是要到这个盖乐世/西斯特罗姆上去，当然这个里面整合了很多功能，我们只用其中的beta就够了。
首先导入你的数据，这个数据必须是酱婶格式的，千万不能变哦，这个格式是指示序列所在染色体的位置，其实这个是用来分析ChIP-Seq的软件。
蓝后，选择BETA下面的Motif里的SeqPos Motif Tool。
你会看到这样的界面，这个工具是通过Tranfac，JASPAR这些数据库来具体分析的，好了，选上就行了。
最后，你就会得到一个这样的结果，这些序列所对应的转录因子，主要就是这些了……
李莫愁博士：有人想知道，学会这个能干嘛？当然能有不同的作为啦，这是一种分析mRNA表达芯片的套路，分析差异基因，挖掘导致这些基因表达差异的转录因子。如果机智的同学，可能就已经知道我为什么这么分析了。好了，今天就先策到这里吧，下次再告诉你，要怎么用这个来挖转录因子。要知道这个网址，就回复“BETA”就行了……
联系客服
