模式生物在科研中的重要地位不必多说,今天给大家汇总了一下常用的模式生物数据库。
MGI,Mouse Genome Informatics,http://www.informatics.jax.org/
比如我们搜个TP53,可以查看基因信息, 相关疾病,突变、等位基因和表型的信息,不同组织中的表达量,GO注释信息,相关miRNA。
RGD,Rat Genome Databasehttp,http://rgd.mcw.edu/wg/home
RGD拥有着强大的在线分析和可视化的工具
比如蛋白之间的相互作用分析和可视化
SGD,Saccharomyces Genome Database,https://www.yeastgenome.org/
ZFIN,The Zebrafish Information Network,http://zfin.org/
基因信息查询
Xenbase,http://www.xenbase.org/entry/
Xenbase不仅提供了相应的基因信息查询,还提供了实验Protocols和试剂(抗体等)的查询
WormBase,http://www.wormbase.org/
这一数据库包含的物种较多,大名鼎鼎的秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)自然也包含其中。
同其它模式生物数据库一样,查询分析样样俱全
Flybase,http://flybase.org/
生物学家们是真的欠果蝇一个诺奖。。。但是又觉得这样说似乎对小鼠不太公平。。。
TAIR,http://www.arabidopsis.org/
在之前的文章有比较详细的介绍过,这里给一个传送门——植物研究,没你不行!
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