meta分析中千篇一律的森林图和漏斗图,难免让人审美疲劳,今天,我们就来试试不一样的森林图和漏斗图吧。
首先安装metaviz包进行森林图的绘制,输入以下代码:
install.packages('metaviz')
library(metaviz)
viz_forest(x = mozart[1:10, c('d', 'se')], study_labels = mozart[1:10, c('study_name')],
summary_label = 'Summary effect', xlab = 'Cohen d')
结果可得到以下森林图:
除了传统的森林图,我们也可以控制森林图的肥瘦,出现两种不同的森林图,这两种森林图在视觉上强调大型研究(在meta分析中置信区间较窄,权重较大),而小型研究(在meta分析中置信区间交宽,权重较小)在视觉上较不占优势。
输入以下代码
viz_forest(x = mozart[1:10, c('d', 'se')], study_labels = mozart[1:10, c('study_name')],
summary_label = 'Summary effect', xlab = 'Cohen d', variant = 'rain')
得到森林图
输入以下代码:
viz_forest(x = mozart[1:10, c('d', 'se')], study_labels = mozart[1:10, c('study_name')],
summary_label = 'Summary effect', xlab = 'Cohen d', variant = 'thick', method = 'FE')
得到森林图:
输入以下命令
viz_funnel(brainvol[, c('z', 'z_se')])
得到的漏斗图为
输入命令
viz_funnel(exrehab[, c('logrr', 'logrr_se')],
contours_col = 'Greys',
trim_and_fill = TRUE, trim_and_fill_side = 'right',
egger = TRUE)
得到的增强漏斗图为
得到的漏斗图是不是比你画的普通漏斗图要高大尚很多呢,比起普通的漏斗图,相信杂志也更青睐于这个漏斗图。
另外再介绍一种漏斗图,能评估meta分析结果的稳定性,它显示了假设有一个新研究(具有一定的效应和标准误)更新后对meta分析效应的影响。
输入命令:
viz_funnel(mozart[1:10, c('d', 'se')], sig_contours = FALSE, addev_contours = TRUE)
得到漏斗图:
如感兴趣的同学,可参考以下文献:
1 Anderson, L., Oldridge, N., Thompson, D. R., Zwisler, A. D., Rees, K., Martin, N., & Taylor, R. S. (2016). Exercise-based cardiac rehabilitation for coronary heart disease: Cochrane systematic review and meta-analysis. Journal of the American College of Cardiology, 67, 1-12.
2 Pietschnig, J., Penke, L., Wicherts, J. M., Zeiler, M., & Voracek, M. (2015). Meta-analysis of associations between human brain volume and intelligence differences: How strong are they and what do they mean? Neuroscience & Biobehavioral Reviews, 57, 411-432.
3 Pietschnig, J., Voracek, M., & Formann, A. K. (2010). Mozart effect-Shmozart effect: A meta-analysis. Intelligence, 38, 314-323.
4 Schild, A. H., & Voracek, M. (2015). Finding your way out of the forest without a trail of bread crumbs: Development and evaluation of two novel displays of forest plots. Research Synthesis Methods, 6, 74-86.
异次元点评
在meta分析中,森林图和漏斗图几乎是标配,千篇一律的图片让人审美疲劳,很难抓住读者的眼球,这几种森林图尽管不常见,有时候也可以尝试一下。三种漏斗图能提供的信息要比传统的漏斗图多,值得试试,但需要注意的是,Egger回归需要的样本量较大,如果纳入文献比较少,建议不要轻易使用。
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