一、因所得税收入的优惠形成的亏损处理
所得税收入上的优惠有免税收入、减计收入和加计扣除，这三类优惠会对所得税的亏损带来影响。
1. 所得税收入的优惠可能会产生所得税上的亏损
如A企业2017年会计利润50，该企业有60的股息红利，符合免税条件，没有需要调整的其他税会差异。在计算应纳税所得额时，收入的优惠是作为调减项，在计算所得额前扣减的，因此当年所得税上所得为-10。由于收入的优惠产生了所得税上的亏损。
2. 收入优惠产生的亏损如何处理？
免税收入、减计收入和加计扣除等税基式优惠，如因优惠形成了亏损，这部份亏损和一般亏损一样的待遇，可在5年内结转弥补。国税函〔2009〕98号第八条规定，企业技术开发费加计扣除部分已形成企业年度亏损，可以用以后年度所得弥补，但结转年限最长不得超过5年。
除了上述三种优惠外，其实还有一项类似的优惠，就是固定资产加速折旧。加速折旧政策是允许会计上不加速、所得税上加速计提折旧的，税收和会计的差异是通过纳税调整表反映的。因此，加速折旧可能会形成所得税上的亏损、形成的亏损可在5年内结转弥补。因此对新办企业来说，如何利用好资产加速折旧政策，是门技术活。
二、查补的所得能否弥补亏损
A企业15年亏损30，16年亏损10,17年亏损10。18年稽查中，发现16年少计所得50，要调增所得50。查补所得能否弥补相关年度亏损？
1. 根据总局2010年20号公告规定，这查补的所得50，允许弥补16年的亏损10。
2.弥补16年亏损10后，能否弥补15年结转下来的亏损问题。这个问题尚有争论，原因是20号公告讲清楚了查补所得可弥补查补当年的亏损，没有十分明确可弥补查补年度以前年度的亏损。目前主流观点是查补的所得，可以弥补查补年度的以前年度结转下来的亏损。但在弥补时必须考虑到下列问题：
如举例中17年是有利润的，要考虑15年的亏损，有没有在17年已经被弥补？如果在17年被弥补了，查补所得能否再弥补？
如果可弥补15年亏损，16年以后所有年度的所得税申报表都要调整，都要重新申报一次。这样处理工作量非常大，同时还要考虑到，如果所得额计算引起适用税率的变化如何处理问题。
年度跨度长话，是否有已经作废的亏损又可弥补情况？
3. 查补的所得，不能弥补查补年度的以后年度的所得，即不能弥补17年亏损。
三、减资弥补亏损问题
总局11年34号公告对撤资减资的所得税处理作出了规定。实践中争论最大问题是：投资方在撤资减资过程中，是否会形成损失？形成的损失能否在所得税前扣除？先来看下34号公告的原文：
小标题：投资企业撤回或减少投资的税务处理
第一段：投资企业从被投资企业撤回或减少投资，其取得的资产中，相当于初始出资的部分，应确认为投资收回；相当于被投资企业累计未分配利润和累计盈余公积按减少实收资本比例计算的部分，应确认为股息所得；其余部分确认为投资资产转让所得。
第二段：被投资企业发生的经营亏损，由被投资企业按规定结转弥补；投资企业不得调整减低其投资成本，也不得将其确认为投资损失。
有很多专家认为撤资减资过程形成的亏损不能在税前扣除。理由有二，一是34号文第一段讲到了所得确认，并没有讲到亏损确认。二是34号文第二段讲了被投资企业亏损由被投资企业自行弥补。这二段话真正含义是什么？
个人认为34号文件这二段话各有所指。第一段是针对一般的撤资减资的税务处理，也就是平时常见的实质减资。实质减资是股权处置的一种途径，所得税处理上按收回成本、确认股息红利、确认所得三段论处理。实质减资和股权转让、企业清算一样，持有的股权灭失，股权处置时会形成损失，形成的损失可在所得税前扣除。
第二段是指减资弥补亏损的所得税处理。实践中有一类比较特殊的弥补亏损方法，就是通过减资补亏。被投资企业通过减少实收资本形式弥补亏损，把未分配利润负数冲成0。这时投资方往往会进行这样会计处理：
借：投资收益
贷：长期股权投资
会计上既调减了股权投资成本，又将被投资方发生亏损，在没有达到清算或真正股权消失时，确认为自己的损失。所以34号第二段，是针对这种特殊的减资方式或者特殊的弥补亏损，作了专门强调，不允许投资方在股权持有环节，确认投资损失或者调整计税基础。
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