随着新技术的发展，尤其是高通量测序技术的出现，使得研究者的目光越来越多地聚焦到基因组上非编码基因序列上，它们对生物发育、疾病产生及发展起重要作用。
4月5日，国际著名学术杂志《Cell》在线上发表一篇来自MD Anderson梁晗团队的文章显示，通过首次大规模研究来自33个癌种8928个癌症病人样品中增强子的表达，发现大部分癌种中都大量存在着表达的增强子，为泛癌种中提供了增强子表达的全景描述。同时，发现增强子表达与非整倍体变异成正相关。
近日，梁晗在《Cell》上为美国癌症基因组项目（TCGA）泛癌分析的所做的前沿专访中表示：“通过癌症基因组项目，很多新的遗传因子在癌症发展中作用逐渐被揭示，包括非编码区。同时，通过癌症多重组学分析，生物信息和计算生物工作者已经成为癌症研究的主力军。”
梁晗教授接受Cell专访，左边是NCI的Director，右边是NHGRI的Director
据介绍，在癌细胞中，调控网络通常会“重新布线”导致癌症，但对这种重新布线的发生研究有限。研究小组揭示了增强子作为拼图游戏的一个组成部分，表明增强子是包括程序性死亡配体-1（PD-L1）在内重要治疗靶标的关键调节因子。
PD-L1是抑制免疫系统的因子，促进癌症形成和生长，是许多现有和新兴免疫疗法的关键靶点。使用来自癌症基因组图谱（TCGA）的RNA测序数据，梁晗团队对33种癌症类型的8，928个肿瘤样品进行了大规模分析，并鉴定出相当数量的增强子，包括PD-L1的增强子。
“我们的研究系统地鉴定了不同肿瘤中增强子活性，提出了抑制关键治疗靶点一个新的策略，”梁晗说，他们还确定增强子可以作为生物标志物，通过检查靶向脾酪氨酸激酶（SYK）的增强子，其与多种类型的晚期癌症相关。结合患者的生存期，他们发现这个增强子的高表达是多种癌症类型预后差的标志。
基于对TCGA数据的分析，梁晗团队提出一个模型，即染色质可能是某些增强子激活过程的关键贡献者，它提供了基因突变和克隆如何演化为某些癌症的解释。
“单个肿瘤祖细胞染色质结构的变化可能会在肿瘤细胞生长过程中积累产生显着的差异。染色质结构可被突变的组蛋白进行重塑，这在癌症中经常见到。”梁晗说，他们观察到了增强子在癌症基因组中的“开”和“关”，为细胞如何一步步转化成肿瘤提供了新的观点。
当然，梁晗团队的分析只是揭示了许多与癌症基因相关的增强子，后续还需要更多的努力，来进一步研究增强子在临床应用中的潜力。
梁晗简介：
梁晗是普瑞基准科技联合创始人、首席科学家，同时还是MD Anderson癌症中心生物信息与计算生物学系副系主任，他还担任国际癌症基因组多种癌症科学组免疫基因组共同主席以及美国癌症基因组多种癌症临床和预测科学组主席。在过去年5年间，梁晗带领团队以TCGA 数据为主题，发表了一系列影响力文章。
