旧金山湾区的世界著名高等学府包括私立型的斯坦福大学(Stanford University)[4] 和公立型的加州大学伯克利分校(University of California,Berkeley)[5] ,以及世界顶级医学中心加州大学旧金山分校(University of California, San Francisco)。而位于伯克利的劳伦斯伯克利国家实验室(Lawrence Berkeley National Laboratory)[6] 和位于斯坦福的斯坦福直线加速器中心(Stanford Linear Accelerator Center)[7] 等众多美国顶级国家实验室也分布于旧金山湾区各地。旧金山在20世纪及21世纪初一直是美国嘻皮文化和近代自由主义、进步主义的中心之一,还有全美最大的艺术设计院校——旧金山艺术大学(Academy of Art University)。