1、无电离辐射的危害。磁共振成像（MRI）是一种安全的检查方法，磁共振设备的激励源为短波或超短波段的电磁波，无电离辐射。
2、多参数成像。MRI是一种多参数成像方法，它主要测量的是人体组织中的氢质子密度的空间分布及其弛豫时间，也就是说它主要利用的是人体内水（H20）的氢原子核，所以之前说“核”磁共振，大家不用担心，不能谈核色变，这里的核只是水的氢原子核而已，磁共振检查不会损伤身体。
3、高对比度成像。MRI的软组织对比度在所有的医学影像技术中最高。因为人体含有占体重约70%的水，这些水的氢核是磁共振信号的主要来源，其余信号来自脂肪、蛋白质和其他化合物中的氢原子。水与脂肪、蛋白质等组织中氢质子的磁共振信号强度又不同，故磁共振图像是高对比度的。
4、磁共振成像设备具有任意方向断层的能力，可获得横断、冠状、矢状和不同角度的斜断面图像。这使得各部位的病变得到360度无死角的全面显示，而不会被其它部位或者组织遮挡。最主要的是不用让被检者来回变换体位，来回折腾。
5、可直接显示心脏和血管结构。它不需要注射对比剂，是一种无创伤、全新的血管造影技术，它还可以通过电影的形式显示各心动周期的图像，让心脏疾病显示的更加清晰，而且还能进一步评判心脏功能。
6、无骨伪影干扰，使得后颅窝病变清晰可变。各种投射性成像技术往往因气体、骨骼的重叠而形成骨伪影，比如头颅CT出现的条状伪影，磁共振成像就不会出现此类骨伪影。
7、 可进行功能、组织化学、生物化学方面的研究。任何生物组织在发生结构变化之前，首选要经过复杂的化学变化，然后才发生功能改变和组织学异常。以往的影像诊断方法一般只是提供单一的解剖学资料，没有组织特征和功能信息可利用。功能磁共振的出现使得影像诊断达到分子生物学和组织学的水平。
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