厄难重至，第二次物种大灭绝

泥盆纪陆地面积增大

泥盆纪海洋

　　第二次大灭绝发生在晚泥盆世，这是5次大灭绝中唯一发生在次一级时间单位内。随着志留纪末期发生的全球性加里东构造运动，使很多地方上升为陆地，海区大大缩小，加上当时气候比较温暖，所以各种珊瑚、腕足、层孔虫、苔藓虫、竹节石、介形类、牙形刺以及各种鱼类都得到空前发展，维管植物在陆地也很快传播，唯笔石、三叶虫属种迅速减少。

　　三叶虫在数量上极大地减少，然而个别特大的种却可大到74 厘米长。

　　有学者认为由于造山运动影响，海平面变化频繁，缺氧事件常发生（形成黑色页岩），或可能天体撞击等，所以泥盆纪共发生82次大大小小生物灭绝事件，其中较大的有3次。第一次：在距今3.75亿年的中泥盆世末，称法西塞拉斯灭绝事件，由于气温上升，海平面升增高，致使腕足类6个科、四射珊瑚16科灭绝了，菊石类三个科大部分属种也灭绝了，但却迎来了漂浮的牙形类、介形类等的大发展；第二次：在距今3.65亿年的晚泥盆世早期（弗拉斯期）和晚期（法门期）之间，称凯勒瓦瑟尔灭绝事件，由于气温变冷，海平面下降，造成了喜温、成礁的四射珊瑚、层孔虫、海绵类全部灭绝了，非造礁四射珊瑚类的10多个科、腕足动物门的无洞贝类、齿扭月贝类、五房贝类也相继灭绝了，盛极一时的软体动物门的竹节石纲也灭绝了，这是泥盆纪最大的一次生物灭绝；第三次：在距今3.55亿年的晚泥盆世末，称享根贝格灭绝事件，盛行于晚泥盆世的腕足动物门的早期石燕类、菊石类海神石目全部灭绝、三叶虫几个目也全部消亡，鱼类的盾皮鱼纲和无颌鱼纲全部灭绝，浮游藻类植物也有大量物种灭绝。在陆地植物界所受灭绝事件影响不大。

盾皮鱼纲和无颌鱼纲全部灭绝

　　每一次生物灭绝后都会形成生物界的复苏，故石炭纪生物群面貌与晚泥盆世就迥然不同，如腕足动物门的长身贝类和石燕贝类得到空前的大发展；珊瑚类也如此。