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1月28日，日本政府内阁会议决定并公布了一项政令，将新型冠状病毒传染病分别指定为基于《感染症法》的“指定感染症”和基于《检疫法》的“检疫感染症”。(政令规定的“指定感染症“期间为自实施之日以后的同日起至经过1年之日为止)。
根据《感染症法》对“指定感染症”的指定，自实施之日起，申请入境的外国人，若被医生视为冠状病毒患者，则符合出入境管理及难民认定法第5条第1项第1号不许入境的事由。
另外，鉴于新型冠状病毒被指定为《检疫法》的“检疫感染症”，实施日以后，检疫官有权命令疑似感染者接受诊察、检查，即使是获发了签证的人也不例外。
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日本时间1月31日凌晨，WHO（世界卫生组织）宣布新型冠状病毒传染病为国际关注的突发公共卫生事件（PHEIC）。基于此，为了防止传染在日本国内扩大，日本政府决定将新型冠状病毒传染病指定为《感染症法》中的“指定感染症”以及《检疫法》中的“检疫感染症”的措施实施时间由原计划的2月7日提前到2月1日。
与此同时，即使没有确认感染，也将大幅加强入境管理，通过安全保障会议决定并且内阁会议同意以下事项：
“法务大臣宣布在一段时间内，将把申请入境日本当日之前的14天内有中国湖北省停留史的外国人，以及持有该省发行的该国护照的外国人（除特殊情况外）视为符合《出入境管理及难民认定法第5条第1项第14号》条例所指（不许入境）。”
以上措施和“指定感染症”及“检疫感染症”的实施，于日本时间2月1日上午0点开始执行。
日本时间2月1日上午0点起，新型冠状病毒患者，持有湖北省发行的中国护照的或申请入境日本当日之前的14天内有该省停留史的外国人，即使是获发了有效的多次签证也不许入境。
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根据以上的政令及决定，日本国驻上海总领事馆对今后签证申请采取以下措施。
（1）持有湖北省签发的中国护照的申请人，除特殊情况外，签证申请原则上不予受理。
（2）在申请签证时，要求所有的申请人提交确认书，选择“（在预计访日时间的前14天内）去过”或“（签证发放后，在预计访日时间的前14天内）有计划去”湖北省的申请人，签证申请不予受理。
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