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福利来了!NIPT检测报告 1 1 1


导语:高通量测序技术的发展,使得胎儿染色体结构异常的无创产前检测成为下一个NIPT临床应用的热点,NIPT迎来了亚染色体水平检测新时代。


经过近几年的临床实践,无创产前DNA检测(NIPT)技术已在全世界范围内得到广泛应用,其对于21三体、18三体及13三体综合征检测的高灵敏度和高特异性,受到了临床医生和孕妇的一致认可。随着技术的发展和临床实践的深入,NIPT的检测范围已逐步扩展到染色体微缺失/微重复等亚染色体水平的结构异常的检测。


染色体结构异常所导致的疾病种类较多,综合发病率也较高,部分患病胎儿宫内表型并不明显,难以通过唐氏筛查、B超等传统产前检查手段发现异常。但携带此类染色体异常的胎儿出生后,往往具有严重的生长发育和智力异常,并且合并多种疾病或脏器损伤,难以治愈。这使得包括染色体微缺失/微重复在内的其他类型染色体异常的产前检测成为临床新需求。


安诺优达作为卫计委首批高通量测序技术临床应用试点单位,一直致力于推动NIPT技术的发展和临床转化。针对新的临床需求点,安诺优达扩充了NIPT的检测范围,在NIPT检测过程中,如发现其他染色体异常,均会以补充报告的形式通知受检者和临床医生(受检者自愿知情),并将为受检孕妇再免费赠送NGS染色体异常检测从而为临床选择合适的诊疗方案的提供参考。


案例 1


范某,41岁,女,末次月经2015.12.19,G3P1,自然受孕单胎。NT值在正常范围内,中孕期唐氏筛查显示21三体、18三体均为低风险。


21+3周就诊,考虑高龄因素,建议产前诊断。患者与家属优先选择无创产前DNA检测。当日抽取孕妇外周血10ml送检安诺优达。


NIPT检测结果:胎儿21三体、18三体、13三体均为低风险(图1)。



图1. 高通量基因测序产前检测临床报告单结果


补充报告:dup(12)(p13.33p11.1),提示12号染色体短臂存在31Mb左右的重复(图2)。


图2. NIPT检出12号染色体短臂片段重复结果


超声未见异常,孕24周,征得患者及家属意见进行羊水穿刺进一步诊断。核型分析结果:46,XN(正常)


同时进行了基因芯片分析,AffymetrixCyoScan750K Array结果显示:arr12p13.33p11.1(173,786-34,835,641)×3,,12号染色体短臂存在34.66M片段重复。


此外,由于分辨率有限,核型分析无法检出一些微小的片段缺失或重复,安诺优达针对报出其他染色体异常的受检孕妇,均免费赠送NGS染色体异常检测,为孕妇提供双重保障。


安诺优达免费进行的NGS羊水染色体异常检测结果显示12号染色体12p13.33-12p11.11存在34.75M的片段重复(图3)。

图3. 羊水NGS检出12号染色体短臂片段重复结果


NIPT血浆检测结果与胎儿羊水的芯片及NGS检测结果一致。


案例 2


赵某,36岁,女,末次月经2015.11.22,G2P1,自然受孕单胎,孕15+4周就诊,鉴于高龄因素,孕妇及其家属要求进行无创产前DNA检测。当日抽取孕妇外周血10ml送检安诺优达。


NIPT检测结果:胎儿21三体、18三体、13三体均为低风险。



4. 高通量基因测序产前检测临床报告单结果


补充报告:del(3)(q27.3q26.33),提示3号染色体长臂存在4Mb左右的缺失(图5)。



5. NIPT检出3号染色体长臂片段缺失结果


22周系统B超显示胎儿食道闭锁,且胎儿眼眶横切面均显示胎儿右侧眼眶较小,内可见晶状体回声。征得患者及家属意见在23周时进行羊水穿刺进一步诊断。


核型分析结果:46,XN。


6. 核型分析结果



图7. 羊水NGS检出3号染色体长臂片段缺失结果


安诺优达同步提取羊水基因组DNA,进行NGS检测,结果显示该样本在3q26.33-3q27.3存在7.4Mb(GRCh37:Chr3:179160005-186560004)缺失,缺失片段与小眼畸形综合征3(Microphthalmia syndromic 3)有关,羊水NGS检测结果与NIPT检测结果一致,均显示缺失片段与小眼畸形综合征3有关。


结论


1
扩大检测范围是NIPT下一个临床转化的热点


作为NGS领域最成功的临床转化应用,NIPT凭借其精准的检测结果已被广泛应用于21三体、18三体、13三体综合征的检测。全基因组覆盖、低检测成本以及非侵入性取样,使得检测染色体微缺失/微重复等亚染色体水平的结构异常成为NIPT临床转化的下一个热点。时隔三年,国际产前诊断协会(ISPD)于去年对NIPT最新临床指南进行了突破式的更新,明确指出NIPT可以针对已研究清楚的染色体微缺失/微重复综合征进行检测。此外,欧洲人类遗传协会(ESHG)和美国人类遗传学协会(ASHG)联合制定了NIPT责任建议书,并发表于《欧洲人类遗传学杂志》。建议书中明确指出,为受检者提供适当的预测信息及非指导性的咨询应作为NIPT筛查的一部分,其中,预测信息便包括NIPT所发现的其他染色体异常信息。这也预示着,NIPT即将迎来亚染色体水平检测新时代。


2
NIPT检测出其他染色体更需要临床的进一步诊断


无创产前DNA检测是一种有效筛查胎儿染色体异常的方法。目前,其他染色体异常的检测数据积累尚不足,其检测的灵敏度尚未得到大规模的临床样本验证,因此其结果更需要结合其他临床信息,进一步诊断。



安诺优达旨在为孕妇提供更优质服务


安诺优达作为国家卫计委首批高通量测序临床应用试点单位,是国内最早进入NIPT领域的企业之一,致力于为大众提供更优质的生育健康服务。


目前,安诺优达已对现有无创产前DNA检测进行全面升级,为临床医生呈现更多的检测信息,覆盖更广的疾病范围,有效提高临床对出生缺陷的检出能力。同时,考虑到传统核型分析分辨率的局限性,安诺优达将为检测出其他染色体异常的受检孕妇免费赠送NGS染色体异常检测(全面覆盖23对染色体非整倍性异常以及0.1Mb以上的片段缺失或重复突变,同时可检测低至5%的嵌合体),为孕妇提供双重保障。



安诺优达

总部位于北京,是中国基因组行业的知名企业,国家发改委首批基因检测技术应用示范中心、国家卫计委首批高通量测序临床应用试点单位、国家高新技术企业、北京市发改委“精准医疗与基因工程北京市工程实验室”、中关村高新技术企业,拥有博士后科研工作站。

公司专注于新一代基因组学技术在人类医学健康和生命科学研究两大领域的产业化应用,建立了领先的高通量测序平台和高性能计算平台,并先后和美国illumina公司及阿里云达成战略合作,形成了强大的Bio-IT 基础和产业化服务能力。



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