“乙肝病毒cccDNA”的全称是“乙肝病毒共价闭合环状DNA”，是乙肝病毒前基因组RNA复制的原始合成模板，是乙肝病毒持续感染的关键因素，也是乙肝病毒复制的“发动机”。
乙肝病毒cccDNA是乙肝病毒复制最特异的指标，其灵敏性和准确性都要超过目前常用的乙肝病毒DNA检测。要想真正了解乙肝病毒复制情况、传染性和抗病毒治疗的效果，最为权威的指标应该是乙肝病毒cccDNA，也就是说乙肝治疗只有清除了细胞核内的cccDNA，才能彻底消除乙肝患者病毒携带状态。
1、评价抗乙肝病毒药物的疗效
目前临床上评价干扰素、核苷类似物这些抗乙肝病毒药物的疗效，主要依靠检测乙肝病毒e抗原和乙肝病毒DNA水平高低、肝功能变化情况以及肝组织的病理学改变等；但对于乙肝患者何时停用抗病毒药物、停用抗病毒药物后乙肝病毒是否会重新复制活跃导致乙肝复发，可通过开展外周血及肝细胞内乙肝病毒cccDNA的动态定量检测可以知道。从一定意义上说，只有能够彻底清除乙肝病毒cccDNA的药物，才能算是真正“有效”的抗病毒药物。
2、评价乙肝病毒是否能感染肝外组织
一些肝外组织中也能检测到乙肝病毒DNA，如肾脏、胰腺以及外周血单个细胞等。通过对人体其组织器官的cccDNA的检测，可以了解到肝外组织乙肝病毒感染情况。
3、评价乙肝患者病情和传染性大小
临床研究发现，70%以上中度或重度乙肝患者血清cccDNA都呈阳性，说明乙肝患者病情轻重和乙肝病毒复制的强弱有一定关系。从理论上推测，当肝脏组织处于炎症活动阶段时，存在于肝细胞核内的cccDNA分子在肝细胞变性、坏死时应该也可以释放到血液中，而且病情越严重、变性坏死的细胞数越多，对于同一患者而言，在某一时间段内，其血液中的cccDNA水平也应该相应的越高。
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