丁苯酞软胶囊长期吃有头痛头晕、肝肾功能损害等副作用。由于丁苯酞软胶囊是营养脑细胞、改善线粒体功能的药物，因此部分患者会出现头痛、头晕的症状。由于丁苯酞软胶囊通过胃吸收，由肝脏进行分解并在肾脏排泄，因此如果患者超剂量服用丁苯酞软胶囊，可能会出现转氨酶升高、食欲不振的副作用。如果患者出现此类副作用，需要将丁苯酞软胶囊的用量减少或停用一段时间，并且使用保护肝肾功能的药物，此类症状通常可以得到逆转。