现如今,生物信息分析的入门门槛并不高。不懂编程、不会算法或是不了解统计都没有关系,越来越多的便捷在线工具帮助了许多想利用计算机进行生物信息分析的生物学、医学的研究人员进行数据整理、可视化及数据分析。以下生信技能树各位版主对生物信息常用的在线软件进行了收集整理,在此向辛勤工作的人儿们撒花表示感谢!
根据染色体起始终止点坐标来获取碱基序列http://www.bio-info-trainee.com/1049.html
热图http://sebastianraschka.com/Articles/heatmaps_in_r.html
热图http://www.chibi.ubc.ca/matrix2png/
韦恩图http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html
基因预测http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=fgenesh&group=programs&subgroup=gfind
phylogenetichttp://itol.embl.de/index.shtml
启动子区预测http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
蛋白质一级结构分析https://www.predictprotein.org/home
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蛋白质亚细胞定位http://psort.hgc.jp/form2.html
蛋白质二级结构分析https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html
蛋白质三级结构预测http://swissmodel.expasy.org/interactive
短序列拼接http://doua.prabi.fr/software/cap3
多序列比对相似性展示http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php
绘制GO注释结果http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl
蛋白质domainhttp://pfam.xfam.org/
基因组杂合性评估http://qb.cshl.edu/genomescope/analysis.php?code=example2
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序列比对musclehttp://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#
富集分析http://bioinfo.vanderbilt.edu/webgestalt/login.php
富集分析http://amp.pharm.mssm.edu/Enrichr/
DNA序列过滤器http://www.bio-soft.net/sms/filter_dna.html
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在线DNA和蛋白序列处理工具集http://www.biotrainee.com/thread-363-1-1.html
annovar对snp位点注释http://wannovar.wglab.org/
Mutation-Assessor对突变位点对基因或者蛋白功能的影响http://www.bio-info-trainee.com/1270.html
MutationMapper来查看基因突变的分布http://www.bio-info-trainee.com/1270.html
GO分析https://david.ncifcrf.gov/tools.jsp
构建进化树http://www.atgc-montpellier.fr/phyml/
格式转换器http://sequenceconversion.bugaco.com/converter/biology/sequences/fasta_to_phylip.php
GenBank文件特征序列提取器 http://www.bio-soft.net/sms/feat_extract.html
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CpG岛 http://www.bio-soft.net/sms/cpg_island.html
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DNA统计 http://www.bio-soft.net/sms/dna_stats.html
ORF查找器 http://www.bio-soft.net/sms/orf_find.html
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限制位点概要 http://www.bio-soft.net/sms/rest_sum.html
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测试编码 http://www.bio-soft.net/sms/testcode.html
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三到一:三字母编码的蛋白序列转换为单字母编码氨基酸的蛋白序列http://www.bio-soft.net/sms/threeToOne.html
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蛋白序列统计 http://www.bio-soft.net/sms/protein_stats.html
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GO分析https://david.ncifcrf.gov/tools.jsp
构建进化树http://www.atgc-montpellier.fr/phyml/
格式转换器http://sequenceconversion.bugaco.com/converter/biology/sequences/fasta_to_phylip.php