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随着监管层的行动和新三板挂牌企业不断的信息披露，挂牌企业资金占用问题愈演愈烈。
对于很多新三板企业的实际控制人或者老板来说，完全没有适应公司由非公众公司到公众公司的转变，还以为和此前一样，认为公司的钱就是老板自己的钱。
对此，安信证券新三板首席分析师诸海滨也指出：“新三板上挂牌的企业大多数是小微企业，受经济波动影响大，他们有挪用的需求，甚至在挂牌之前很多企业都习惯性地挪用资金。另外，企业的工作人员整体素质不高，他们对新三板的规则并不了解，也没有经过严格的培训，有些企业的财务人员甚至董事长都不懂法。”
梳理资金占用的案例时也发现，占用资金的对象往往为“自家人”，涉及公司实际控制人及其家庭成员、公司高管等。
事实上，一些市场人士也认为造成新三板挂牌企业资金占用频发的一个主要原因便是新三板挂牌企业的股权集中度过高。
那么，新三板挂牌企业大股东及关联方占用挂牌企业的资金究竟用在了哪些地方呢?
根据2015年年报季企业反馈的情况来看，新三板企业资金占用的问题大体上有四种，分别是：挂牌公司垫付工资、福利、保险、广告等费用和其他支出;挂牌公司有偿或者无偿、直接或者间接将资金拆借给大股东及其关联方以及董监高。
还有一种情形是，挂牌公司偿还债务，为控股股东、实际控制人及其附属企业承担担保而形成的债权。这种情况在近期的案例中不少见，其中中成新星(831610)的控股股东便占用了公司的资金还贷。
如今，监管层加大了对资金占用的监管力度，但中信证券分公司一位新三板项目承做的负责人却表示：“未来，大股东占用资金的方式及渠道可能会出现新的变化，资金占用的方式也会更加隐秘，与之相应的是，资金占用的渠道也会此消彼长。”
该人士进一步指出：“由于股转系统加大了监管力度，一些挂牌公司的大股东部分或全部归还了由其本身直接占用的款项，特别是在‘其他应收款，’科目下的款项，以逃避监管部门的监管与社会公众的监督。未来可能会通过其他关联方占用的款项，特别是通过与挂牌公司有直接的上下游产业链关系的关联方，以预付账款方式占用的资金可能会有增加的趋势，形成一种此消彼长的态势。”
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