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2019年美国血液学年会——基因治疗及其进展
1909年,丹麦植物学家Wilhelm Johannsen为遗传单位创造了一个特殊的名词,起初叫“泛生子-Pangene”,后为避免歧义改为“基因-Gene”。

人类对遗传单位的认识在上世纪中叶得到迅猛发展,1941年艾佛里证明了DNA是遗传信息的携带者,1953年沃森/克里克共同发现DNA双螺旋结构,1968-1973年伯格等重组DNA技术,1960年代Howard Martin Temin发现基因突变可以通过病毒感染发生遗传,1970-1980年代基因克隆和扩增技术问世。
迭代的科学发展,为上世纪90年代基因治疗大爆发奠定了基础。然而,1999年杰西.基辛格死于基因治疗,以及同时期临床研究中的继发白血病问题,使基因治疗一度跌入谷底。痛定思痛,从科学再出发,至目前为止,全球大约已批准14个基因治疗的产品。
其中,西方批准的第一个基因治疗产品是Glybera治疗脂蛋白脂酶缺乏,可惜的是从2012年EMA获批直到2017年,仅一例患者使用。然而,随着CAR-T等产品被陆续批准,基因治疗王者归来,并被2017年《麻省理工科技评论》评为年度全球十大突破性技术。
基因治疗将为认为提供一种前所未有的治疗手段,目前全球有超过4000项基因治疗临床项目在研,可以预计的是,未来10-20年内基因治疗一定会成为疾病的主要手段之一。

基因治疗,是指把外源性的遗传物质转移到体内,修复异常基因达到治疗疾病的作用。因此,基因治疗需要:1.选择合适的靶细胞;2. 合成核酸;3. 采用何种方式转移。
从目前情况看,靶细胞应选择体细胞(生殖细胞有伦理风险),通过病毒作为载体,携带遗传信息通过:1)体外方式转移到患者自身干细胞中(左图),或,2)直接注射长寿细胞(右图)。
举例说明,取患者外周血干细胞扩增,选择合适的病毒作为载体,把目标基因(核酸)转入患者干细胞中(具有多向分化和再生能力),再回输体内,则可以发挥持久疗效。
除了病毒作为载体,以CRISPR/Casp9和PRIME为代表的基因编辑技术让基因治疗更加精准和高效,且上述技术已开始进入临床阶段。
目前取得重大进展的疾病大多为单基因缺陷病,例如地中海贫血/镰刀样贫血,血友病(很快),脊髓型肌萎缩,ROE65-相关视网膜营养不良,杜氏肌营养不良,ADA-联合免疫缺陷病等。

预计不久的将来有更多的严重危害人类健康的疾病将被攻克,例如通过调节CCR5治愈HIV,纠正I型糖尿病致病基因,通过基因修饰控制甚至治愈绝大多数的恶性肿瘤。
前几天在北京召开的腾讯科学WE大会上,Carl June表示,未来5年内所有血液肿瘤都能被CAR-T细胞疗法治愈。
能否实现不敢妄加评论。那,我们假设可以实现。未来,医生告诉血液肿瘤患者,你如果接受细胞基因治疗,大约70-80%可能被一次性治愈,价格和安全性与现有方案相似。那,现在的一线还是未来的一线么?科学技术的进步可能比我们想象的要快很多。
回到2019年ASH,包括CAR-T在内的基因治疗已经成为绝对的热点,而中美则是主力。
淋巴瘤:
CD19作为淋巴瘤CAR-T治疗的靶点已经验证,疗效安全﹑生产﹑成本都有进一步提高的急迫要求。
Celgene/Juno的JCAR017(LisocabtageneMaraleucel,liso-cel,anti-CD19-CAR-T)公布一项针对难治复发侵袭性淋巴瘤(DLBCL等)的关键临床研究数据(Abstract 241)。Liso-cel在三个剂量水平给药,50×106(DL1),100×106(DL2),150×106(DL3)共评估268例接受治疗的患者(DL1=51,DL2=176,DL3=41)。
255例患者有疗效数据,CR率为53%(95%CI,47-59%),ORR为73%,中位持续时间13.3个月;安全性方面,79%患者出现3级和以上的TEAEs(主要为血细胞减少),47%患者出现CRS(2%为3级及以上)或神经毒性(10%为3级及以上)。CRS大多出现在开始治疗后的5天,神经毒性则为9天。

疗效ORR方面,Liso-cel的数据比Kymriah高20%左右,比Yescarta略好(非头对头研究);而liso-cel最大亮点在于安全性,30%(神经毒性)和2%(3级和以上CRS)相比Yescarta的87%和13%明显降低。特别值得一提的是,25%的患者接受门诊liso-cel治疗,耐受性很好。
Liso-cel的生产周期为24天,需要大幅提高生产效率。
Novartis的CD19-CAR-T产品Kymriah获批用于RR-DLBCL的治疗。在关键JULIET研究中,CAR-T的细胞属性与临床结局是否相关(Abstract 242),分析115例个体化产品属性,中位T细胞转染效率(流式)为28%(5.3-63.2%),细胞属性与疗效和安全性无明显相关,这与个体化决定输入的CAR-T细胞数量有关。
另外,中位CAR CD4 /CD8 比率为3.7(0.26-65.3),与临床疗效无相关性。CAR-T细胞包含T细胞表型的变异性,1. 中心记忆(CM)细胞为主要亚组细胞群;2.CAR-T细胞(共表达HLA-DR和CD38)被活化;3. 未成熟T细胞数量与疗效无关。总体来说,CAR-T产品的属于与临床疗效和神经毒性无明显相关性,而活化CD4 的数量与高级别的CRS可能有关。
Gilead的CD19-CAR-T产品Yescarta在ZUMA-1研究中,治疗RR-DLBCL的≥3级CRS和神经毒性分别为11%和32%。为改善毒性反应,ZUMA研究增加了一组(组4)患者,假设早期使用糖皮质激素可以有效(Abstract 243)。组4共入组41例晚期患者(63%为DLBCL),相比ZUMA-1研究的其他别组,组4中有更多患者早期使用激素和tocilizumab进行预防(73%和76% vs. 27%和43%)。
研究结果,组4发生≥3级CRS和神经毒性有明显下降,分别为2%和17%。疗效等其他指标没有明显差异。
CD19-CAR-T作为DLBCL的治疗靶点,已被多次证明。然而,由于CD19丢失或PDL1的上调等原因,一些原本有效的患者会继发治疗失败。为克服治疗失败这一问题,研究人员尝试双靶点CAR-T靶向CD19和CD22(AUTO3),联合三次PD-1单抗(Pembrolizumab)治疗晚期DLBCL(Abstract 246)。
研究(Abstract 246)入组24例患者,11例已接受治疗(其中7例联合Pem),无AUTO3治疗相关死亡和DLT发生。≥3级AE主要为血细胞减少和消化道症状,27%出现1级CRS,1例出现神经毒性。在这项双靶点CAR-T的临床研究中,安全性良好未发生严重CRS,且高剂量组获得50%(2/4)的CR率,是否可以验证假设需要更多规模的样本和更长时间的随访。
多发性骨髓瘤
BCMA作为骨髓瘤的治疗靶点已被反复验证,存在的问题包括长期疗效和安全性数据,减少复发延长有效时间,优化规范性生产并大幅降低成本。
J&J与南京传奇共同开发的BCMA-CAR-T(JNJ-4528或LCAR-B38M)报道CARTITUDE-1研究结果(Abstract 577),在美国开展的Ib期临床研究,共入组25例RRMM患者,中位年龄61岁,接受中位5轮前期治疗失败,88%患者对PI,IMiD和anti-CD38均失败,中位治疗CAR-T细胞数为0.73x106CAR 细胞/kg。
常见AE包括CRS(88%,其中绝大部分为1-2级,发生1例5级)和血细胞减少。CRS大约发生在输注后中位7天(持续4天),91%和27%发生CRS患者使用Tocilizumab和激素处理。3例患者出现神经毒性(1级=2,3级=1)。

21例患者进行疗效评价,ORR为91%其中包括4例sCR,2例CR,7例VGPR和6例PR。在15例有治疗后骨髓样本的患者中,10例获得10-5水平的MRD阴性,2例10-4水平的MRD阴性。CARTITUDE-1研究与在中国开展的LEGEND-2研究结果基本一致。
与此同时,LEGEND-2研究报道了LCAR-B38M治疗RRMM的长期随访数据(Abstract 579),57例患者接受治疗。CR为74%(42例),其中39例患者获得MRD阴性,疗效与肿瘤细胞基线BCMA的表达水平无关。常见AE包括发热(91%),CRS(90%)和血细胞减少等。在细胞回输4个月时,71%患者外周血中无法检出LCAR-B38M。
BCMA-CAR-T治疗MM复发的主要原因之一是CAR-T细胞在体内的持久性。为提高CAR-T细胞在体内的生存时间,武汉团队(Abstract 582)开发一种全新的BCMA-CAR-T(CT103A),这是一个由慢病毒作为载体,携带全人scFv的CAR信息,CD8a作为hinger。

在一项早期包含16例RRMM患者的研究中,ORR为100%,最快2周内获得治疗反应。而CR103A的开发假设是其体内长寿性,12/16例患者在最后评估时仍可检出(中位随访195天),其中一例患者体内CAR-T已存在超过314天。
为提高疗效,一项来自苏州和南京的CAR-T研究评估CD19-CAR-T和BCMA-CAR-T依次回输策略,治疗28例RRMM的更新数据(Abstract 578)。所有28例患者均为PI和IMiD治疗失败晚期MM患者,ORR为92.6%,其中PR及以上为88.9%(CR或sCR为40.7%,VGPR为29.6%),中位PFS为8个月,OS为16个月。文章提出,如何延长体内CAR-T细胞的寿命值得进一步探索。
双靶点方面,来自中国武汉的(Abstract 930)报道,BCMA-CD38双CAR-T治疗难治RRMM,16例患者接受治疗,中位随访36周,14(87.5%)获得ORR其中8例sCR,2例VGPR,4例PR。14例患者获骨髓MRD,最长sCR持续51周,5/8例sCR患者保持治疗反应,中位PFS未达到。FCM和q-PCR检测患者体内CAR-T细胞数量,获得sCR患者的细胞高峰期在输注后的第二周,比其他患者出现的更早。
CRISPR/Cas9基因编辑新技术的方面,一项包含3例患者的早期研究报道(Abstract49),使用表达NY-ESO-1 TCR,并且使用CRISPR/Cas9基因编辑技术清除TCR和PD-1(NYCET)治疗肉瘤和晚期骨髓瘤患者。

NYCE-T的理论假设前提是,1.NY-ESO-1是一种肿瘤睾丸抗原,在正常细胞中很少表达,主要表达在骨髓瘤细胞,黑色素瘤细胞和肉瘤细胞中。2.清除T细胞的内生性TCR可以增强NY-ESOTCR的表达,去除PD-1可以减少免疫逃逸。
NYCE T治疗了3例患者,耐受性良好,基因编辑的T细胞有向肿瘤定向转移的能力。
急性淋巴细胞白血病(ALL)
CD19-CAR-T治疗ALL已取得稳定的成功,鉴于安全性和可及性问题,目前的CAR-T均作为后期挽救性策略。但我相信,当疗效持久,安全性改善,价格大幅下降,生产效率提高等,不用等多少年CAR-T完全可能作为一线选择。但目前需要解决:如何延长CAR-T在体内的存活时间?如何寻找精准获益群体?如果改善安全性?
CD19-CAR-T治疗难治复发性B细胞ALL可获得80-90%的CR,然而为何少部分患者无效呢?一项分析254例中国患者(5家公司产品)的临床研究报道(Abstract 224),D30天时的CR率为90.6%,基本全部获得MRD阴性。
经多因素分析,以下因素有更高可能不能获得CR:女性﹑骨髓原始细胞>20%﹑TP53阳性﹑CD28共刺激域(vs.4-1BB)﹑轻度神经毒性。原因需要进一步分析。
除了上述难治性患者外,仍有大约50%患者会丢失治疗反应(复发)。复发与CAR-T在体内消失有关,而CAR-T的消失又和基础骨髓中CD19抗原负荷低以及CAR-T回输后聚集有关。

为验证这样的假设,西雅图研究人员使用episodic抗原暴露方式,用CD19t的T细胞作为APC(T-APC)活化CD19-CAR-T,使其在体内保持持久性。PLAT-03研究中(Abstract 223),14例患者接受T-APC治疗,8例存在低CD19抗原负荷,5例存在快速CAR-T聚集现象。T-APCs制作成功率为100%,11例患者接受了回输,绝大部分患者在治疗63天仍然保持CAR-T活性。
在延长CAR-T存活时间方面,一组英国研究人员采用CAR-41BBz CAR(fast off rate),一种新的CAR-T方法,入组17例患者,结果参考下图(Abstract 225)。
非肿瘤疾病的基因治疗
基因治疗,方兴未艾。
值得关注的方面包括:
1.目前市场化的基因治疗全部以病毒作为载体,其中以(人类已知)无致病性的腺相关病毒(AAV)最常用,那么这类病毒在正常群体中的感染率如何?感染后产生的抗体势必对相应病毒载体产生重大影响,20年前基辛格的死亡就是由于抗原抗体反应导致。2.在取得初步成绩的地中海贫血,血友病等单基因疾病中,长期的疗效和安全性怎样?转入的核酸会不会丢失?没有没致癌性?
3.其他单基因疾病有没有突破?
4.基因编辑为代表的基因治疗的情况?
根据这些方面,带大家学习ASH报告。
一项在血友病人群中调查AAV病毒感染情况的研究发现(Abstract 3349),242例患者中194例为重度血友病甲,48例重度血友病乙,AAV不同血清学感染率大约为16-54%(下图)。
另外一项来自南非相似的报道(Abstract 3353),44例血友病乙患者,检测存在的AAV感染情况。其中,AAV2感染率最高达到95%(42/44),其次分别是AAV6(82%),AAV1(77%),AAV5(66%)和AAV8(64%)。

在目前临床研究中,AAV抗体滴度=5为排除标准,依据此标准(cut-off=8),最多只有36%的患者可以接受AAV8为载体的基因治疗,其他血清学则更低。但什么样的滴度是最合适的,还是进一步探讨。
腺相关病毒(AAV)是一种小病毒,免疫反应弱且核酸转移效率高,AAV不会整合进宿主DNA中,可以用于非分裂细胞。AAV只能携带很短的基因片段,因此对VIII基因需要进行处理。AAV的上述特点使其非常适合作为基因治疗的载体,常用的血清学包括AAV1,2,5,6,8,9,10等(2,5,8最为常用)。
基于此,上述血友病人群普查为基因治疗提出新的挑战。接近一半的患者有AAV感染,临床研究可以排除(排除的抗体浓度?),但临床治疗上,我们如何选择适合他们的病毒载体?
长期疗效和安全性随访研究中,小蓝鸟的LentiGlobin治疗β-地中海贫血的长期数据公布(Abstract 4628)。
LentiGlobin在今年被EMA批准,使用慢病毒作为载体,把正常β球蛋白基因在体外转入患者自体CD34 细胞。支持获批的22例受试者(2个临床研究),12/13例非β0/ β0基因型不用输血,其他患者均取得很好的临床获益,中位随访大约2年。

而LentiGlobin在欧洲开价177万美元,分5年付款,LentiGlobin也被选为5年内最能赚钱的基因产品。
在此项长达4.5年的随访数据中,患者的各项指标没有发生明显改变,疗效仍然持续。
Spark公司是基因治疗领域又一大牛,其产品SPK-8011治疗血友病甲正处于临床II期。Spark报告了一项实验狗的长达10年的随访数据(Abstract 611)。在治疗10年后,狗的FVIII水平为2.7% (F24), 7.1%(Woodstock),4.5% (J60),11.3%(Linus) and 2.5% (H19),9.4% (M06),10.3%(M50),1.9% (L51),3.7% (M66)。

FVIII水平维持在5%附近可以防止绝大部分严重出血。本研究发现存在AAV拷贝数扩增(VCN)和整合(IE)情况,尽管未发生临床继发肿瘤,但需要注意AAV引起潜在的基因毒性。
SPK-9001是一种AAV作为载体,携带FIX基因肝脏定向增强活化的基因治疗。在一项临床I/IIa研究中(Abstract 3347),15例血友病乙受试者接受fidanacogene elaparvovec剂量为5x1011vg/kg治疗,随访1年。3/15患者出现肝功能异常使用激素治疗。平均FIX水平为22.9%±9.9%,52周平均年出血率为0.4±1.1 vs. 8.9±15(P<0.001),其中12/15例患者无出血报告。
UniQure在Glybera市场化失败后转到其他领域,在一项临床2b研究中(Abstract 3348),评估AMT-061(AAV5-Padua hFIX variant)治疗3例中重度血友病乙患者,首要终点为治疗后第6周FIX水平。

入组前三例FIX均低于1%且需要定期预防性治疗,单次基因治疗后,FIX水平快速提高,见下图。研究支持进入临床三期。
开拓新的病种方面。

戈谢病是一种常染色体隐性遗传的溶酶体贮积病,由于GBA基因缺陷导致GCase酶缺乏导致,是基因治疗的潜在目标疾病。在一项体外和动物研究中(Abstract 3354),采用靶向肝脏的AAV8作为载体,携带野生型GCase核酸转入。

Wiskott-Aldrich综合征是罕见性X连锁遗传性疾病,见于男性儿童,临床表现为免疫缺陷,湿疹,感染,血小板膜骨架异常,淋巴瘤等。相比异基因造血干细胞移植,采用自体CD34造血干细胞加以基因修改既可以克服GVHD又可以解决供者问题。

在一项临床I/II期研究中(Abstract 4629),入组5例患者基因治疗,中位随访4.8年,所有患者的酶水平均明显提高,临床表现明显改善。

新技术方面,拜耳开发的BAY2599023(AAVhu37 FVIII)以AAV血清学hu37作为载体,定向肝细胞增强子/启动子治疗重度血友病甲。这是首次进入人体研究(Abstract 4630),2例受试者接受治疗AAVhu37的一次性治疗剂量为0.5x1013GC/kg。随访超过15周,无SAE报告,无明显毒性反应,未使用激素,两例患者的FVIII水平迅速提高到5%和17%。

基因治疗提供一次性治愈的可能,对人类遗传信息的精准修改会很大程度地改变目前的疾病治疗模式,甚至是颠覆式改变,而首当其中是单基因遗传病和血液肿瘤。

2030年,医生告知诊断为淋巴细胞白血病,骨髓瘤或者淋巴瘤的患者,你可以选择基因/细胞治疗,大约70-80%可能一次治愈,价格则不同于药物定价而是根据服务来定价,由多方支付。不用担心,一旦失败,你还有那么多10年前的创新药或者更新的细胞疗法。
然而,基因治疗才刚刚开始。非常有限的人群,高昂的研发费用,个体化的治疗流程,以及纷繁复杂的竞争市场,使基因/细胞疗法的定价极为昂贵。政府监管尚不清晰,FDA双重监管体系(NIH和FDA),EMA则仍然维持几十年前的担忧导致基因治疗需要环境部门审批,中国的监管则是独立的双规制。

基因治疗的疗效是否持久尚不能明确,无论转入长寿细胞亦或是干细胞中,到底能够维持多久?病毒作为载体仍然有潜在的基因毒性,长期会不会导致其他疾病发生率增加,特别是癌症?什么样的商业模式可以支持基因产品,按服务收费还是药物收费,如何操作?

但无论如何,历史的趋势一旦形成便不会轻易改变,拭目以待。
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