第二类假说：我们无法察觉它们的存在
赞成这一类解释的人们认为，智慧生命在宇宙中确实普遍存在，但是我们无法察觉它们。
它们一直在呼喊，但我们没有听见
持这种观点的人很多，其实也很容易理解。几千年前，我们用烽火和信鸽传递消息，而现在可以用无线电与几百亿公里以外的太空探测器通信。因此，比我们先进上亿年的外星文明很可能采用我们无法理解或无法掌握的方式向宇宙呼喊。而我们现在只是在倾听来自太空的无线电信号。
然而这种观点有明显的弱点。即使一个外星文明掌握了先进的通信方式，它们也应该能够想到采用低级的无线电方式呼叫落后的文明，除非它们对我们这样的低等文明不屑一顾。其实，有问题的不是传送信息的媒介，而是我们对传送方式的设想。SETI（Search for Extraterrestrial Intelligence）假设外星文明会采用全方位广播的方式向每个方向同时发送无线电信号，但是这样的方式需要的能量太大了。无线电波在太空中传送的衰减非常快，要用广播的方式在星系内找到伙伴，需要的能量远远超过了一颗中型恒星的能量输出。即使对于一个拥有整个恒星能量可以挥霍的 II 型文明来说，这也是难以承受的。
经济和能耗是采用无线电呼叫不能回避的问题。有鉴于此，物理学家 James Benford 和 George Benford 提出了基于灯塔机制的方案。
与广播方式不同的是，灯塔只向一个方向发送信号，所以它需要的能量就大大降低了。采用这种呼叫方式的外星文明可以把灯塔对准可能有文明存在的恒星，用高功率发送信号，然后再把灯塔转向下一颗恒星，如此反复。事实上，人类向太空发送的几次无线电信号所采用的都是定向方式。另外，激光比无线电定向性更好，也可以用来传送灯塔信号。
这并不意味着今天的人类可以用这样的方式呼叫星系内的文明。它需要的能量是我们这样连行星能量都无法充分利用的准 I 型文明所无法承担的，但是对于 II 型文明来说就不是问题了。
灯塔信号的目的是为了告诉其他文明：「嗨，我在这里。」 在灯塔信号的后面，它们可以选择用较低的功率传送更多的信息。如果我们被灯塔信号勾起了好奇心，就可以把大量的射电望远镜指向这个方向，用更高的精确度和更长的时间去搜索后面的消息。
灯塔机制也只是一种设想，但是它显然比满天空地扫描，寻找广播信号要靠谱一些，是一种值得尝试的方式。1977 年由俄亥俄州立大学的大耳朵望远镜收到的「Wow！」信号可能就是这样一种灯塔信号。
虽然 Wow！信号的来源一直未能确认，但人们仍然把它当做外星文明信号的最佳候选者。在之后的几十年时间内，对同一片天空的观察进行过很多次，都没有接收到相同的信号。如果这是一个灯塔信号，它朝一个方向发射的时间非常短，短时间的观察能够再次遇上的概率很低。SETI 也没有对这一片天空引起足够的重视，它每年对这个方向监听的时间只有几个小时
James Benford 建议 SETI 修改监听策略，提高接收到灯塔信号的机会。他建议，把大量射电望远镜指向银河系中心恒星密度最大的方向，因为这个方向能够接收到灯塔信号的概率最大。同时，也应该把一些望远镜指向相反的（银河系边缘）方向，以便能够接收到回应的信号。
也许，外星文明一直在用我们能够理解的方式朝我们呼喊，只是我们听错了方向。
我们探索的时间太短了
这种解释的前提是：星际文明虽然存在，但是寿命都不太长。
在宇宙的生命像一条平静流淌的大河，偶尔会蹦出一朵小小的浪花，也就是先进的星际文明。它们会试图向太空发射信号，呼唤其他文明，然后悄悄地消失了。 随之而来的是更长时间的静默，直到下一个星际文明出现。人类试图从太空中获得外星文明的无线电信号只有短短几十年时间。如果这种解释成立的话，我们在这段时间内碰巧遇上银河系内存在星际文明的概率很低。
在众多费米悖论的解释中，这应该算是比较弱的一条。如果一个文明进入了星际时代（比如 II 型文明），它可以迅速把自己扩张到更大的范围内。即使是采用我们可以想象的冯诺依曼探测器，也可以在很短的时间内占领整个星系。有这样大的范围，它对于灭绝性的灾难的抵抗力肯定会大大提高。
另外，即使它们已经灭绝，它们对自己的恒星进行的改造工程应该留下不少痕迹，比如戴森球的残骸。这也是和现在的观察结果相矛盾的。
它们不屑于和我们联系
比人类更先进的外星文明可能不屑于和我们这样的低等文明联系，就像我们从来不会和蚂蚁对话一样。
即使这种傲慢的外星文明确实存在，也肯定不是全部。我们之所以不和蚂蚁对话，是因为蚂蚁根本没有和人类对话的能力。如果蚂蚁能够和人类对话，我想全世界的昆虫学家都会争先恐后地展开这项实验。即使普通人也会孜孜不倦地尝试和身边的动物（如家里的猫狗）交流。
这种交流的困难在外星人和人类之间并不存在。即使外星人不会指望从我们这里学到先进的科技，它们也会对我们独特的生物圈和人类文化感兴趣，就像人类学家们热衷于研究原始部落的习俗一样。好奇心是科学发展必不可少的因素。作为一个先进的星际文明，想必好奇心是不会小的。
它们刻意隐藏自己
这一条不用详细说明了，大家对《三体》中的黑暗森林都不陌生。这个解释认为：星际文明都小心翼翼地隐藏自己，唯恐被黑暗中的猎人发现。或者宇宙中藏匿着一些超级捕食者，它们在太空中搜寻敢于冒头的幼稚文明，找到了以后就毫不犹豫地消灭掉。它就像一个玩打地鼠游戏的小孩，抡着榔头，时刻准备着砸向下一个探出头来的地鼠。
宇宙中可能确实存在这种恶意的星际文明，所以对于我们这样的低等文明来说，贸然向宇宙中发出消息可能招致灭顶之灾。但是，把自己隐藏起来并不是避免攻击的最好办法。以人类今天的科技能力，已经能够在银河系中寻找行星，并且开始用分析行星大气光谱等手段寻找潜在的生命星球。超级文明肯定会有更精确的方法寻找生命星球。当它的目光落到一颗行星上的时候，这颗行星就无法继续隐藏下去了。从长远来看，要在黑暗森林中保护自己，最好的办法是迅速发展，把自己推向 II 型或 III 型文明，增强防御能力，并把自己的文明扩展到宇宙的更大范围。
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