如何用这个TCGA的可视化工具，来随便挖点数据……

今天要给你们讲的这个工具，其实也是二叔能翔的一个肿瘤研究小工具了

，就是：

UALCAN……估计有的童鞋估计没听过，因为之前这个工具发展得并不是特别完善，所以夏老师只介绍过她的一个功能，

就是使用TCGA数据来作生存曲线……

当然UALCAN的功能不止于此，甚至都不止于TCGA，他还能对CPTAC（肿瘤蛋白组学数据库）来进行分析和数据可视化

。能对TCGA上肿瘤的数据库进行类似热图分析

：

当然也可以分析部分基因，

比如输入了基因名：

然后选择TCGA中的肿瘤类型

：

然后就得到这样的结果了

：

上面的按钮可以获得不同的结果示意图

，比如分析分析这几个基因在肿瘤数据库中的热图：

单个基因的表达箱线图

：

或者单个基因在所有肿瘤中的表达趋势

：

甚至是这个基因的甲基化水平

：

可以看出S100P在肿瘤中表达上升，

启动子甲基化降低了……

还能分析分析相关的共表达基因

：

以及TCGA上该基因的生存曲线

：

带红框的，就是在这个TCGA肿瘤的数据库中

，该基因高表达，选择之后，

就能看生存曲线了：

对于肿瘤研究，特别是经费紧张的课题组

，用这个挖几个数据出来，是比较简单的，毕竟已有的TCGA数据库中挖掘的到的基因

，就省得自己来作芯片或者二代测序来挖数据了

，省了前期的课题投入。

有兴趣就自己去尝试下吧……可以自己去百度上下搜一下，实在不行就回复“公克”（不要在评论区回复

），要么就直接星球上见（当然，进不去也无所谓

）。好吧，今天就先给你们策到这里吧，祝你们心明

眼亮

。