用于疾病的诊断
由于疾病的发生发展变化的内在原因在于阴阳失调，所以任何疾病，尽管它的临床表现错综复杂，千变万化，但都可用阴或阳来加以概括说明。故曰： “善诊者，察色按脉，先别阴阳。”(《素问·阴阳应象大论》)
在辨证方面，虽有阴、阳、表、里、寒、热、虚、实八纲，但八纲中又以阴阳作为总纲，表、实、热属阳；里、虚、寒属阴。八纲就是以阴阳作为总纲的。在临床辨证中，首先要分清阴阳，才能抓住疾病的本质，做到执简驭繁。阴阳，大则可以概括整个病证是属阴证、属阳证，小则可分析四诊中一个具体脉症。如：
色泽的阴阳：从色泽的明暗，可以辨别病情的阴阳属性。色泽鲜明为病属于阳，色泽晦暗为病属于阴。
声息的阴阳：观察呼吸气息的动态，听其发出的声音，可以区别病情的阴阳属性。语声高亢宏亮，多言而躁动者，多属实、属热，为阳；语声低微无力，少言而沉静者，多属虚、属寒，为阴。呼吸微弱，多属于阴证；呼吸有力，声高气粗，多属于阳证。
脉象分阴阳：以部位分，则寸为阳，尺为阴；以脉动过程分，则至(起)者为阳，去(伏)者为阴；以至数分，则数者为阳，迟者为阴；以形态分，则浮大洪滑为阳，沉小细涩为阴。故《素问·脉要精微论》说：“微妙在脉，不可不察，察之有纪，从阴阳始。”
总之，无论望、闻、问、切四诊，都应以分别阴阳为首务，只有掌握住阴阳的属性，才能在辨证中正确地区别阴阳。所以说：“凡诊病施治，必须先审阴阳，乃为医道之纲领，阴阳无谬，治焉有差? 医道虽繁，而可以一言蔽之者，曰阴阳而已。故证有阴阳，脉有阴阳，药有阴阳……设能明彻阴阳，则医理虽玄，思过半矣。”(《景岳全书·传忠录》)
用于疾病的治疗
由于疾病发生发展的根本原因是阴阳失调，因此，调整阴阳，补其不足，泻其有余，恢复阴阳的相对平衡，就是治疗的基本原则。故曰“谨察阴阳所在而调之，以平为期”。(《素问·至真要大论》)阴阳学说用以指导疾病的治疗，一是确定治疗原则，二是归纳药物的性能。
(1)确定治疗原则 阳阳偏胜的治疗原则：阴阳偏胜，即阴或阳的一方偏盛，为有余之证。由于阳胜则阴病，阳胜则热，阳热盛易于损伤阴液。阴胜则阳病，阴胜则寒，阴寒盛易于损伤阳气。故在调整阴阳的偏胜时，应注意有无相应的阴或阳偏衰的情况存在。若阴或阳偏胜而其相对的一方并没有构成虚损时，即可采用“损其有余”的方法。若其相对一方有偏衰时，则当兼顾其不足，配合以扶阳或益阴之法。阳胜则热属实热证，宜用寒凉药以制其阳，治热以寒，即“热者寒之”。阴胜则寒属寒实证，宜用温热药以制其阴，治寒以热，即“寒者热之”。因二者均为实证，所以称这种治疗原则为“损其有余”,即“实者泻之”。
阴阳偏衰的治疗原则：阴阳偏衰，即阴或阳的一方不足，或为阴虚，或为阳虚。阴虚不能制阳而致阳亢者，属虚热证，一般不能用寒凉药直折其热，须用“壮水之主，以制阳光”(《素问·至真要大论》王冰注)的方法，即用滋阴壮水之法，以抑制阳亢火盛。《内经》称这种治疗原则为“阳病治阴”(《素问·阴阳应象大论》)若阳虚不能制阴而造成阴盛者，属虚寒证，不宜用辛温发散药以散阴寒，须用“益火之源，以消阴翳”(《素问·至真要大论》王冰注)的方法，即用扶阳益火之法，以消退阴盛。《内经》称这种治疗原则为“阴病治阳”(《素问·阴阳应象大论》)。
对阴阳偏衰的治疗，张景岳根据阴阳互根的原理，提出了阴中求阳，阳中求阴的治法，他说：“善补阳者，必于阴中求阳，则阳得阴助而生化无穷；善补阴者，必于阳中求阴，则阴得阳升而泉源不竭”(《景岳全书·新方八阵·补略》)。
总之，治疗的基本原则，是泻其有余，补其不足。阳盛者泻热，阴盛者祛寒；阳虚者扶阳， 阴虚者补阴，以使阴阳偏胜偏衰的异常现象，复归于平衡协调的正常状态。
(2)归纳药物的性能 阴阳用于疾病的治疗，不仅用以确立治疗原则，而且也用来概括 药物的性味功能，作为指导临床用药的依据。治疗疾病，不但要有正确的诊断和确切的治疗 方法，同时还必须熟练地掌握药物的性能。根据治疗方法，选用适宜药物，才能收到良好的 疗效。
药物的性能，一般地说，主要靠它的气(性)、味和升降浮沉来决定，而药物的气、味和升 降浮沉，又皆可用阴阳来归纳说明。
药性：主要是寒、热、温、凉四种药性，又称“四气”。其中寒凉属阴(凉次于寒)，温热属阳 (温次于热)。能减轻或消除热证的药物，一般属于寒性或凉性，如黄芩，桅子等。反之，能减 轻或消除寒证的药物，一般属于温性或热性，如附子、干姜之类。
五味：就是辛、甘、酸、苦、咸五种味。有些药物具有谈味或涩味，所以实际上不止五种。 但是习惯上仍然称为五种。其中辛、甘、谈属阳，酸、苦、咸属阴。《素问·至真要大论》说： “辛甘发散为阳，酸苦涌泄为阴，咸味涌泄为阴，淡味渗泄为阳。”
升降浮沉：升是上升，降是下降，浮为浮散，沉为重镇等作用。大抵具有升阳发表，祛风 散寒、涌吐、开窍等功效的药物，多上行向外，其性升浮，升浮者为阳；而具有泻下、清热、利 尿、重镇安神、潜阳熄风、消导积滞、降逆、收敛等功效的药物，多下行向内，其性皆沉降，沉降 者为阴。
总之，治疗疾病，就是根据病证的阴阳偏胜偏衰情况，确定治疗原则。再结合药物性能 的阴阳属性，选择相应的药物，以纠正由疾病引起的阴阳失调状态，从而达到治愈疾病之目的。
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