对科学有所了解的人都知道，科学都是建立在前提假设之上的。西方科学虽然标榜为科学，但它也是建立在前提假设之上的，这个前提假设就是原子说。它不仅假定了空间的空无一物，而且假定了少数几种死寂不变的基本粒子的存在。按照这个假设，我们只要挖掘出那少数几个基本粒子，自然规律就找到了，实证还原分析方法就是这种假设的一种具体应用，西方科学就是一直沿着这条路发展而来的。
很多人以为中国没有科学体系，其根本原因就在于不了解气一元论。如果说西方科学的前提假设是原子说，那么东方科学的前提假设就是气一元论。按照这个假设，空间中连续着统一的物质（取名为气），它并不是静止不动的，而是在紧张地相互压迫中存在的，反抗周围物质的压迫是一切存在物的本性，也正是这种本性的存在，局部物质才不断在反抗周围物质的压迫中组织起来，成为一个个暂态的有序结构，我们观察到的一切都是由统一物质组织起来的暂态有序结构，而看起来空无一物的空间则是它的无序状态。显然，按照这个前提假设，万物归一气，万物同一理，自然规律不是具体的什么实体粒子，而是同一种物质（气）有序（阴）和无序（阳）变换的原理，阴阳学说就是对这个原理的一种描述。
长期以来，人们不断进行尝试中西医结合，却屡屡失败，原因就是我们都是站在西方科学的前提假设之上对东方科学进行理解，这注定是不可能实现的。让我们看看东西方科学的前提假设有多大的不同！
在对空间的认识上，原子说认为空间是空无一物的，牛顿的绝对时空观就是建立在此基础之上的。而气一元论则认为空间中连续着不对称运动的统一物质。
在对实体的认识上，原子说认为万物都是由少数几种死寂不变的基本粒子组成的。而气一元论则认为万物都是由同一种生命之流（气）汇聚而成的，最初产生环境的不同使它们具有了不同的个性。
在对实体和空间关系的认识上，原子说认为实体和空间没有任何关系。而气一元论则认为空间是统一物质（气）的无序状态（阳），实体是统一物质的有序状态（阴），两者是在不断地相互作用及转化中存在的。
前提假设不同，得出的结论也大相径庭。
在对自然规律的认识上，原子说认为它存在于几个基本粒子的个性之上，只要挖掘出它们，自然规律就找到了。而气一元论则认为，万物分解到最后，都是同一种叫不出名字的东西（气），它告诉不了我们任何答案，真正的自然规律是一个无形无象、无所不在的原理，它不可能用现有科学的手段来认识，认识它的方法只有一个，那就是哲学的思辨，因为人和万物一样，不仅由同一种物质组成，也由同一个原理支配，所以，人存在与发展的原理就是万物存在与发展的原理，认识了自己，也就认识了自然。哲学就是通过认识自我存在与发展的原理来认识万物存在与发展原理的一门学问。
显然，西方科学妄图用少数几种死寂不变的基本粒子的不同组合来解释整个世界，而东方科学则用统一物质（气）有序（阴）和无序（阳）变换的规律来解释自然界的一切。哪一个更科学已经一目了然！
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