最为常见的霉菌：曲霉、青霉、镰刀菌、麦角菌属等。按生活习性分为：仓储性霉菌（曲霉菌和青霉菌）和田间霉菌（青霉菌属、麦角菌属和镰刀菌属）。
1、曲霉属
曲霉菌丝有隔膜，为多细胞霉菌。分生孢子梗顶端膨大成为顶囊，一般呈球形。曲霉属中的大多数仅发现了无性阶段，极少数可形成子囊孢子，故在真菌学中仍归于半知菌类 。
2、黄曲霉
多见于发霉的粮食、粮制品及其它霉腐的有机物上。菌落生长较快，结构疏松，表面灰绿色，背面无色或略呈褐色。 黄曲霉毒素存在于土壤，动植物，各种坚果（如花生，核桃，大豆，稻谷，玉米，通心粉，调味品，牛奶，奶制品，食用油等制品）。一般在热带和亚热带地区,食品中黄曲霉毒素的检出率比较高，在中国（广西地区的产毒黄曲霉最多）产生黄曲霉毒素的产毒菌种主要为黄曲霉，黄曲霉毒素是黄曲霉和寄生曲霉的代谢产物。
3、米曲霉
米曲霉菌落生长快，质地疏松，初白色、黄色，后变为褐色至淡绿褐色。背面无色。分布甚广，主要在粮食、发酵食品、腐败有机物和土壤等处。是我国传统酿造食品酱和酱油的生产菌种。也可生产淀粉酶、蛋白酶、果胶酶和曲酸等。会引起粮食等工农业产品霉变。 米曲霉是一类产复合酶的菌株，除产蛋白酶外，还可产淀粉酶、糖化酶、纤维素酶、植酸酶等。 米曲霉是理想的活性蛋白的载体,能生产大肠杆菌不能表达的真核生物。 米曲霉是常用的发酵菌种。
4、寄生曲霉
分生孢子梗单生，不分枝，末端扩展成具有1-2列小梗的顶囊，小梗上有成串的3.6-6μm球形分生孢子。分生孢子梗长300-700μm，延伸向头状物方向，扩宽到10-14μm。顶囊直径16-25μm。培养物浅黄绿色。子囊阶段不明显。 寄生于多种同翅目，鳞翅目，膜翅目昆虫。感染寄生曲霉的昆虫，体表起初长有白色菌丝，后布满黄绿色菌丝及其孢子。
5、黑曲霉
菌丛呈黑褐色，顶囊大球形，小梗双层，分生孢子为球形，呈黑、黑褐色，平滑或粗糙。对紫外线以及臭氧的耐性强。菌丝发达，多分枝，有多核的多细胞真菌。 广泛分布于土壤、空气和谷物上，可引起食物、谷物和果蔬的霉腐变质。
6、烟曲霉
分生孢子穗圆筒形，呈深浅不同的绿色，分生孢子梗光滑，带绿色；顶囊烧瓶状，仅上半部产生孢子；分生孢子球形，有刺，绿色 。是一种重要的致病菌，也是引起食品腐败的一种真菌。
7、青霉属
青霉属真菌的总称。半知菌类，串珠霉目的一属，例如那个橘子柚子腐烂了绿颜色的，毛霉，黑曲霉。间有性生殖阶段。菌丝为多细胞分枝。无性繁殖时，菌丝发生直立的多细胞分生孢子梗。梗的顶端不膨大，但具有可继续再分的指状分枝，每枝顶端有2-3个瓶状细胞，其上各生一串灰绿色分生孢子。分生孢子脱落后，再适宜的条件下萌发产生新个体。有性繁殖绝无仅有，如有发现，多归于子囊菌纲曲霉科。常见于腐烂的水果、蔬菜、肉食及衣履上，多呈灰绿色。亦能引起柑橘的青霉病。有些种类如点青霉和黄青霉等可提取青霉素，灰黄青霉等可提取灰黄霉素。
8、镰刀菌属
镰刀菌（Fusarium）是土壤中常见的腐生菌，是一种条件致病菌，可以引起侵袭性或局限性感染近年来由镰刀菌引起恶性血液病、骨髓移植、实体器官移植、化疗、严重的烧伤患者等免疫抑制患者的感染逐渐增多，播散性镰刀菌病的预后差，对常用的抗真菌药物敏感性较低。
无性期属于有丝分裂孢子真菌亚门（半知菌）、丝孢纲、丝孢目、瘤座孢科。有性期属于子囊菌亚门、核霉纲、肉座菌目、丛赤壳属、丽赤丛壳属、赤霉属和隐壳霉属，常见的镰刀菌分为12组，30种。
霉菌种类繁多，其中的一些种类是可以引起人类疾病的。由霉菌引起的人类疾病大致可以分为下面几类：
1、感染症：霉菌可以引起人类皮肤、皮下甚至全身的感染。最常见的皮肤性真菌感染症是由皮肤癣菌引起的皮肤癣病。这是一种由接触传染的疾病，致病原只侵犯表浅的角质层。其中，俗称香港脚的足癣和灰指甲的甲癣，都是一般民众所熟悉的例子。全身性的霉菌病与霉菌孢子的吸入有关。霉菌孢子比花粉还小，可进入人的肺部和其它器官，引起全身症状。这一类感染的发生常具有地区性。
2、机缘性感染：引起机缘性感染的微生物通常不使人致病，有的为人体正常菌种的一部份。只有当局部或身体的免疫状态异常，如免疫力下降或出现在异于原来居住部位时，这些微生物才会大量繁殖，成为致病菌。虽然一种引起鹅口疮、慢性黏膜皮肤念珠菌病和女性阴道炎的单细胞真菌—白色念珠菌，被认为是最重要的机缘性感染性真菌，但某些霉菌，如曲霉菌中的Aspergillus fumigatus和白霉菌、酒曲霉菌也会引起机缘性感染。近年来，一些种类的霉菌如镰包菌属、瓶菌属、Acremonium、毛癣菌属中的某些菌也被发现在有免疫抑制剂使用者（如HIV感染者、器官移植者和癌症患者）中成为新的机缘性真菌的趋势。
3、过敏性疾病 某些种类的霉菌可引起人类的气喘等过敏性疾病。这是由于霉菌孢子可达到比花粉更细的小气道所引发的。在台湾，由霉菌过敏原所引起的气喘占全部气喘患者的30％以上，病人主要以年龄较大者为主。室内空气中最常见的青霉菌和曲霉菌的某些种类在其中扮演着重要角色。
4、由霉菌毒素引起的中毒症 某些霉菌可产生毒性很强的毒素，按照它们的组织亲和力可分为五种。如黄曲菌（Aspergillus flavus）产生的黄曲毒素（Aflatoxin）是一种肝脏毒素，由食入被毒素污染的谷物及花生而进入人体，可引起人类的肝癌。麦角毒素则是由Claviceps purpura产生的另一种毒素，由污染的谷粒进入人体，可作用血管及神经。
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